瓠瓜杂种一代及其亲本DNA甲基化遗传和变异的研究

瓠瓜杂种一代及其亲本DNA甲基化遗传和变异的研究

论文摘要

DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰形式,存在于许多高等动、植物中,并在调控基因表达、维持基因组的稳定性等方面发挥重要生物学作用。同时,许多研究发现固有DNA甲基化水平和模式的变化会导致生物的表型异常甚至致死。但一定范围内的甲基化变异也为物种进化提供了机遇。这一点在植物上可能更是如此,因为植物上的甲基化变异通常可以通过减数分裂传递给后代。瓠瓜在生产上主要利用杂种优势,但F1代杂交种所表现的超亲优势的机理目前尚不完全清楚。因此本实验选择了3个优良瓠瓜亲本并配制了2个相互杂交组合,利用MSAP分子标记方法研究了亲本和杂交种基因组DNA的甲基化水平以及甲基化模式的遗传和变异,以探索甲基化在瓠瓜基因组DNA中的分布及规律;杂种优势和DNA甲基化之间可能存在的关系,进而希望从不同的角度为培育强优势的瓠瓜杂交种提供理论依据。本文研究主要得到以下结果:1.利用MSAP技术对瓠瓜杂交种及其亲本的基因组DNA甲基化水平进行了分析,结果表明:两个杂交组合(1×5、5×1和5×4、4×5)的正反交杂交种幼苗CCGG位点胞嘧啶甲基化水平均低于其亲本,但同一组合正反交间的CCGG位点胞嘧啶的甲基化水平无明显差异。瓠瓜基因组DNA甲基化模式主要以内侧胞嘧啶的甲基化为主。2.瓠瓜亲本向杂交种的DNA甲基化模式的遗传传递主要遵循孟德尔式的遗传方式,同时亲本间杂交也可引起F1代DNA甲基化变异,变异百分率为7.24%-7.85%。研究表明,对于CG和CNG位点的变异,来自于父本变异方式略低于相应的母本类型。各个组合的正反交之间发生变异的频率差别较小。3.通过MSAP分析观察得出,同一杂交种不同单株间DNA甲基化变异发生的位点有的表现为随机发生,有的则是非随机发生。4.所有亲本的不同单株间甲基化的遗传模式表现完全一致。5.通过对杂交种中的DNA甲基化变异片段测序和同源性分析,没有找到和杂种优势相关的已知基因,从而不能充分说明DNA甲基化与杂种优势之间的具体关系。上述研究结果显示,瓠瓜杂交种与其亲本自交系比较,DNA甲基化水平和模式在基本符合孟德尔遗传规律的同时,会发生一定频率的变异,这些变异有可能在一定程度上与杂种和亲本之间的基因差异表达有关。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 缩略词表
  • 文献综述
  • 1 表观遗传学
  • 1.1 调控机制
  • 1.1.1 X-染色体剂量补偿
  • 1.1.2 组蛋白密码
  • 1.1.3 基因组印记
  • 1.1.4 副突变
  • 1.1.5 染色质重塑
  • 1.1.6 转基因沉默
  • 1.1.7 小RNA
  • 1.1.8 RNA编辑
  • 1.2 遗传学与表观遗传学的关系
  • 1.3 表观遗传学研究的应用前景
  • 2 DNA甲基化
  • 2.1 DNA甲基化水平和模式
  • 2.2 生物学意义
  • 2.2.1 DNA甲基化在基因表达调控中的重要作用
  • 2.2.2 DNA甲基化在维持基因组的稳定性中起重要作用
  • 2.3 遗传和变异的分子生物学研究进展
  • 2.3.1 DNA甲基化的发生机制
  • 2.3.2 DNA甲基化的遗传
  • 2.3.3 DNA甲基化的变异
  • 3 杂种优势
  • 3.1 杂种优势表现特点
  • 3.2 杂种优势的遗传学解释
  • 3.3 杂种优势遗传机理假说的分子证据
  • 4 表观遗传学、DNA甲基化、杂种优势三者之间的关系
  • 5 本研究的目的和意义
  • 材料与方法
  • 1 试验材料
  • 1.1 供试植物材料
  • 1.2 主要药品、试剂及其试剂的配制
  • 2 试验方法
  • 2.1 植物基因组DNA的提取与纯化
  • 2.2 DNA的鉴定
  • 2.3 杂交种及其亲本的MSAP(甲基化敏感扩增片段长度多态性)分析
  • 2.3.1 限制性酶切及连接
  • 2.3.2 预扩增
  • 2.3.3 选择性扩增
  • 2.3.4 PCR产物检测
  • 2.3.5 记带及分析
  • 2.4 目的片段的回收、克隆及测序
  • 2.4.1 回收
  • 2.4.2 试剂盒纯化
  • 2.4.3 克隆
  • 2.4.4 测序及序列分析
  • 结果与分析
  • 1 瓠瓜亲本及其杂交种的幼苗在CCGG位点的胞嘧啶甲基化水平
  • 2 瓠瓜亲子代间幼苗DNA甲基化模式的遗传和变异
  • 3 瓠瓜杂交种不同幼苗单株间DNA的甲基化变异
  • 4 瓠瓜亲本自交系的异质性检测
  • 5 瓠瓜杂交种基因组DNA甲基化变异带的测序分析
  • 讨论
  • 1 瓠瓜幼苗在CCGG位点的胞嘧啶甲基化的相对水平
  • 2 瓠瓜甲基化模式的遗传和变异
  • 3 瓠瓜杂交种不同单株的甲基化变异
  • 4 瓠瓜亲本自交系单株间甲基化模式的一致性
  • 5 DNA甲基化与杂种优势的关系
  • 6 MSAP的优缺点
  • 7 杂合性与DNA甲基化及杂种优势的关系
  • 参考文献
  • 致谢
  • 相关论文文献

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