低密度基因芯片论文-程福亮

低密度基因芯片论文-程福亮

导读:本文包含了低密度基因芯片论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:低密度,基因芯片,猪疫病,检测

低密度基因芯片论文文献综述

程福亮[1](2013)在《低密度基因芯片技术在猪疫病检测中的应用》一文中研究指出基因芯片技术是研究生物大分子功能的新技术,具有高通量、灵敏度高,特异性好等特点。它是通过微阵列技术,将高密度DNA片段阵列,通过点样或原位合成法的形式,以一定的顺序或者排列方式使其附着在如玻璃片等固相表面,借助碱基互补杂交原理,进行大量病原基因表达谱分析、检测、分型等。就芯片技术在动物传染性疾病检测中的应用而言,较为成熟的是低密度芯片,它在猪病检测的研究开发方面,取得了很好的成果,同时也暴露出了不少的弊端。文章就低密度基因芯片在猪疫病检测中的应用及其存在的问题和发展前景进行综述。(本文来源于《畜禽业》期刊2013年07期)

周世媛,朱爱荣,薄立伟,谢建生,李静[2](2012)在《低密度基因芯片技术检测人乳头瘤病毒基因型的方法研究》一文中研究指出目的:构建并评价检测人乳头瘤病毒(HPV)基因型的低密度基因芯片方法。方法:将15种高危、5种低危和Cp8304共21种HPV型特异寡核苷酸探针加尾、固定在尼龙膜上,制成低密度基因芯片。以第二代杂交捕获(HC2)法作为检出HPV的金标准,随机选取148例标本,用低密度基因芯片技术进行HPV检出和基因分型,并对检测系统的敏感性、特异性及重复性进行测试,判定基因测序检测芯片的可靠性。结果:148例标本,采用低密度基因芯片与HC2检出的完全符合率是95.95%(Kappa值为0.82),共检出18种HPV基因型。灵敏度、特异性较好,检测系统稳定。结论:低密度基因芯片技术具有敏感、特异、快速、简便、经济等特点,一次检测既能测定HPV感染又能进行HPV基因分型,对临床HPV的筛查、诊治和预后评估具有较大价值。(本文来源于《中国计划生育学杂志》期刊2012年05期)

周萍萍,尤元海,吴永宁,张建中[3](2008)在《转基因大豆低密度基因芯片的检测方法研究》一文中研究指出目的建立Roundup Ready转基因大豆(简称RRS)的基因芯片检测方法,探讨其在转基因大豆检测中的应用。方法根据大豆中所转入的外源基因,选择camv35s启动子、nos终止子和cp4epsps基因,以大豆内源基因lectin基因为内参照基因设计了引物和探针,并制备了核苷酸芯片;通过多重PCR对样品核酸进行扩增和荧光标记后,将PCR产物与芯片杂交,检测大豆样品中所含的外源基因,并评价方法的灵敏度。结果检测转基因含量不同的RRS标准参考物,结果显示:camv35s启动子、nos终止子、外源基因cp4epsps检测灵敏度均可达0.45%。结论本研究所建立的基因芯片检测方法有良好的灵敏度及可重复性,有助于实现转基因大豆的高通量、高灵敏的检测。(本文来源于《中国食品卫生杂志》期刊2008年02期)

程华胜[4](2007)在《基因导流杂交法于低密度基因芯片平台上检测乙肝病毒》一文中研究指出运用基因导流杂交法在低密度基因芯片平台上检测乙肝病毒DNA(HBV DNA)。设计特异性引物,对HBV基因组DNA中的编码HBV多聚酶蛋白的一段序列进行PCR扩增;根据被扩增片段,设计保守的特异性探针,并将该探针固定在杂交膜上,制备低密度基因芯片;使用导流杂交法将上述扩增产物和低密度基因芯片进行杂交,根据显色反应判断被检测样本有无HBV DNA。基因导流杂交法在低密度基因芯片平台上可以方便、快速、准确地检测乙肝病毒。(本文来源于《生物学通报》期刊2007年10期)

