本文主要研究内容
作者樊媛媛（2019）在《草原革蜱Dermacentor nuttalli中Rickettsia的检测及其对宿主遗传多样性的影响》一文中研究指出：草原革蜱(Dermacentor nuttalli),隶属于硬蜱科(Ixodidae),革蜱属(Dermacentor),分布广泛,是我国北方地区的常见种,在黑龙江、吉林、内蒙古、辽宁、河北等地均有发现,同时作为多种病原体的传播媒介,威胁人类和动物的健康。Rickettsia是一类严格胞内寄生的革兰氏阴性细菌,作为脊椎动物的病原菌能够导致斑疹热等多种疾病,是重要的蜱传病原菌,在部分蜱中,Rickettsia还可以作为共生菌存在。研究Rickettsia与其宿主草原革蜱的关系,为蜱媒疾病的分布、控制及蜱类种群遗传等研究工作提供了理论基础。1、本研究通过PCR法特异性扩增Rickettsia的16S rRNA基因、ompA基因和gltA基因片段,检测四个地理种群的草原革蜱内Rickettsia的感染情况,内蒙古额尔古纳、吉林延边、黑龙江大庆、河北小五台四个地区,共检测草原革蜱样本118头。基于三个基因片段检测Rickettsia的检出率一致,感染Rickettsia的样本数量为63头,总感染率为53.39%(63/118)。其中,内蒙古地区感染率最高,为80%(24/30)。河北地区感染率为50%(15/30)、黑龙江地区为46.42%(13/28)、吉林地区感染率最低,为36.67%(11/30)。2、实验检测到的Rickettsia的16S rRNA基因、ompA基因和gltA基因三基因片段,经BLAST比对后,均与劳氏立克次体R.raoultii的相似程度均达到99%以上。对检测到的Rickettsia构建系统发育树,系统发育分析显示,本实验检测到的Rickettsia与R.raoultii聚集为一支,因此,确定本实验检测到的Rickettsia为R.raoultii。3、对Rickettsia种群进行遗传多样性分析,Rickettsia种群呈现出单倍型多样性较高(Hd:16S rRNA:0.70302;ompA:0.583;gltA:0.60665)核苷酸多样性较低(Pi:16S rRNA:0.00165;ompA:0.00297;gltA:0.00249)的特点。其种群遗传变异较为丰富,遗传多样性水平较高,生存能力及对环境变化的适应性强,但种群变异未经历长时间的累积。对Rickettsia各地理种群间进行种群遗传分化系数分析,结果显示,Rickettsia种群整体的FST值大于0.25,表明各地理种群的Rickettsia之间遗传分化程度较高。对三个基因数据进行AMOVA分析,结果显示种群遗传变异均来自种群内部。构建单倍型网络图和系统发育树,不同地理种群的单倍型相互混杂,未按照不同地理种群进行聚类,未形成明显的地理格局。4、分别选取草原革蜱的线粒体基因16S rRNA基因、COI基因和核糖体ITS2基因,以Rickettsia的感染为依据,将草原革蜱分为感染组和未感染组。对两组单倍型分布进行分析,结果显示,感染组和未感染组共享的单倍型占整体种群共享单倍型数目较大(COI:64.70%;16S rRNA:41.17%;ITS2:60%)。对两组的遗传多样性和种群遗传多样性进行对比分析,COI基因的分析结果显示,感染组在单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)、平均核苷酸差异(K)上均大于未感染组。将各地理种群均按照Rickettsia感染与否进行分组,进行遗传多样性分析,河北和内蒙古地区感染组的单倍型多样性、核苷酸多样性、平均核苷酸差异均大于未感染地区的遗传多样性数值。说明Rickettsia的感染对草原革蜱COI基因的遗传多样性产生了一定影响。对各地理种群的草原革蜱感染组和未感染组间的FST值进行分析。ITS2基因的结果显示,内蒙古地区两组间和河北地区两组间的FST值介于0.05到0.15之间,表明内蒙古和河北地区的感染组与未感染组之间产生了一定水平的遗传分化。对草原革蜱感染组与未感染组进行单倍型网络图和系统发育分析,其结果均显示,感染组与未感染组并未产生独立的聚类分支。
Abstract
cao yuan ge pi (Dermacentor nuttalli),li shu yu ying pi ke (Ixodidae),ge pi shu (Dermacentor),fen bu an fan ,shi wo guo bei fang de ou de chang jian chong ,zai hei long jiang 、ji lin 、nei meng gu 、liao ning 、he bei deng de jun you fa xian ,tong shi zuo wei duo chong bing yuan ti de chuan bo mei jie ,wei xie ren lei he dong wu de jian kang 。Rickettsiashi yi lei yan ge bao nei ji sheng de ge lan shi yin xing xi jun ,zuo wei ji chui dong wu de bing yuan jun neng gou dao zhi ban zhen re deng duo chong ji bing ,shi chong yao de pi chuan bing yuan jun ,zai bu fen pi zhong ,Rickettsiahai ke yi zuo wei gong sheng jun cun zai 。yan jiu Rickettsiayu ji su zhu cao yuan ge pi de guan ji ,wei pi mei ji bing de fen bu 、kong zhi ji pi lei chong qun wei chuan deng yan jiu gong zuo di gong le li lun ji chu 。1、ben yan jiu tong guo PCRfa te yi xing kuo zeng Rickettsiade 16S rRNAji yin 、ompAji yin he gltAji yin pian duan ,jian ce si ge de li chong qun de cao yuan ge pi nei Rickettsiade gan ran qing kuang ,nei meng gu e er gu na 、ji lin yan bian 、hei long jiang da qing 、he bei xiao wu tai si ge de ou ,gong jian ce cao yuan ge pi yang ben 118tou 。ji yu san ge ji yin pian duan jian ce Rickettsiade jian chu lv yi zhi ,gan ran Rickettsiade yang ben shu liang wei 63tou ,zong gan ran lv wei 53.39%(63/118)。ji zhong ,nei meng gu de ou gan ran lv zui gao ,wei 80%(24/30)。he bei de ou gan ran lv wei 50%(15/30)、hei long jiang de ou wei 46.42%(13/28)、ji lin de ou gan ran lv zui di ,wei 36.67%(11/30)。