猪TLR7和MyD88基因克隆,组织表达谱分析及MyD88酵母表达的研究

猪TLR7和MyD88基因克隆,组织表达谱分析及MyD88酵母表达的研究

论文摘要

天然免疫是机体防御微生物病原体入侵第一道防线,机体细胞通过表达不同的模式识别受体(Pattern recognition receptors,PRRs),来识别包括类脂,脂蛋白,蛋白和核酸在内的各种病原相关分子模式(Pathogen-associated molecular patterns,PAMPs),激活机体细胞内信号通路,诱导炎症细胞因子和趋化因子及干扰素的表达,上调细胞表面MHCⅡ类分子和共刺激分子从而参与适应性免疫应答。Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)是天然免疫系统中重要的病原模式识别受体之一,也是典型的Ⅰ类跨膜受体,至今为止,已经在小鼠上发现了13个TLRs家族成员,人上11个。TLRs可以识别包括细菌,病毒,原生动物和真菌在内的多种微生物体的病原体相关分子模式,在机体天然免疫中发挥着重要的作用。Toll样受体7(Toll-like receptor 7,TLR7)是TLRs家族的重要成员之一,可以通过识别病毒的单链RNA(ssRNA)诱导机体表达干扰素α(IFN-α)和白细胞介素12(IL-12)等细胞因子,对病毒做出相应的免疫应答。现已证实TLR7可介导多种病毒的免疫应答,包括HIV-1,流感病毒,VSV(泡状口腔炎病毒)和HCV(丙型肝炎病毒)等。髓样分化因子88(Myeloid differentiation primary response protein 88,MyD88)是TLRs和IL-1Rs信号传导途径中重要的接头蛋白。近来研究证实MyD88还参与了IFN-γ诱导细胞响应,并且对IFN-γ诱导的mRNA的稳定性有着重要的作用。本研究应用RT-PCR、简并PCR、RACE、巢式PCR技术从猪肠系膜淋巴结组织总RNA中克隆出猪TLR7的cDNA序列。分析结果表明,克隆到的序列全长3 834 bp(GenBank收录号:EF469730),其3 153bp的开放阅读框编码1 050个氨基酸残基的猪Toll样受体7蛋白。推导的氨基酸序列分析显示,在猪TLR7的胞外区,具有多LRR-RI结构域,胞内具有TIR结构域,表现出典型的TLRs家族结构特征,同源性分析结果显示,TLR7在进化过程中具有高度保守性,与牛、狗、马、人、猫和小鼠的氨基酸序列同源性分别为:90.8%、87.4%、87.2%、84.9%、86.7%和78.2%。采用Real time PCR技术对太湖猪TLR7基因在心、脑、肺、肝、脾、肾、骨骼肌、脂肪、肠系膜淋巴结、空肠和派伊氏结11个组织中的表达谱进行了检测分析。结果显示,猪TLR7主要表达于肠系膜淋巴结和派伊氏结等组织。在皮下脂肪、心和骨骼肌组织中表达量相对较少。应用RT-PCR技术从猪肠系膜淋巴结组织总RNA中克隆出猪MyD88的cDNA序列,我们从三个不同成年太湖母猪的肠系膜淋巴结组织克隆该序列来验证这个序列。序列分析显示克隆到的猪MyD88 cDNA序列长897bp,包含猪MyD88基因全CDS区。该核酸序列已提交到GenBank(GenBank收录号:EF198416)。猪MyD88基因开放式阅读框编码293个氨基酸残基的蛋白质序列。我们利用在线软件SMART程序对推导的氨基酸序列分析其功能结构域,结果表明,该蛋白具有典型的MyD88结构,N端具有死亡结构域,中间的连接结构域和C末端的TIR结构域。同源分析表明,猪MyD88蛋白氨基酸序列也具有高度的保守性,与人、牛、小鼠和大鼠的同源性分别为88.4%、85.7%、78.8%和78.2%。猪MyD88与牛和人的遗传距离较近,与小鼠相对较远,进化树表明猪先与人和牛聚为一类,然后再与小鼠和大鼠聚类,遗传距离分析也显示了相似的结果。利用Real time PCR技术对太湖猪11个组织的表达谱分析显示猪MyD88基因广泛表达于各组织中,在派伊氏结、肠系膜淋巴结组织中表达量较大,在心脏和骨骼肌组织中表达量相对较少。Pichia pastoris是目前应用最广泛的外源蛋白表达系统之一。该表达系统兼有原核表达系统和真核表达系统的优点:①与酿酒酵母相似,操作简单;②不论胞内表达还是分泌表达,表达量高;③能对外源真核基因进行正确翻译和翻译后加工与修饰,包括蛋白质的糖基化,二硫键的形成以及蛋白的水解;④表达试剂盒商业化。本实验我们选用pPIC9K作为表达载体,KM71为宿主菌,在猪MyD88序列两端分别加上EcoRⅠ和NotⅠ两个酶切位点,终止密码子前加上六个组氨酸标签,将序列克隆到T载体,提质粒双酶切后利用T4 DNA连接酶克隆到pPIC9K上,利用SacⅠ酶切成单链后电转化导入酵母KM71中,利用组氨酸缺陷型MD平板和含不同浓度G418的YPD平板进行筛选,得到了不同抗G418水平的阳性转化子,将不同抗性的阳性转化子用甲醇诱导表达,首次成功利用毕赤酵母表达体系表达出猪MyD88蛋白,并应用Bio-Rad蛋白质纯化仪,GE的HisTrapTMHP对含有表达蛋白的上清液利用亲和层析进行纯化,SDS-PAGE电泳显示在分子量为34KDa附近有一条明显的电泳带,与生物信息学分析的猪MyD88表达蛋白分子量(包括His6标签)34..06KDa结果一致。

