金线侧褶蛙种组3物种间的杂交与基因渐渗

金线侧褶蛙种组3物种间的杂交与基因渐渗

论文摘要

本论文包括以下两个部分:一、对种间杂交和基因渐渗研究进行了综述。二、利用9个微卫星位点探讨了金线侧褶蛙种组3个物种:福建侧褶蛙、湖北侧褶蛙和金线侧褶蛙之间存在的种间杂交与基因渐渗事件。我们利用获得的微卫星数据,进行了基于贝叶斯方法的Structure聚类分析、BayesAss个体归属及近期迁移率分析和种群遗传分化分析。Structure聚类分析和种群遗传分化分析支持这3种蛙是3个独立的物种,并提示湖北侧褶蛙和金线侧褶蛙在河南和山东等地区存在着较为频繁的基因渐渗。分析结果同时显示:河南的金线侧褶蛙种群在9个微卫星位点上与湖北侧褶蛙十分相似;而山东的金线侧褶蛙种群在9个微卫星位点上兼具金线侧褶蛙和湖北侧褶蛙的特征。结合之前对相同种群个体mtDNA数据的分析结果,我们推测湖北侧褶蛙和金线侧褶蛙之间存在渐渗杂交。同时,我们利用BayesAss确定了部分杂交个体,并估算了物种间的近期基因流,结果提示在山东的杂交事件可能是一种正在进行中的种间杂交。同时我们发现,福建侧褶蛙和金线侧褶蛙间可能存在种间杂交和基因渐渗、福建侧褶蛙和湖北侧褶蛙间存在种间杂交和基因渐渗,主要为福建侧褶蛙向湖北侧褶蛙方向的基因流。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 种间杂交与基因渐渗研究进展
  • 1 概述
  • 2 核-质不一致现象
  • 3 种间杂交与基因渐渗的形成原因
  • 4 种问杂交对物种的影响
  • 5 研究自然界种间杂交与基因渐渗常采用的标记
  • 5.1 形态学标记
  • 5.2 分子标记
  • 5.3 常用的分子标记组合
  • 参考文献
  • 第二章 金线侧褶蛙种组3物种间的杂交与基因渐渗
  • 1 材料
  • 2 方法
  • 2.1 全基因组DNA的提取
  • 2.2 微卫星扩增
  • 2.3 基因分型与数据读取
  • 2.4 种群遗传结构分析
  • 2.5 种群分歧与基因流分析
  • 2.6 基于Cyt b基因单元型的系统发生关系重建
  • 3 结果
  • 3.1 种群遗传多样性
  • 3.2 种群聚类结果
  • 3.3 种群间迁移个体数与基因流
  • 3.4 杂交个体
  • 3.5 系统发生分析
  • 4 讨论
  • 4.1 金线侧褶蛙、湖北侧褶蛙和福建侧褶蛙是3个独立的物种
  • 4.2 金线侧褶蛙种组的核-质不一致现象
  • 4.3 金线侧褶蛙种组的杂交事件
  • 参考文献
  • 致谢
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