丁家玺:天麻种质资源的DNA指纹图谱研究论文

丁家玺:天麻种质资源的DNA指纹图谱研究论文

本文主要研究内容

作者丁家玺(2019)在《天麻种质资源的DNA指纹图谱研究》一文中研究指出:天麻(Gastrodiaelate BL.)属兰科(Orchidaceae)天麻属(Gastrodia R.Br.)多年生草本植物。天麻属下共有13个种,而药用植物天麻(G.elate)种下依据花序轴的不同又可分为5个变型(form)。分别是红天麻(G.elata Bl.f.elata)、绿天麻(G.elata Bl.f.viridis Makino)、乌天麻(G.elata Bl.f.glauca S.Chow)、黄天麻(G.elata Bl.f.flavida S.Chow)与松天麻(G.elata Bl.f.alba S.Chow)。根据中华人民共和国药典,天麻干燥块茎可入药,为中药天麻(GASTRODIAE RHIZOMA),是中国名贵中药材,性甘、平,归肝经,有息风止痉,平抑肝阳,祛风通络的功能,可用于小儿惊风,头痛眩晕,肢体麻木等症状。然而不同种质的天麻块茎形态差异微小,而药用成份含量上存在较大差异,种质资源混乱,亟待建立起一套高效准确的鉴别体系。本研究基于第二代测序技术建立了天麻的基因文库,筛选微卫星序列,并对微卫星位点的类型、丰度、长度、偏好性等进行了分析与比较;并为60条重复次数较高的微卫星序列设计了引物,运用4个种群80个样本进行了PCR扩增与聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。结果表明:(1)天麻基因组测序得到了61048条基因序列,检测微卫星位点12107个,其中二核苷酸重复最多,长度变异最大。(2)设计的60对微卫星引物中的20对能扩增出清晰条带并且有多态性,每个位点的复等位基因数(Na)在414之间,平均为8.40;多态性信息含量(PIC)平均为0.77。本研究开发的天麻微卫星分子标记为开展天麻遗传学研究及种质资源鉴定等工作奠定了基础。此外本研究应用开发的天麻SSR分子标记技术对天麻的4种变型(乌天麻、红天麻、黄天麻和绿天麻)、15个种群,共计150个样本进行了群体遗传分析,构建天麻种质资源的DNA指纹鉴定图谱,。研究结果表明:(1)7对SSR引物均能对天麻样本成功进行PCR扩增且多态性丰富,每对引物的等位基因数(Na)在712中间,平均为9.8571;引物多态信息含量(PIC)范围为0.68520.8345,平均为0.7839。(2)群体遗传分析结果表明,天麻在物种水平上和变型水平上均有较高的遗传多样性(物种水平:A=9.8571,H=0.8479,I=2.0548;变型水平:A=3.0565,H=0.5319,I=0.8916)。天麻在中国分布广泛,兰科植物起源较晚以及传粉方式可能是天麻遗传多样性丰富的原因。(3)分子方差分析结果显示,种群间和变型间均存在强烈的遗传分化(Fst=0.5557,Fct=0.3504)。生境片段化、遗传漂变是导致天麻遗传分化强烈的原因,并据此提出了保护策略。(4)种群聚类分析结果显示,相同变型的天麻种群首先聚在一起,4种变型被完全分开,SSR指纹图谱在变型水平上鉴定效率良好;从150个样本中共检测出有138种基因型,Simpson指数(D)为0.9923,说明SSR指纹图谱对天麻样本在个体水平上也有着良好的鉴定效率。本研究开发出的天麻SSR引物建立了天麻种质资源鉴定的指纹图谱体系,为天麻的种质资源选育和临床用药安全提供了重要技术支撑。

