SET8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点单核苷酸多态性与肺癌患者临床特征及预后的关系

论文摘要

目的：肺癌已成为最常见的恶性肿瘤之一,在全球范围内，肺癌的总体发病率和病死率位居各类癌症之首，且呈不断上升趋势。MicroRNA（miRNA）是一类小型非编码RNA，人类基因组中大约有30%的蛋白编码基因是受其调控。单核苷酸多态性（SingleNucleotidePolymorphism，SNP）是在基因组水平上，由单个核苷酸的变异引起的序列多态性，是不同个体间最主要的遗传变异。SET8基因mRNA3’端非编码区有miR-502的结合位点，单核苷酸多态位点rs16917496存在于SET8基因3’端非编码区miR-502的结合区域内，研究发现该位点参与调节SET8基因的表达，并与肿瘤的早期发生相关。本研究首次对SET8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点SNP与肺癌患者临床特征及预后的相关性进行研究，同时分析了患者临床特征与预后的相关性，为肺癌预后的评价提供新的思路。方法：采集2001年5月～2011年5月间就诊于河北医科大学第四医院呼吸内科的317例肺癌患者，所有患者均经组织病理和/或细胞病理确诊为肺癌，均排除肺外原发肿瘤及遗传性疾病史。按要求准确记录患者的性别、年龄、病理类型、临床分期、吸烟状况和治疗情况。对317例患者进行基因型分析，其中195例患者有准确生存数据，对其进行生存分析。血标本均为患者接受放、化疗之前空腹采集，采取静脉血5ml置于枸橼酸钠的试管中。采用蛋白酶K-氯化钠盐析法提取基因组DNA，经鉴定DNA合格后，采用聚合酶链反应对目的片段进行扩增，扩增产物使用连接酶反应（ligasedetectionreaction，LDR）技术，实现对SNP位点的检测，对SET8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点单核苷酸多态位点进行基因分型。对不同组别的肺癌患者中SNP分布频率分析采用χ2检验，以非条件logistic回归方法计算相对风险度的比值比（oddsratio,OR）及其95%可信区间（confidenceinterval,CI）。单因素分析采用Kaplan-Meier方法估计组间生存率和绘制累计生存函数曲线，组间对比使用log-rank检验，筛选可能影响预后的危险因素。单因素分析有意义者，纳入Cox风险回归模型进行多因素分析，计算P值、相对危险度（Relative risk，RR）及其95%可信区间（confidence interval，CI），确定影响预后的独立危险因素。所有统计分析均采用SPSS18.0软件包进行，P＜0.05被认为有统计学意义。结果：1全部研究对象中，男性占67.5%（214例），女性，占32.5%（103例），平均年龄59.09±10.67岁。≤60者占56.2%（178例），＞60岁者占43.8%（139例）。肺鳞癌占26.8%（85例），肺腺癌占49.8%（158例），小细胞肺癌占23.4%（74例）。吸烟者占50.5%（160例），不吸烟者占49.5%（157例）。接受治疗者占85.8%（272例），未接受治疗者占14.2%（45例）。有准确生存数据肺癌患者中，非小细胞肺癌共152例，男性占65.8%（100例），女性占34.2%（52例），平均年龄60.36±10.73岁。≤60者占48.0%（73例），＞60岁者占52.0%（79例）。肺鳞癌占30.9%（47例），肺腺癌占69.1%（105例）。III期占30.3%（46例），IV期占69.7%（106例）。吸烟者占48.7%（74例），不吸烟者占51.3%（78例）。接受治疗者占82.9%（126例），未接受治疗者占17.1%（26例）。小细胞肺癌共43例，男性占62.8%（27例），女性占37.2%（16例），平均年龄56.60±10.63岁。≤60者占67.4%（29例），＞60岁者占32.6%（14例）。局限期占30.2%（13例），广泛期占69.8%（30例）。吸烟者占53.5%（23例），不吸烟者占46.5%（20例）。接受治疗者占93.0%（40例），未接受治疗者占7.0%（3例）。