论文目录

  • 目录
  • 常用词语缩写
  • 摘要
  • Abstracts
  • 第一章 文献综述
  • 1 猪抗病育种及免疫抗病的一般机理
  • 2 天然免疫体系及Toll样受体家族基因
  • 2.1 天然免疫与获得性免疫
  • 2.2 Toll样受体家族
  • 3 TLR7基因的研究进展
  • 3.1 TLR7的发现及其识别配体
  • 3.2 TLR7的结构,染色体定位和组织分布
  • 3.3 TLR7介导的信号转导途径
  • 3.4 TLR7的生物学功能
  • 4 髓样分化因子88基因及其研究进展
  • 4.1 MyD88基因的发现
  • 4.2 MyD88的结构和组织分布
  • 4.3 MyD88介导的信号传导途径
  • 4.4 MyD88的生物学功能
  • 5 巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)表达体系
  • 5.1 Pichia pastoris表达系统的构成
  • 5.2 外源基因的转化与整合
  • 5.3 外源蛋白在Pichia pastoris中的表达
  • 5.4 影响外源基因在Pichia pastoris系统中表达的因素
  • 6 本研究的内容和意义
  • 第二章 TLR7基因的克隆、序列分析及组织表达谱的研究
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 试验动物及样品的采集
  • 2.2 主要仪器与试剂
  • 2.3 试验方法
  • 3 结果与分析
  • 3.1 TLR7基因克隆
  • 3.2 生物信息学分析
  • 3.3 TLR7基因的组织表达谱
  • 4 讨论
  • 4.1 TLR7基因的克隆的策略
  • 4.2 不同PCR技术的使用
  • 4.3 载体的连接
  • 4.4 TLR7氨基酸序列同源比对及功能结构域的分析
  • 4.5 TLR7基因的组织特异性表达
  • 第三章 猪MyD88基因的克隆、序列分析及组织表达谱的研究
  • 1 引言
  • 2 材料及试剂
  • 2.1 实验材料
  • 2.2 主要仪器与试剂
  • 2.3 试验方法
  • 3 结果与分析
  • 3.1 MyD88基因克隆
  • 3.2 MyD88基因生物信息学分析
  • 3.3 MyD88基因的组织表达谱
  • 4 讨论
  • 4.1 猪MyD88基因的克隆
  • 4.2 猪MyD88基因序列分析
  • 4.3 猪MyD88基因组织表达谱
  • 第四章 猪MyD88基因在Pichia pastoris中表达的研究
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.2 主要仪器设备与试剂
  • 2.3 实验方法
  • 3 结果与分析
  • 3.1 pPIC9K-MyD88重组质粒的构建及鉴定
  • 3.2 Pichia pastoris/pPIC9K-MyD88高频转化子的筛选
  • 3.3 pPIC9K-MyD88的诱导表达
  • 3.4 猪MyD88蛋白的纯化
  • 4 讨论
  • 4.1 表达体系的选择
  • 4.2 猪MyD88基因在Pichia pastoris中的表达
  • 4.3 影响MyD88在Pichia pastoris中表达的因素
  • 4.4 MyD88蛋白的纯化
  • 第五章 结论
  • 1 猪TLR7 cDNA的克隆和序列分析
  • 2 猪TLR7基因组织表达谱
  • 3 猪MyD88 cDNA的克隆和序列分析
  • 4 猪MyD88的组织表达谱
  • 5 猪MyD88的酵母表达
  • 附录
  • 参考文献
  • 致谢
  • 博士在读期间发表的论文
  • 相关论文文献

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