Abstract

tian ma (Gastrodiaelate BL.)shu lan ke (Orchidaceae)tian ma shu (Gastrodia R.Br.)duo nian sheng cao ben zhi wu 。tian ma shu xia gong you 13ge chong ,er yao yong zhi wu tian ma (G.elate)chong xia yi ju hua xu zhou de bu tong you ke fen wei 5ge bian xing (form)。fen bie shi gong tian ma (G.elata Bl.f.elata)、lu tian ma (G.elata Bl.f.viridis Makino)、wu tian ma (G.elata Bl.f.glauca S.Chow)、huang tian ma (G.elata Bl.f.flavida S.Chow)yu song tian ma (G.elata Bl.f.alba S.Chow)。gen ju zhong hua ren min gong he guo yao dian ,tian ma gan zao kuai jing ke ru yao ,wei zhong yao tian ma (GASTRODIAE RHIZOMA),shi zhong guo ming gui zhong yao cai ,xing gan 、ping ,gui gan jing ,you xi feng zhi jing ,ping yi gan yang ,qu feng tong lao de gong neng ,ke yong yu xiao er jing feng ,tou tong xuan yun ,zhi ti ma mu deng zheng zhuang 。ran er bu tong chong zhi de tian ma kuai jing xing tai cha yi wei xiao ,er yao yong cheng fen han liang shang cun zai jiao da cha yi ,chong zhi zi yuan hun luan ,ji dai jian li qi yi tao gao xiao zhun que de jian bie ti ji 。ben yan jiu ji yu di er dai ce xu ji shu jian li le tian ma de ji yin wen ku ,shai shua wei wei xing xu lie ,bing dui wei wei xing wei dian de lei xing 、feng du 、chang du 、pian hao xing deng jin hang le fen xi yu bi jiao ;bing wei 60tiao chong fu ci shu jiao gao de wei wei xing xu lie she ji le yin wu ,yun yong 4ge chong qun 80ge yang ben jin hang le PCRkuo zeng yu ju bing xi xian an ning jiao dian yong jian ce 。jie guo biao ming :(1)tian ma ji yin zu ce xu de dao le 61048tiao ji yin xu lie ,jian ce wei wei xing wei dian 12107ge ,ji zhong er he gan suan chong fu zui duo ,chang du bian yi zui da 。(2)she ji de 60dui wei wei xing yin wu zhong de 20dui neng kuo zeng chu qing xi tiao dai bing ju you duo tai xing ,mei ge wei dian de fu deng wei ji yin shu (Na)zai 414zhi jian ,ping jun wei 8.40;duo tai xing xin xi han liang (PIC)ping jun wei 0.77。ben yan jiu kai fa de tian ma wei wei xing fen zi biao ji wei kai zhan tian ma wei chuan xue yan jiu ji chong zhi zi yuan jian ding deng gong zuo dian ding le ji chu 。ci wai ben yan jiu ying yong kai fa de tian ma SSRfen zi biao ji ji shu dui tian ma de 4chong bian xing (wu tian ma 、gong tian ma 、huang tian ma he lu tian ma )、15ge chong qun ,gong ji 150ge yang ben jin hang le qun ti wei chuan fen xi ,gou jian tian ma chong zhi zi yuan de DNAzhi wen jian ding tu pu ,。yan jiu jie guo biao ming :(1)7dui SSRyin wu jun neng dui tian ma yang ben cheng gong jin hang PCRkuo zeng ju duo tai xing feng fu ,mei dui yin wu de deng wei ji yin shu (Na)zai 712zhong jian ,ping jun wei 9.8571;yin wu duo tai xin xi han liang (PIC)fan wei wei 0.68520.8345,ping jun wei 0.7839。(2)qun ti wei chuan fen xi jie guo biao ming ,tian ma zai wu chong shui ping shang he bian xing shui ping shang jun you jiao gao de wei chuan duo yang xing (wu chong shui ping :A=9.8571,H=0.8479,I=2.0548;bian xing shui ping :A=3.0565,H=0.5319,I=0.8916)。tian ma zai zhong guo fen bu an fan ,lan ke zhi wu qi yuan jiao wan yi ji chuan fen fang shi ke neng shi tian ma wei chuan duo yang xing feng fu de yuan yin 。(3)fen zi fang cha fen xi jie guo xian shi ,chong qun jian he bian xing jian jun cun zai jiang lie de wei chuan fen hua (Fst=0.5557,Fct=0.3504)。sheng jing pian duan hua 、wei chuan piao bian shi dao zhi tian ma wei chuan fen hua jiang lie de yuan yin ,bing ju ci di chu le bao hu ce lve 。(4)chong qun ju lei fen xi jie guo xian shi ,xiang tong bian xing de tian ma chong qun shou xian ju zai yi qi ,4chong bian xing bei wan quan fen kai ,SSRzhi wen tu pu zai bian xing shui ping shang jian ding xiao lv liang hao ;cong 150ge yang ben zhong gong jian ce chu you 138chong ji yin xing ,Simpsonzhi shu (D)wei 0.9923,shui ming SSRzhi wen tu pu dui tian ma yang ben zai ge ti shui ping shang ye you zhao liang hao de jian ding xiao lv 。ben yan jiu kai fa chu de tian ma SSRyin wu jian li le tian ma chong zhi zi yuan jian ding de zhi wen tu pu ti ji ,wei tian ma de chong zhi zi yuan shua yo he lin chuang yong yao an quan di gong le chong yao ji shu zhi cheng 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自陕西理工大学的丁家玺,发表于刊物陕西理工大学2019-07-06论文,是一篇关于天麻论文,指纹图谱论文,陕西理工大学2019-07-06论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自陕西理工大学2019-07-06论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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