本文主要研究内容
作者刁秀楠,斛如媛,高春艳,张永坡,王敏,杜维俊,赵晋忠,岳爱琴（2019）在《大豆HMGR基因家族的鉴定与表达分析》一文中研究指出：[目的]3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是大豆皂苷合成途径的关键酶之一。从全基因组水平鉴定大豆HMGR基因家族并进行生物信息学和表达模式分析,为研究和利用大豆HMGR基因家族生物学功能奠定基础。[方法]根据Pfam数据库中HMGR基因的保守结构域(编号PF00368),利用HMMER3.0、PFAM和SMART软件鉴定大豆基因组中的HMGR基因。采用ProtParam等软件对其基因和蛋白序列进行生物信息学分析。利用qRT-PCR方法分析GmHMGR基因在苗期根、茎、叶等不同组织中和籽粒不同发育时期的表达情况。[结果]大豆基因组中鉴定得到8个GmHMGR基因,分布于8条染色体上,编码80～608个氨基酸,相对分子质量介于8.23～64.96kD,理论等电点变化为4.89～8.24,二级结构中α螺旋和无规则卷曲所占比重较大,具有保守的基因结构和蛋白功能域。qRT-PCR分析表明,相比于其它GmHMGR基因,GmHMGR6在苗期根、茎、叶中高度表达,籽粒发育过程中GmHMGR3基因在开花后40d表达水平最高,开花后70d大豆的成熟籽粒中GmHMGR6的表达丰度最高。[结论]大豆基因组中含有8个HMGR基因,具有保守的功能结构域和基因结构。GmHMGR基因家族在苗期根、茎、叶及不同发育时期籽粒中具有多样化的组织表达模式和时空表达特征。
Abstract
[mu de ]3-qiang ji -3-jia ji wu er xian fu mei Ahai yuan mei (HMGR)shi da dou zao gan ge cheng tu jing de guan jian mei zhi yi 。cong quan ji yin zu shui ping jian ding da dou HMGRji yin jia zu bing jin hang sheng wu xin xi xue he biao da mo shi fen xi ,wei yan jiu he li yong da dou HMGRji yin jia zu sheng wu xue gong neng dian ding ji chu 。[fang fa ]gen ju Pfamshu ju ku zhong HMGRji yin de bao shou jie gou yu (bian hao PF00368),li yong HMMER3.0、PFAMhe SMARTruan jian jian ding da dou ji yin zu zhong de HMGRji yin 。cai yong ProtParamdeng ruan jian dui ji ji yin he dan bai xu lie jin hang sheng wu xin xi xue fen xi 。li yong qRT-PCRfang fa fen xi GmHMGRji yin zai miao ji gen 、jing 、xie deng bu tong zu zhi zhong he zi li bu tong fa yo shi ji de biao da qing kuang 。[jie guo ]da dou ji yin zu zhong jian ding de dao 8ge GmHMGRji yin ,fen bu yu 8tiao ran se ti shang ,bian ma 80～608ge an ji suan ,xiang dui fen zi zhi liang jie yu 8.23～64.96kD,li lun deng dian dian bian hua wei 4.89～8.24,er ji jie gou zhong αluo xuan he mo gui ze juan qu suo zhan bi chong jiao da ,ju you bao shou de ji yin jie gou he dan bai gong neng yu 。qRT-PCRfen xi biao ming ,xiang bi yu ji ta GmHMGRji yin ,GmHMGR6zai miao ji gen 、jing 、xie zhong gao du biao da ,zi li fa yo guo cheng zhong GmHMGR3ji yin zai kai hua hou 40dbiao da shui ping zui gao ,kai hua hou 70dda dou de cheng shou zi li zhong GmHMGR6de biao da feng du zui gao 。[jie lun ]da dou ji yin zu zhong han you 8ge HMGRji yin ,ju you bao shou de gong neng jie gou yu he ji yin jie gou 。GmHMGRji yin jia zu zai miao ji gen 、jing 、xie ji bu tong fa yo shi ji zi li zhong ju you duo yang hua de zu zhi biao da mo shi he shi kong biao da te zheng 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自山西农业大学学报(自然科学版)的刁秀楠,斛如媛,高春艳,张永坡,王敏,杜维俊,赵晋忠,岳爱琴，发表于刊物山西农业大学学报(自然科学版)2019年04期论文，是一篇关于大豆论文,基因家族论文,生物信息学论文,表达分析论文,山西农业大学学报(自然科学版)2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自山西农业大学学报(自然科学版)2019年04期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：大豆论文; 基因家族论文; 生物信息学论文; 表达分析论文; 山西农业大学学报(自然科学版)2019年04期论文;