GDF9基因多态性及其与小尾寒羊多羔性关系的研究

GDF9基因多态性及其与小尾寒羊多羔性关系的研究

论文摘要

为了探讨生长分化因子9(GDF9)基因与小尾寒羊高繁殖力之间的关系,为小尾寒羊高繁殖性状的辅助选择提供有效的分子标记,采用PCR-SSCP方法,对小尾寒羊、白萨福克羊、特克赛尔羊和藏羊中GDF9基因的单核苷酸多态性进行研究。结果表明:在小尾寒羊、白萨福克羊和特克赛尔羊中检测到AA、AB、BB三种基因型,在藏羊中检测到了AA、AB两种基因型。四个绵羊品种A等位基因频率分别为64.1%、73.3%、73.35%、81.65%,B等位基因频率分别为35.9%、26.7%、26.65%、18.35%。测序结果表明,BB型与AA型相比发生了一处单碱基突变;与GeneBank上GDF9基因(登录号:AF078545)序列比较发现AA型与原序列完全相同,定义为野生型,BB型在外显子2的75位发生了C→T的单碱基突变,定义为突变型。翻译成氨基酸序列比较发现突变没有引起氨基酸的改变,为沉默突变。小尾寒羊和藏羊品种之间基因型分布差异显著(P<0.05),其它各品种之间基因型分布差异均不显著(P>0.05)。经X2适合性检验,4个绵羊品种中X2值均未达到显著水平,此扩增片段均处于Hardy-Weinberg平衡状态。这说明GDF9基因G2突变这对引物扩增片段不受选育措施的影响,在选育过程中它们的遗传仍然是随机的。不同基因型和小尾寒羊产羔数最小二乘方差分析表明,小尾寒羊产羔数的最小二乘均值关系为AB>AA>BB,但3种基因型间差异不显著(P>0.05)。GDF9基因的G2突变对小尾寒羊高繁殖力没有显著影响。

论文目录

  • 摘要
  • Summary
  • 第一部分 文献综述
  • 1 小尾寒羊的研究概况
  • 2 多羔基因研究概况
  • 2.1 已知突变的多羔主效基因
  • 2.2 已知遗传模式的主效基因
  • 2.3 推定多羔主效基因
  • 3 GDF9 基因研究进展
  • 3.1 生长分化因子9 的结构、功能及调控
  • 3.2 生长分化因子9 基因研究进展
  • 4 SSCP 技术研究
  • 4.1 SSCP 的建立与发展
  • 4.2 PCR-SSCP 方法的原理
  • 4.3 PCR-SSCP 的特点
  • 4.4 PCR-SSCP 方法的应用
  • 5 研究的目的和意义
  • 第二部分 材料与方法
  • 1 实验材料
  • 1.1 实验样本的来源及采集方法
  • 1.2 主要仪器设备
  • 1.3 主要试剂
  • 1.4 分析工具软件
  • 1.5 主要药品及试剂的制配
  • 1.6 PCR 扩增所用的引物
  • 2 实验方法
  • 2.1 实验样品DNA 的提取
  • 2.2 绵羊GDF9 基因的PCR-SSCP 分析
  • 2.3 统计方法
  • 第三部分 结果与分析
  • 1 绵羊GDF9 基因PCR 产物扩增结果
  • 2 GDF9 基因SSCP 条件优化结果
  • 2.1 凝胶浓度及组分的优化
  • 2.2 电泳条件
  • 2.3 GDF9 基因外显子的4 对引物PCR 产物的SSCP 结果
  • 2.4 不同基因型个体的测序
  • 2.5 氨基酸序列同源性比较
  • 3 群体遗传学分析
  • 3.1 GDF9 基因频率及基因型频率
  • 3.2 Hardy-Weinberg 平衡状态的检验
  • 3.3 不同绵羊品种GDF9 基因型分布独立性检验
  • 3.4 GDF9 基因的杂合度、有效等位基因数和多态信息含量
  • 3.5 GDF9 基因多态性与小尾寒羊高繁殖性状的相关分析
  • 第四部分 讨论
  • 1 实验材料的选择
  • 2 侯选基因的确定
  • 3 影响PCR 过程的因素
  • 3.1 PCR 模板DNA 的质量
  • 3.2 PCR 反应条件的影响因素
  • 4 SSCP 检出率的影响因素
  • 4.1 PCR 片段的长度
  • 4.2 非变性聚丙烯酰胺凝胶成分
  • 4.3 上样缓冲液与变性
  • 4.4 电泳条件
  • 5 SSCP 结果的分型
  • 6 SSCP 检测结果和基因测序结果分析
  • 7 SSCP 检测结果对小尾寒羊产羔数影响的分析
  • 第五部分 结论
  • 致谢
  • 参考文献
  • 作者简介
  • 导师简介
  • 相关论文文献

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