2所有肺癌患者中，不同病理类型（NSCLC组与SCLC组，P=0.764，OR=1.061，95%CI=0.720-1.565；鳞癌组与腺癌组，P=0.121，OR=0.734，95%CI=0.496-1.085）、性别（男性患者与女性患者，P=0.485，OR=0.881，95%CI=0.618-1.257）、年龄（≤60岁与＞60岁患者， P=0.729，OR=1.060，95%CI=0.761-1.478）、吸烟情况（吸烟患者与不吸烟患者，P=0.500，OR=0.893，95%CI=0.642-1.242）患者间，T、C等位基因分布频率差异均无统计学意义。3所有肺癌患者中，不同病理类型（NSCLC组与SCLC组中TT、CT、CC基因型频率分别为29.6%、27.5%、7.7%和32.1%、22.3%、11.6%;鳞癌组与腺癌组TT、CT、CC基因型频率分别为25.9%、26.7%、10.4%和31.7%、27.9%、6.3%）、性别（男性患者与女性患者TT、CT、CC基因型频率分别为28.9%、26.8%、8.7%和35.2%、36.9%、29.0%）、年龄（≤60岁与＞60患者TT、CT、CC基因型频率分别为30.9%、26.1%、8.5%和29.3%、26.5%、8.8%）、吸烟情况（吸烟患者与不吸烟患者TT、CT、CC基因型频率分别为28.7%、26.6%、9.0%和31.7%、25.9%、8.2%）患者之间，CT基因型、CC基因型及CT+CC基因型，与优势基因型TT相比，频率分布差异均无统计学意义（P值均＞0.05）。4非小细胞肺癌组，单因素分析，set8基因型（CC基因型，CT基因型，TT基因型，p=0.688）、性别（男性与女性，P=0.842）、年龄（≤60岁和＞60岁，P=0.776）、病理类型（鳞癌与腺癌患者，P=0.403）、吸烟情况（吸烟者与不吸烟者， P=0.543），对预后影响差别无统计学意义。临床分期（III期与IV期患者，P=0.003）、治疗情况（治疗组与未治疗组，P=0.000），对预后影响差别均有显著统计学意义。多因素分析显示，III期与IV期患者相比，后者的死亡风险为前者的1.904倍（P=0.007，RR=1.904，95%CI=1.194—3.038）。治疗组与未治疗组相比，前者的死亡风险为后者的0.434倍（P=0.000，RR=0.434，95%CI=0.273—0.690）。5小细胞肺癌组，单因素分析，性别（男性与女性，P=0.087）、临床分期（局限期与广泛期患者，P=0.939）、吸烟情况（吸烟者与不吸烟者，P=0.349），对预后影响差别均无统计学意义。SET8基因型CC+CT基因型和TT基因型，P=0.043)、年龄（≤60岁和＞60岁，P=0.029）、治疗情况（治疗组与未治疗组，P=0.000）；对预后影响差别均有统计学意义。多因素分析，性别与小细胞肺癌患者死亡风险无关（P=0.529，RR=1.291，95%CI=0.583—2.860）。年龄与小细胞肺癌患者死亡风险无关（P=0.122，RR=1.806，95%CI=0.855—3.816）。治疗组与未治疗组相比，前者的死亡风险为后者的0.059倍（P=0.000，RR=0.059，95%CI=0.012—0.287）。CC+CT基因型者与TT基因型者相比，前者的死亡风险为后者的0.438倍（P=0.031，RR=0.438，95%CI=0.207—0.926）。结论：1不同临床特征（包括病理类型、性别、年龄、吸烟状况）的肺癌患者，rs16917496多态位点基因型中，T、C等位基因及各基因型（TT、TC、CC）分布频率差别无统计学意义。2Set8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点单核苷酸多态性与SCLC患者预后相关，SET8基因型可作为SCLC患者预后的独立危险因素，携带C等位基因的小细胞肺癌患者较只携带T等位基因的患者，有着较好的预后。3尚不能认为Set8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点单核苷酸多态性与NSCLC患者预后相关。4治疗情况可作为NSCLC及SCLC患者预后的独立危险因素，治疗组与未治疗组相比，预后明显改善。5TNM分期可作为NSCLC患者预后的独立危险因素，III期患者预后明显好于IV期患者。性别、年龄、病理类型及吸烟状况，尚不能成为NSCLC患者预后的独立危险因素。6性别、年龄、临床分期及吸烟状况，尚不能成为SCLC患者预后的独立危险因素。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 前言
• 材料与方法
• 结果
• 附图
• 附表
• 讨论
• 结论
• 参考文献
• 综述 MicroRNA 与肺癌相关性研究
• 参考文献
• 致谢
• 个人简历