ISS患儿NPR3、COL11A2基因单核苷酸多态性的研究

论文摘要

目的:特发性矮小（idiopathic short stature,ISS）是一种多基因作用而导致的疾病,其病因尚未明确,是一个异质性疾病,遗传因素在其中起到主要作用。ISS主要表现为垂体-生长激素-胰岛素样生长因子1轴和骨骼生长板功能异常。基于生长板在ISS发病中的重要作用,本研究通过对生长板利钠肽受体3（natriuretic peptide receptor 3,NPR3）、XI型胶原α2（collagen,type XI,alpha-2,COL11A2）基因相关位点的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）的研究,以明确其与ISS的相关性。方法:1、采用氯仿苯酚抽提法抽提病例组外周血基因组DNA,采用直接抽提法抽提对照组基因组DNA,使用核酸蛋白测定仪对DNA浓度进行测定。2、抽提的185例病例组DNA和474例对照组DNA,在Illumina Goldengate基因平台上对NPR3基因和COL11A2基因上的20个位点进行tSNP分型,测定等位基因和基因型分布频率。3、对分型结果进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验,确定各基因型频率是否达到遗传平衡,具有群体代表性。4、病例组和对照组的分型结果进行等位基因、基因型及显性和隐性模式下的基因型分布频率的卡方检验,其基因型及等位基因的相对危险度以优势比（Odds ratio,OR）及95%可信（CI）表示。结果:1、NPR3基因位点rs973079与ISS相关,CC、CT基因型是ISS发病的易感因素。2、NPR3基因位点rs6889608、rs696831、rs16890208、rs1173747与ISS无相关性。3、COL11A2基因位点rs9368758、rs970901、rs9277934与ISS相关:rs9368758位点AA、AG基因型、rs970901位点A等位基因和AA基因型及rs9277934位点C等位基因和CC基因型是ISS发病的易感因素。4、COL11A2基因位点rs2855440、rs2855437、rs1799908与ISS相关:rs2855440位点A等位基因和AA、AG基因型、rs2855437位点C等位基因和CC、CT基因型及rs1799908位点AA基因型是ISS发病的保护因素。5、COL11A2基因位点rs12526336与ISS相关,以A隐性模式遗传,AA基因型与ISS发病的相关性有待进一步扩大样本量以明确。6、COL11A2基因位点rs2257126、rs986522、rs2855430、rs2071025与ISS无相关性。结论:1、NPR3基因位点rs973079及COL11A2基因位点rs9368758、rs970901、rs9277934、rs2855440、rs2855437、rs1799908、rs12526336的SNP与ISS的发病存在相关性,ISS是一个多基因、异质性疾病。2、NPR3基因位点rs6889608、rs696831、rs16890208、rs1173747及COL11A2基因位点rs2257126、rs986522、rs2855430、rs2071025的SNP与ISS的发病无关。

论文目录

• 中文摘要
• Abstract
• 前言
• 材料与方法
• 结果
• 讨论
• 结论
• 参考文献
• 综述
• 参考文献
• 中英文缩写对照
• 学习期间论文发表情况
• 致谢