张伟,吴时友,尹燕博,张秀美[5](2007)在《狂犬病病毒低密度基因芯片的建立及其与常规检测方法的比较研究》一文中研究指出根据已发表狂犬病病毒(RV)的序列,设计合成扩增高度保守核(N)蛋白片断的引物。通过生物素标记的RT-PCR技术和微量点样技术,将高度保守N蛋白基因片段作为探针点,在硝酸纤维素膜上制成16点阵的低密度诊断基因芯片。提取160份可疑犬的血液,以核酸作模板进行RT-PCR扩增,将其产物分别用琼脂糖凝胶电泳和低密度芯片检测;同时采用蔗糖密度梯度离心和凝胶层析纯化狂犬病病毒作抗原,建立间接ELISA的检测方法。试验结果表明,RV低密度基因芯片的检测率比ELISA方法和RT-PCR方法灵敏度高、特异性强,完全可以作为临床诊断的一种方法。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2007年02期)

丁红军,龚莹岚,邢克礼[6](2006)在《基于MATLAB的低密度基因芯片图像处理》一文中研究指出目的基于MATLAB设计低密度基因芯片图像处理系统,对经过Scan Array扫描系统获得的用cy3和cy5染色的低密度芯片的荧光图像进行处理和样点的网格定位,从中提取样点的荧光强度信息,结合样点的生物学信息,进行定量分析,研究基因表达的规律与功能之间可能存在的联系。方法结合不同的滤波算子,经腐蚀、膨胀等数学形态学运算,可在滤除噪声的同时,校正荧光图像中的缓慢背景变化,提高图像质量。根据芯片阵列的行与列的数目,通过人机交互的半自动网格定位,确定样点区域,进行样点识别。研究了基于边缘检测的图像分割方法,可以有效地分离有价值的弱信号点和背景点或者噪声,进行目标区域识别,提取背景信号。采用中值法计算样点的荧光强度,并确定样点信号。采用完全归一方法进行归一化处理,减少不同图像的荧光强度差异。结果利用该系统对基因芯片图像进行处理,减少了污点、噪声及其他各种因素的影响,提高了图像的质量;确定了样点区域,提取了背景信号和样点信号;对提取的特征数据进行了归一化处理。结论笔者主要研究如何对低密度基因芯片图像进行处理,结果显示,该系统可以基本实现低密度基因芯片图像处理功能,所采用的图像分析方法是可行的,能为以后的生物学分析提供较为准确的数据信息。(本文来源于《生物医学工程与临床》期刊2006年S1期)

丁守怡,闫志勇,宋旭霞,李慧娟,钱冬萌[7](2006)在《低密度基因芯片检测病毒性STDs病原体方法的建立》一文中研究指出目的采用聚合酶链反应(PCR)结合反向杂交技术建立检测常见病毒性性病病原体的低密度基因芯片。方法将H IV-1,HSV-2,HPV6,HPV11的特异性寡核苷酸探针加尾并以一定阵列固定在尼龙膜上,经过处理后制成低密度芯片。在扩增过程中用B iotin-16-dUTP标记扩增产物,产物变性后分别与点有各种探针的尼龙膜反向杂交,杂交结果采用链霉亲和素-碱性磷酸酶(SP-AP)显色系统检测,并对检测体系的敏感性和特异性进行了测试。结果4种探针只与其对应的DNA杂交,而不和其他病毒杂交。敏感性试验可检出20 fg的病毒DNA。结论低密度基因芯片具有特异、敏感、快速等优点,采用低密度基因芯片一次杂交就可同时筛选鉴定多种性传播疾病(STD s)病毒的感染,值得临床推广应用。(本文来源于《中国皮肤性病学杂志》期刊2006年07期)

王敏,王方金,吴健,王伟毅,何蕴韶[8](2006)在《低密度基因芯片技术检测人乳头瘤病毒基因型》一文中研究指出【目的】利用低密度基因芯片方法对人乳头瘤病毒(HPV)进行分型检测,建立一种经济实用的临床HPV感染的基因型检测方法。【方法】利用低密度基因芯片方法对145例阴道镜门诊病人的宫颈拭子标本进行HPV-DNA检测并分型。【结果】被检人群中共检测出57例HPV阳性,88例HPV阴性,HPV的感染率为39.3%,阳性标本中检测出12种高危型别,2种低危型别。其中单型感染51例(89%),混合感染6例(11%),16,31,18,58型检出率较高。【结论】低密度基因芯片是一种快速、简便、特异性强、灵敏度高的检测方法,在HPV和宫颈癌的筛查与诊断中有很大的应用价值。(本文来源于《中山大学学报(医学科学版)》期刊2006年04期)

