黄杆菌属等三株新种的分离和多相分类研究

黄杆菌属等三株新种的分离和多相分类研究

论文摘要

本文叙述了当前细菌分类学的现状,目的和意义,以及目前常用的细菌多相分类的方法。本实验从安徽省淮远市采集菜园土,江苏省宿迁市泗阳县葛集乡菜园土,新疆省阿克苏市阿依其乡沙漠土作为细菌分离的材料。利用稀释平板的方法从这些土样中分离得到三株细菌,对该三株细菌从形态特征、培养特征、生理生化测定、细胞化学组分分析、DNA G+Cmol%和DNA同源性测定以及16s rDNA全序列分析等相结合的多相分类技术手段进行系统的分类研究。从表型、基因型和系统发育三个不同层次对其分类地位进行了最终确定。其中分离自安徽省淮远市采集菜园土的菌株D3T属于黄杆菌属(Flavobacterium)的一个新种:命名为安徽黄杆菌(Flavobacterium anhuiense sp.nov),而分离自江苏省宿迁市泗阳县葛集乡菜园土的菌株SY1T属于鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium)的一个新种:命名为泗阳鞘氨醇杆菌(Sphingobacteriumsiyangense sp.nov),分离自新疆省阿克苏市阿依其乡沙漠土的菌株HR2T属于假单胞菌属(Pseudomonas)的一个新种:命名为黄色坚硬假单胞菌(Pseudomonas duriflavasp.nov)。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 前言
  • 文献综述部分
  • 第一章 微生物分类方法研究概述
  • 一 传统分类法
  • 二 化学分类法
  • 2.1 细胞壁组成
  • 2.2 脂肪酸组成分析
  • 2.3 醌组分分析
  • 2.4 全细胞蛋白及核糖体蛋白电泳分析
  • 三 遗传特征分类法
  • 3.1 细菌G+C mol%的测定
  • 3.2 DNA-DNA杂交
  • 3.3 RNA同源性分析
  • 四 黄杆菌属分类进展
  • 4.1 黄杆菌属的分类历史
  • 4.2 黄杆菌属的鉴别特征
  • 五 鞘氨醇杆菌属分类进展
  • 5.1 鞘氨醇杆菌属分类历史
  • 5.2 鞘氨醇杆菌属的鉴别特征
  • 六 假单胞菌属分类进展
  • 6.1 假单胞菌属分类历史
  • 6.2 假单胞菌属的鉴别特征
  • 参考文献
  • 实验部分
  • 第一章 菌株的分离和多相分类的方法
  • 1. 分离方法和培养基
  • 2. 形态观察
  • 3. 生理生化性状和碳源利用分析
  • 4. 其他生理生化性状的测定
  • 5. 细胞氨基酸、糖组分分析
  • 6. 醌组分分析
  • 7. 细胞脂肪酸分析
  • 8. G+C mol%含量测定
  • 9. DNA-DNA同源性测定
  • 10. 16S rDNA序列测定及系统发生分析
  • 参考文献
  • 第二章 各菌株的多相分类的结果和分析
  • 一. 黄杆菌属的结果和分析
  • 1. 革兰氏染色、菌落形态、菌体形态观察
  • 2. 生理生化性状和碳源利用分析
  • 3. 其他生理生化性状的测定
  • 4. 脂肪酸分析结果
  • 5. 抗生素敏感性测定结果
  • 6. G+C mol%含量测定结果
  • 7. 16S rDNA序列测定及系统发生分析结果
  • 8. 结果讨论
  • 二、鞘氨醇杆菌属的结果和分析
  • 1. 革兰氏染色、菌落形态、菌体形态观察
  • 2. 生理生化性状和碳源利用分析
  • 3. 其他生理生化性状的测定
  • 4. 脂肪酸分析结果
  • 5. 抗生素敏感性测定结果
  • 6. G+C mol%含量测定结果
  • 7. 16S rDNA序列测定及系统发生分析结果
  • 8. 结果讨论
  • 三、假单胞菌属的结果和分析
  • 1. 革兰氏染色、菌落形态、菌体形态观察
  • 2. 生理生化性状和碳源利用分析
  • 3. 其他生理生化性状的测定
  • 4. 脂肪酸分析结果
  • 5. 抗生素敏感性测定结果
  • 6. G+C mol%含量测定结果
  • 7. 16S rDNA序列测定及系统发生分析结果
  • 8. 结果讨论
  • 参考文献
  • 全文总结
  • 硕士论文的创新点
  • 附录1 菌株的16S rDNA序列
  • 附录2 攻读硕士学位期间发表的文章
  • 致谢
  • 相关论文文献

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