2、shi yan jian ce dao de Rickettsiade 16S rRNAji yin 、ompAji yin he gltAji yin san ji yin pian duan ,jing BLASTbi dui hou ,jun yu lao shi li ke ci ti R.raoultiide xiang shi cheng du jun da dao 99%yi shang 。dui jian ce dao de Rickettsiagou jian ji tong fa yo shu ,ji tong fa yo fen xi xian shi ,ben shi yan jian ce dao de Rickettsiayu R.raoultiiju ji wei yi zhi ,yin ci ,que ding ben shi yan jian ce dao de Rickettsiawei R.raoultii。3、dui Rickettsiachong qun jin hang wei chuan duo yang xing fen xi ,Rickettsiachong qun cheng xian chu chan bei xing duo yang xing jiao gao (Hd:16S rRNA:0.70302;ompA:0.583;gltA:0.60665)he gan suan duo yang xing jiao di (Pi:16S rRNA:0.00165;ompA:0.00297;gltA:0.00249)de te dian 。ji chong qun wei chuan bian yi jiao wei feng fu ,wei chuan duo yang xing shui ping jiao gao ,sheng cun neng li ji dui huan jing bian hua de kuo ying xing jiang ,dan chong qun bian yi wei jing li chang shi jian de lei ji 。dui Rickettsiage de li chong qun jian jin hang chong qun wei chuan fen hua ji shu fen xi ,jie guo xian shi ,Rickettsiachong qun zheng ti de FSTzhi da yu 0.25,biao ming ge de li chong qun de Rickettsiazhi jian wei chuan fen hua cheng du jiao gao 。dui san ge ji yin shu ju jin hang AMOVAfen xi ,jie guo xian shi chong qun wei chuan bian yi jun lai zi chong qun nei bu 。gou jian chan bei xing wang lao tu he ji tong fa yo shu ,bu tong de li chong qun de chan bei xing xiang hu hun za ,wei an zhao bu tong de li chong qun jin hang ju lei ,wei xing cheng ming xian de de li ge ju 。4、fen bie shua qu cao yuan ge pi de xian li ti ji yin 16S rRNAji yin 、COIji yin he he tang ti ITS2ji yin ,yi Rickettsiade gan ran wei yi ju ,jiang cao yuan ge pi fen wei gan ran zu he wei gan ran zu 。dui liang zu chan bei xing fen bu jin hang fen xi ,jie guo xian shi ,gan ran zu he wei gan ran zu gong xiang de chan bei xing zhan zheng ti chong qun gong xiang chan bei xing shu mu jiao da (COI:64.70%;16S rRNA:41.17%;ITS2:60%)。dui liang zu de wei chuan duo yang xing he chong qun wei chuan duo yang xing jin hang dui bi fen xi ,COIji yin de fen xi jie guo xian shi ,gan ran zu zai chan bei xing duo yang xing (Hd)、he gan suan duo yang xing (Pi)、ping jun he gan suan cha yi (K)shang jun da yu wei gan ran zu 。jiang ge de li chong qun jun an zhao Rickettsiagan ran yu fou jin hang fen zu ,jin hang wei chuan duo yang xing fen xi ,he bei he nei meng gu de ou gan ran zu de chan bei xing duo yang xing 、he gan suan duo yang xing 、ping jun he gan suan cha yi jun da yu wei gan ran de ou de wei chuan duo yang xing shu zhi 。shui ming Rickettsiade gan ran dui cao yuan ge pi COIji yin de wei chuan duo yang xing chan sheng le yi ding ying xiang 。dui ge de li chong qun de cao yuan ge pi gan ran zu he wei gan ran zu jian de FSTzhi jin hang fen xi 。ITS2ji yin de jie guo xian shi ,nei meng gu de ou liang zu jian he he bei de ou liang zu jian de FSTzhi jie yu 0.05dao 0.15zhi jian ,biao ming nei meng gu he he bei de ou de gan ran zu yu wei gan ran zu zhi jian chan sheng le yi ding shui ping de wei chuan fen hua 。dui cao yuan ge pi gan ran zu yu wei gan ran zu jin hang chan bei xing wang lao tu he ji tong fa yo fen xi ,ji jie guo jun xian shi ,gan ran zu yu wei gan ran zu bing wei chan sheng du li de ju lei fen zhi 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自河北师范大学的樊媛媛，发表于刊物河北师范大学2019-06-20论文，是一篇关于草原革蜱论文,遗传多样性分析论文,河北师范大学2019-06-20论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自河北师范大学2019-06-20论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。