基于表达谱和遗传学数据的老年痴呆症（Alzheimer’s Disease）致病机理的网络分析

论文摘要

Alzheimer’ sDisease(AD)是最常见的神经退行性疾病,全世界有超过3000万的AD病人。AD典型的症状是记忆的逐渐丧失和认知功能的减退,目前还没有有效的治疗手段。AD有两个典型的组织病理学特征,神经细胞外的Aβ沉淀和神经细胞内的神经纤维缠结。AD的致病机理还不是很清楚,但围绕着其致病机理形成了很多假说,其中The Amyloid Cascade Hypothesis是一个著名的假说,核心是Aβ沉淀诱导的细胞毒性导致神经细胞的凋亡。研究AD的致病机理对AD的预防和治疗有重要的作用,基于病例一对照的基因关联分析和基于芯片的表达谱分析手段被用来分析AD潜在的致病机理。目前,网络分析已成为系统生物学的一个重要研究手段,将其用于分析AD相关的表达谱和基因组数据,有助于更好的理解AD的致病机理。在论文第一部分,我们开发了用于网络构建和网络分析的工具,通过广泛收集并整合了多种相互作用数据形成了后台数据库,利用脚本语言PHP实现了网络构建和分析流程,用HTML和Javascript开发了Web客户端。在论文第二部分,我们基于这个工具初步分析了AD的转录组和基因组数据,所得结果和AD现有的几个假说比较吻合,说明我们的工具是很有效的。

论文目录

论文摘要

英文摘要

第一部分：开发网络构建和网络分析工具

摘要

Abstract

二、引言

三、材料与方法

1. 工具概览

2. 数据来源

3. 构建数据库

3.1 基因ID转换

3.2 数据表的设计

4. 开发服务器端

4.1 网络构建算法

4.2 功能富集方法

5. 开发客户端

四、结果

五、讨论

第二部分：AD致病机理的探索

摘要

Abstract

二、引言

三、材料与方法

1. 实验数据

2. 寻找差异表达基因

2.1 芯片的预处理

2.2 寻找差异表达基因

四、结果

1. 构建种子基因集

2. AD参照网络

2.1 构建AD参照网络

2.2 AD参照网络初步分析

2.3 AD背景网络功能模块

2.3.1 模块划分

2.3.2 AD六个不同脑区模块被扰动情况分析

2.3.3 受衰老影响的模块

3. 构建AD功能蛋白质相互作用网络

3.1 功能蛋白质相互作用网络的构建

3.2 KEGG pathway富集

3.2.1 富集结果

3.2.2 富集结果的解释

3.3 寻找调控网络的上游转录因子

3.3.1 转录因子的筛选

3.3.2 寻找转录因子和AD相关的证据

五、讨论

参考文献

致谢

相关论文文献

[1].企业营销网络构建及管理问题探究[J]. 内蒙古煤炭经济 2019(21)
[2].利用模拟软件改进中职网络构建课程教学的探索[J]. 中国信息技术教育 2014(20)
[3].高三数学有效复习策略的思考与实践[J]. 中学数学杂志 2017(09)
[4].多元构建,优化毕业班数学复习教学[J]. 学苑教育 2017(18)
[5].安全网络构建中防火墙技术的研究与应用[J]. 中国新通信 2016(01)
[6].国家自主创新示范区创新治理行动者网络构建[J]. 新视野 2020(01)
[7].员工为什么热衷于构建职场关系网络——基于特质激发理论的实证研究[J]. 外国经济与管理 2015(06)
[8].12315消费维权网络构建的问题与对策研究[J]. 财经界(学术版) 2014(20)
[9].节能背景下区域物流网络构建研究[J]. 物流技术 2015(07)
[10].浅析《网络构建与管理》课程的开设[J]. 天津职业院校联合学报 2015(11)
[11].寒淫致病及附子干预的转录组生物学网络构建研究[J]. 辽宁中医杂志 2013(05)
[12].生产性服务业视角下的城市网络构建研究进展[J]. 地理科学进展 2013(07)
[13].面向岗位的网络构建实习方案研究[J]. 中国电力教育 2011(14)
[14].浙江省腹膜透析医疗服务网络构建的SWOT分析[J]. 医学与社会 2011(06)
[15].基于位置的机构合作网络构建方法研究[J]. 地理信息世界 2020(01)
[16].浅析《网络构建与管理》课程的开设[J]. 天津职业院校联合学报 2016(03)
[17].中职《中小型网络构建与管理》课程开发与建设研究[J]. 电脑知识与技术 2016(03)
[18].基于工作过程的中小型网络构建与管理课程设计探讨[J]. 新课程(教研) 2011(06)
[19].福建省产业集群跨区域网络构建概况分析[J]. 长沙民政职业技术学院学报 2014(01)
[20].基于我国当代制度特征的创业网络构建探究[J]. 企业技术开发 2014(15)
[21].基于手机的移动互联学习网络构建策略[J]. 科技经济市场 2011(11)
[22].社会治理共同体的关系网络构建[J]. 阅江学刊 2020(01)
[23].基于GIS的海岛游憩网络构建研究[J]. 旅游纵览(下半月) 2016(10)
[24].高校图书馆协同创新网络构建的角色定位及路径选择[J]. 中国管理信息化 2015(02)
[25].浅析初中化学知识网络构建[J]. 学周刊 2015(19)
[26].创新型企业创新网络构建及其治理研究[J]. 特区经济 2009(01)
[27].浅析微型无人茶店的计算机系统化网络构建[J]. 福建茶叶 2018(11)
[28].高校财务管理信息系统网络构建及其实践[J]. 教育现代化 2016(25)
[29].利用计算机网络构建人力资源信息系统的实践探讨[J]. 计算机光盘软件与应用 2014(07)
[30].民航旅客社会网络构建方法研究[J]. 计算机仿真 2013(06)

标签：网络分析论文; 阿尔兹海默症论文; 网络构建工具论文;

基于表达谱和遗传学数据的老年痴呆症（Alzheimer’s Disease）致病机理的网络分析

论文摘要

论文目录

相关论文文献

猜你喜欢