非小细胞肺癌相关基因的多态性研究

非小细胞肺癌相关基因的多态性研究

论文题目: 非小细胞肺癌相关基因的多态性研究

论文类型: 博士论文

论文专业: 外科学

作者: 邵国光

导师: 关文曾

关键词: 单核苷酸多态性,辐射敏感性,易感性

文献来源: 吉林大学

发表年度: 2005

论文摘要: 肺癌作为最常见的恶性肿瘤之一,其五年生存率在美国约为14%,在欧洲、中国及其它发展中国家,仅为8%。到目前为止,提高肺癌疗效的关键还是在于早期发现,早期诊断,早期治疗。但是,由于目前诊疗手段的限制,70%的肺癌患者确诊时都属于中晚期,这也是肺癌患者总的生存率低的主要原因。对于晚期的患者,放射治疗是主要的治疗手段之一。因此,早期诊断和治疗及增强放射治疗的敏感性是提高肺癌患者存活率的关键。目前,除了吸烟是明确的影响因素外,家族的遗传易感性所起的作用也逐渐为人们所重视。尤其是p53 基因及其调节基因的多态性已有多家报道。研究最多的是BstUⅠp53 基因第4 个外显子上的密码子72 具有多态性,可产生不同的蛋白质,精氨酸/脯氨酸。另一个研究较多的与肺癌相关的多态性位点是位于内含子6 上的MSPI,这种变异已被证实与肺癌易感性密切相关。随着基因组范围内DNA 分子水平的多态遗传标记的广泛发现以及相关问题的群体遗传学理论研究的发展,寻找分子遗传标记在遗传传递的重组规律中的对应关系,来探讨非小细胞肺癌的分子遗传学机制已成为一种新的思路。本研究在上述研究的基础上,选择88 例非小细胞肺癌及112 例健康人为研究对象,利用PCR-RFLP 方法,应用病例-对照研究方法,分析SNPs 位点与非小细胞肺癌的易感性、放射治疗敏感性及SNPs 位点与非小细胞肺癌临床症状之间的关系。在技术路线上,遵循全基因组扫描染色体阳性区域→基因图→SNPs 图→RFLP(限制性片段长度多态)图这样一个基本研究过程。用PCR-RFLP 方法检测SNPs 基因型,采用SPSS 统计学软件管理和分析基因分型数据,用拟合优度卡方检验验证每个SNP 基因型在抽样群体中的分布是否符合Hardy-Weinberg 平衡。结果发现,TP53SNP1 位点NSCLC 组的C 等位基因及C/C 纯合子的基因型与对照组相比有明显差异,提示该位点与NSCLC 的易感性相关联。mdm2SNP3 位点NSCLC 组的G/G等位基因型频率与对照组相比有明显差异,提示该位点与非小细胞肺癌的易感性相关联。这些结果将为肺癌的早期诊断、治疗提供提供理论依据,从而进一步提高诊疗疗效。本研究工作是后基因组时期功能基因组学研究的前沿课题。所获得的实验结果不仅为肺癌的早期诊断、治疗提供提供理论依据,也为其他重大多基因遗传疾病的研究提供了新思路和新途径。

论文目录:

英文缩写词

前言

第一章 文献综述

1. 非小细胞肺癌

1.1 非小细胞肺癌的概述

1.2 非小细胞肺癌的流行病学

1.3 非小细胞肺癌的病因学

1.4 非小细胞肺癌的病理学

1.5 非小细胞肺癌的临床表现

1.6 非小细胞肺癌的诊断

1.7 非小细胞肺癌的环境危险因素与肺癌多态性

1.8 恶性肿瘤放射敏感性的研究进展

2. 非小细胞肺癌基因研究进展

2.1 mdm2 基因研究进展及其与肺癌的关系

2.2 p53 基因研究进展及其与肺癌的关系

3. 非小细胞肺癌遗传学研究的基本策略

3.1 基因组扫描

3.2 候选基因策略

3.3 两种策略优缺点比较

3.4 用于肺癌分子遗传学研究的关联研究

4. 人类基因组计划的主要成果

4.1 遗传图

4.2 物理图

4.3 转录图

4.4 序列图

5. 单核苷酸多态性

5.1 SNPs 的特点

5.2 SNPs 的优点

5.3 SNPs 的局限性

5.4 SNPs 的识别和筛检

5.5 SNPs 的医学意义和应用

6. 疾病基因组学研究的展望

6.1 疾病基因组学研究的主要内容

6.2 疾病基因组学研究的主要推动力

第二章 材料与方法

1. 试剂

2. 器材

3. 仪器

4. 研究对象

4.1 样本来源

4.2 诊断标准

4.3 血样收集与处理

4.4 样本的复核

5. 确定候选基因及候选基因上的 SNPs

5.1 查找与疾病相关的染色体阳性区域

5.2 确定候选基因上含有RFLP 位点的SNPs

5.3 杂合度鉴定

6. 引物设计及酶切片段

7. 基因分型

7.1 人基因组DNA提取

7.2 PCR 扩增

7.3 限制性酶切

8. 数据库建立

9. 统计学处理

9.1 Hardy-Weinberg(H-W)平衡检验

9.2 等位基因及基因型频率

9.3 mdm2 基因多态性与NSCLC 易感性的关联性分析

9.4 mdm2 基因多态性与NSCLC 辐射敏感性的关联性分析

9.5 mdm2 基因多态性与NSCLC 临床症状关联性分析

第三章 实验结果

1. 遗传标记的选择

2. 等位基因及基因型频率

2.1 p53 基因TP535NP1

2.2 p53 基因 BstUISNP2 位点

2.3 mdm2 基因mdm25NP3 位点

2.4 mdm2 基因mdm2 SNP4 位点

3.H ardy-Weinberg 平衡检验结果

4.S NPs 与非小细胞肺癌临床症状相关性分析

4.1 TP535NP1 基因型多态性与肺癌临床症状相关性分析结果

4.2 TP535NP1 多态性与肺癌临床症状相关性分析结果

4.3 BstUISNP2 基因型多态性与肺癌临床症状相关性分析结果

4.4 BstUI SNP2 等位基因多态性与肺癌临床症状相关性分析结果

4.5 mdm25NP3 基因型多态性与肺癌临床症状相关性分析结果

4.6 mdm25NP3 等位基因多态性与肺癌临床症状相关性分析结果

4.7 mdm25NP4 基因型多态性与肺癌临床症状相关性分析结果

4.8 mdm25NP4 等位基因多态性与肺癌临床症状相关性分析结果

第四章 讨论

1. p53 基因与非小细胞肺癌

2. mdm2 基因与非小细胞肺癌

3. SNP 研究的概况和展望

3.1 SNP 研究的概况

3.2 SNPs 与肿瘤易感相关性的研究策略

3.3 对 SNPs 存在意义的信息的查询

3.4 对易感基因的功能验证

结论

参考文献

攻读博士学位期间发表的论文及其他科研成果

论文摘要(中文)

论文摘要(英文)

致谢

发布时间: 2005-08-26

参考文献

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