吴泽:苏州市乌江群体Y染色体STR和SNP的遗传结构分析论文

吴泽:苏州市乌江群体Y染色体STR和SNP的遗传结构分析论文

本文主要研究内容

作者吴泽,陈天发,曾志凡,张义为,汤真,苏开元,范辰韵,李士林(2019)在《苏州市吴江地区人群Y染色体STR和SNP的遗传结构分析》一文中研究指出:目的分析苏州市吴江地区男性汉族人群Y染色体STR和SNP的基因分型,探索吴江地区人群的遗传结构,以进一步发掘具有该地区特异性的Y-SNP遗传标记祖先单倍群。方法随机采集472名吴江地区汉族男性个体的血样,采用YfilerTMPlus PCR扩增试剂盒进行基因分型,通过直接计算法得出各基因座的等位基因频率和单倍型频率,用Y-Predictor软件推测各样本的Y-SNP单倍群,并通过扩增阻滞突变系统聚合酶链反应(amplification refractory mutation system-polymerase chain reaction,ARMS-PCR)进行实验验证。结果 472名吴江地区汉族男性群体的27个Y-STR遗传标记中,共检出453种单倍型,单倍型多样性(haplotype diversity,HD)为0.997 696 93,其中基因多样性(gene diversity,GD)值最高的是DYF387S1a/b(0.953 1)、最低的是DYS438(0.321 8)。根据472个样本27个Y-STR的基因分型数据,推测并实验验证得到来自C、D、N、O和Q等单倍群下游的132种单倍群。结论本研究基于Y染色体STR单倍型,通过Y-Predictor软件预测Y-SNP单倍群并利用ARMS-PCR进行验证,引入Y-SNP遗传标记,实现了对吴江地区3个镇区人群男性家系的精细遗传结构解析。

Abstract

mu de fen xi su zhou shi wu jiang de ou nan xing han zu ren qun Yran se ti STRhe SNPde ji yin fen xing ,tan suo wu jiang de ou ren qun de wei chuan jie gou ,yi jin yi bu fa jue ju you gai de ou te yi xing de Y-SNPwei chuan biao ji zu xian chan bei qun 。fang fa sui ji cai ji 472ming wu jiang de ou han zu nan xing ge ti de xie yang ,cai yong YfilerTMPlus PCRkuo zeng shi ji he jin hang ji yin fen xing ,tong guo zhi jie ji suan fa de chu ge ji yin zuo de deng wei ji yin pin lv he chan bei xing pin lv ,yong Y-Predictorruan jian tui ce ge yang ben de Y-SNPchan bei qun ,bing tong guo kuo zeng zu zhi tu bian ji tong ju ge mei lian fan ying (amplification refractory mutation system-polymerase chain reaction,ARMS-PCR)jin hang shi yan yan zheng 。jie guo 472ming wu jiang de ou han zu nan xing qun ti de 27ge Y-STRwei chuan biao ji zhong ,gong jian chu 453chong chan bei xing ,chan bei xing duo yang xing (haplotype diversity,HD)wei 0.997 696 93,ji zhong ji yin duo yang xing (gene diversity,GD)zhi zui gao de shi DYF387S1a/b(0.953 1)、zui di de shi DYS438(0.321 8)。gen ju 472ge yang ben 27ge Y-STRde ji yin fen xing shu ju ,tui ce bing shi yan yan zheng de dao lai zi C、D、N、Ohe Qdeng chan bei qun xia you de 132chong chan bei qun 。jie lun ben yan jiu ji yu Yran se ti STRchan bei xing ,tong guo Y-Predictorruan jian yu ce Y-SNPchan bei qun bing li yong ARMS-PCRjin hang yan zheng ,yin ru Y-SNPwei chuan biao ji ,shi xian le dui wu jiang de ou 3ge zhen ou ren qun nan xing jia ji de jing xi wei chuan jie gou jie xi 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自法医学杂志的吴泽,陈天发,曾志凡,张义为,汤真,苏开元,范辰韵,李士林,发表于刊物法医学杂志2019年04期论文,是一篇关于法医遗传学论文,短串联重复论文,单核苷酸多态性论文,染色体论文,遗传结构论文,单倍群论文,汉族论文,苏州论文,法医学杂志2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自法医学杂志2019年04期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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