基于图像融合理论的人脑神经解剖形态的三维可视化研究

基于图像融合理论的人脑神经解剖形态的三维可视化研究

论文题目: 基于图像融合理论的人脑神经解剖形态的三维可视化研究

论文类型: 博士论文

论文专业: 人体解剖与组织胚胎学

作者: 李林

导师: 左焕琛,宋志坚,周国民,李文生

关键词: 配准,融合,最大互信息,三维重建,尾状核,豆状核,丘脑

文献来源: 复旦大学

发表年度: 2005

论文摘要: 背景:脑是人体结构最为复杂的器官,准确、清晰地了解与掌握其内部各种神经结构的形态信息是对相关疾病进行诊断和治疗的重要基础。必须对脑内结构的空间形态和位置进行详细而科学的研究。过去在临床上人们一般通过CT、MRI等影像设备获取脑部的二维断面,医生根据二维图像来想象各个神经结构的空间关系,随着计算机技术的发展,计算机辅助三维重建被广泛应用于医学领域,人们开始用CT、MRI等断面图像来进行三维重建。但由于受成像原理的限制,精确度较差,所能提供的人体内部信息较少,因此其应用范围受到局限。近年来人们用脑图谱的方法来研究脑的形态结构。但从国内外研究现状来看,脑图谱的研究还存在着缺陷:有的用手工勾画而成的,带有一定的主观性;另外多数是以MRI为数据源,MRI图像分辨率较低,缺少许多人体颅内的重要形态和功能信息。虚拟人技术的出现为脑图谱的研究提供了新的契机。虚拟人数据集是以组织切片技术获得的,具有精度高、能准确显示神经解剖结构信息的优点,但其数据只代表个体的信息,如何把其中的丰富的神经解剖学信息应用到临床,为临床患者服务是目前需要迫切解决的问题。医学图像融合技术为解决这一问题提供了新的手段,目前医学图像融合技术在诊断与治疗中应用较多,但多是针对同一病人的CT、MRI、PET或SPECT等图像。尽管影像技术与设备不断提高,但对于诸多重要且临床上迫切需要的信息,这些设备均无法获得或清晰显示的,关于如何获取这些信息,目前文献还较少报道。目的:尝试解决临床诊断与治疗时影像数据中脑神经结构信息量不足的问题。方法:以中国虚拟人数据集为对象,用基于阈值的自动分割和基于解剖学知识的手工分割相结合的方法对其中部分神经结构进行识别与分割。为消除因手工分割产生的误差,在分割过程中用图像透明的方法,并用腐蚀和膨胀对分割后的神经结构进行平滑处理。用Chamfer Matching方法来配准融合MRI和PET图像,并对Chamfer Matching方法进行了改进,采用了可变步长逐步逼近的算法,使精度大大提高。用基于最大互信息方法把虚拟人数据集与病人MRI数据场进行配准融合,采用刚体配准方法,使两幅图像达到刚体位置上的配准,针对两者存在的个体差异,采用非刚体配准方法予以校正,从而达到了精确配准的目的。最后用表面绘制与体绘制相结合的方法来显示融合后的神经结构,并提出了基于等值面原理来提高体绘制的运算速度。结果:经过三维重建后的虚拟人神经结构轮廓清晰,形态逼真。将外部结构透明后可清晰显示各个内部神经结构的形态、毗邻关系及在脑中的位置。可在三维空间中绕任意轴旋转任意角度,从不同的方向进行观察。经过刚体与非刚体配准后,虚拟人数据与MRI数据基本达到对位重合,在同一幅图像上既能显示虚拟人数据集中的神经结构,又能显示病人MRI数据中的病变部位。重建后的图像逼真,可从三维上清晰显示病变部位及神经结构的形态、毗邻关系及在脑中的位置。结论:三维重建后的神经结构,对于神经外科疾病的诊断与治疗和解剖学教学科研具有重要的辅助作用。将虚拟人数据集融合到活体病人影像数据场中,能够成功解决临床影像数据中神经结构信息量不足的问题,使虚拟人数据集能够为临床应用服务。

论文目录:

中文摘要

英文摘要

第一章 引言

1.1 脑形态研究的重要性

1.2 脑形态研究的方法

1.3 虚拟人技术的出现为脑图谱的研究提供了新的契机

1.4 图像融合技术是解决问题的新途径

1.5 本研究的主要工作

1.6 本研究的创新点

第二章 材料和方法

2.1 数据来源

2.2 虚拟人数据集的图像分割

2.2.1 图像预处理

2.2.2 基于阈值的自动分割

2.2.3 基于解剖学知识的手工分割

2.3 平滑处理

2.3.1 腐蚀

2.3.2 膨胀

2.4 基于Chamfer Matching方法配准融合MRI和PET图像

2.4.1 图像预处理

2.4.2 Chamfer Matching原理

2.4.3 特征提取

2.4.4 距离变换

2.4.5 配准实现

2.4.6 用模糊数学方法配合

2.5 基于最大互信息法配准融合虚拟人数据集与MRI数据场

2.5.1 最大互信息配准理论

2.5.2 最大互信息配准理论的实现

2.5.3 配准步骤

2.6 三维重建

2.6.1 表面绘制

2.6.2 体绘制

第三章 结果

3.1 虚拟人数据集中神经结构的三维重建结果

3.2 融合结果

3.2.1 MRI与PET的图像融合

3.2.2 对MRI数据集和虚拟人数据集用基于最大互信息方法进行配准融合

附临床病例报告

第四章 讨论

4.1 有关临床影像数据信息量不足问题的解决

4.2 关于图像配准融合的方法

4.3 如何消除因手工分割产生的误差

4.4 虚拟人数据集的临床价值

4.5 研究中存在的问题

参考文献

在读期间发表的论文

致谢

综述

参考文献

发布时间: 2007-06-28

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