高淑霞,吴时友,庄文忠,尹燕博,牛钟相[9](2006)在《猪病毒性繁殖障碍病低密度基因芯片诊断方法的建立》一文中研究指出应用PCR(或RT-PCR)分别扩增猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒、猪伪狂犬病病毒、猪细小病毒、猪圆环病毒-2型、日本乙型脑炎病毒和猪瘟病毒的一段保守序列,克隆到pMD 18-T Simple Vector构建重组质粒,用于制备各病毒的探针。将各探针按一定的阵列点加到硝酸纤维素膜上并加以固定,制备成低密度检测基因芯片。在多重PCR扩增过程中用生物素标记的dUTP(Bio-11-dUTP)对待检样品进行标记,扩增产物与芯片杂交,用扫描仪对杂交结果进行扫描分析。经对68份样品检测结果证明,该方法可以同时检测待检样品中上述6种病毒核酸的存在情况,与PCR方法相比,显示了较高的灵敏度。该方法的建立,为大批量快速诊断、普查猪病毒性繁殖障碍疫病提供了保证。(本文来源于《西北农业学报》期刊2006年04期)

丁红军,龚莹岚,邢克礼[10](2006)在《基于MATLAB的低密度基因芯片图像处理》一文中研究指出目的基于 MATLAB 设计低密度基因芯片图像处理系统,对经过 Scan Array 扫描系统获得的用 cy3和 cy5染色的低密度芯片的荧光图像进行处理和样点的网格定位,从中提取样点的荧光强度信息,结合样点的生物学信息,进行定量分析,研究基因表达的规律与功能之间可能存在的联系。(本文来源于《天津市生物医学工程学会2006年学术年会论文摘要集》期刊2006-06-30)

低密度基因芯片论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的:构建并评价检测人乳头瘤病毒(HPV)基因型的低密度基因芯片方法。方法:将15种高危、5种低危和Cp8304共21种HPV型特异寡核苷酸探针加尾、固定在尼龙膜上,制成低密度基因芯片。以第二代杂交捕获(HC2)法作为检出HPV的金标准,随机选取148例标本,用低密度基因芯片技术进行HPV检出和基因分型,并对检测系统的敏感性、特异性及重复性进行测试,判定基因测序检测芯片的可靠性。结果:148例标本,采用低密度基因芯片与HC2检出的完全符合率是95.95%(Kappa值为0.82),共检出18种HPV基因型。灵敏度、特异性较好,检测系统稳定。结论:低密度基因芯片技术具有敏感、特异、快速、简便、经济等特点,一次检测既能测定HPV感染又能进行HPV基因分型,对临床HPV的筛查、诊治和预后评估具有较大价值。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

低密度基因芯片论文参考文献

[1].程福亮.低密度基因芯片技术在猪疫病检测中的应用[J].畜禽业.2013

[2].周世媛,朱爱荣,薄立伟,谢建生,李静.低密度基因芯片技术检测人乳头瘤病毒基因型的方法研究[J].中国计划生育学杂志.2012

[3].周萍萍,尤元海,吴永宁,张建中.转基因大豆低密度基因芯片的检测方法研究[J].中国食品卫生杂志.2008

[4].程华胜.基因导流杂交法于低密度基因芯片平台上检测乙肝病毒[J].生物学通报.2007

[5].张伟,吴时友,尹燕博,张秀美.狂犬病病毒低密度基因芯片的建立及其与常规检测方法的比较研究[J].江苏农业科学.2007

[6].丁红军,龚莹岚,邢克礼.基于MATLAB的低密度基因芯片图像处理[J].生物医学工程与临床.2006

[7].丁守怡,闫志勇,宋旭霞,李慧娟,钱冬萌.低密度基因芯片检测病毒性STDs病原体方法的建立[J].中国皮肤性病学杂志.2006

[8].王敏,王方金,吴健,王伟毅,何蕴韶.低密度基因芯片技术检测人乳头瘤病毒基因型[J].中山大学学报(医学科学版).2006

[9].高淑霞,吴时友,庄文忠,尹燕博,牛钟相.猪病毒性繁殖障碍病低密度基因芯片诊断方法的建立[J].西北农业学报.2006

[10].丁红军,龚莹岚,邢克礼.基于MATLAB的低密度基因芯片图像处理[C].天津市生物医学工程学会2006年学术年会论文摘要集.2006

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