聂璐:插入序列IS6100介导DNA序列转移的机制研究论文

聂璐:插入序列IS6100介导DNA序列转移的机制研究论文

本文主要研究内容

作者聂璐,吴奎海,陈文静,李炜煊(2019)在《插入序列IS6100介导DNA序列转移的机制研究》一文中研究指出:目的插入序列IS6100与耐药基因转移密切相关,本研究旨在初步探究IS6100转移DNA序列的机制。方法以Genbank库中已有序列中含两个及两个以上拷贝IS6100序列的质粒或者染色体为研究对象,通过生物信息分析的方法分析各IS6100侧翼的靶位点重复序列(TSD),推测该元件转座酶可能的工作机制。结果共检索到22条序列,含5条染色体、16条质粒以及1条定位未知的转座子序列。其中有13条序列(59%)来自鞘脂菌属细菌,余下均来自条件致病菌的染色体或质粒。在鞘脂菌属细菌TKS中,IS6100拷贝数可多达29个,且IS6100和鞘脂菌属细菌基因组的GC%均接近60%。共有35条不同的8bpTSD在这些菌株中出现的频率为2~8次。TSD的GC%含量在13%~100%,有87%(30/35)的TSD序列GC%含量均≥50%。这些TSD可同时出现在同一菌株的染色体或质粒内部、同一菌株的染色体和质粒之间、不同菌株的染色体和质粒间。结论 IS6100的产生菌可能为鞘脂菌属细菌。IS6100的作用靶位点没有高度选择性,但仍倾向作用于高GC%含量位点。两个IS6100可以形成复合转座子,转移其间的DNA序列,这些转座事件可以发生在分子间和分子内。

Abstract

mu de cha ru xu lie IS6100yu nai yao ji yin zhuai yi mi qie xiang guan ,ben yan jiu zhi zai chu bu tan jiu IS6100zhuai yi DNAxu lie de ji zhi 。fang fa yi Genbankku zhong yi you xu lie zhong han liang ge ji liang ge yi shang kao bei IS6100xu lie de zhi li huo zhe ran se ti wei yan jiu dui xiang ,tong guo sheng wu xin xi fen xi de fang fa fen xi ge IS6100ce yi de ba wei dian chong fu xu lie (TSD),tui ce gai yuan jian zhuai zuo mei ke neng de gong zuo ji zhi 。jie guo gong jian suo dao 22tiao xu lie ,han 5tiao ran se ti 、16tiao zhi li yi ji 1tiao ding wei wei zhi de zhuai zuo zi xu lie 。ji zhong you 13tiao xu lie (59%)lai zi qiao zhi jun shu xi jun ,yu xia jun lai zi tiao jian zhi bing jun de ran se ti huo zhi li 。zai qiao zhi jun shu xi jun TKSzhong ,IS6100kao bei shu ke duo da 29ge ,ju IS6100he qiao zhi jun shu xi jun ji yin zu de GC%jun jie jin 60%。gong you 35tiao bu tong de 8bpTSDzai zhe xie jun zhu zhong chu xian de pin lv wei 2~8ci 。TSDde GC%han liang zai 13%~100%,you 87%(30/35)de TSDxu lie GC%han liang jun ≥50%。zhe xie TSDke tong shi chu xian zai tong yi jun zhu de ran se ti huo zhi li nei bu 、tong yi jun zhu de ran se ti he zhi li zhi jian 、bu tong jun zhu de ran se ti he zhi li jian 。jie lun IS6100de chan sheng jun ke neng wei qiao zhi jun shu xi jun 。IS6100de zuo yong ba wei dian mei you gao du shua ze xing ,dan reng qing xiang zuo yong yu gao GC%han liang wei dian 。liang ge IS6100ke yi xing cheng fu ge zhuai zuo zi ,zhuai yi ji jian de DNAxu lie ,zhe xie zhuai zuo shi jian ke yi fa sheng zai fen zi jian he fen zi nei 。

论文参考文献

  • [1].酶促扩增DNA序列新技术——聚合酶链反应(PCR)[J]. 王勤.  遗传与疾病.1988(04)
  • [2].HCV阴性者外周血单核细胞的染色体外环状DNA中与HCV同源的DNA序列(英文)[J]. Reinhard H.DENNIN,Jian-er WO.  Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology).2019(08)
  • [3].一个深度学习DNA序列特异性的预测模型[J]. 黄立群,丁雪松,张步忠,吕强.  小型微型计算机系统.2018(11)
  • [4].DNA序列分类数学模型[J]. 蒋利平,叶青,宋军锋,杨锦华.  新疆师范大学学报(自然科学版).2001(02)
  • [5].DNA序列比较分析系统的开发设计[J]. 戴银飞,戴银春.  吉林医学信息.2008(Z2)
  • [6].基于最长公共子序列的DNA序列相似性分析[J]. 吴东根,周小安.  智能计算机与应用.2018(06)
  • [7].同源DNA序列中间隔位点的核苷酸最近邻插补[J]. 秦雪瑞,刘雄恩.  福建农林大学学报(自然科学版).2018(05)
  • [8].基于多尺度熵的DNA序列相似性分析[J]. 张静,周小安,赵宇.  智能计算机与应用.2019(01)
  • [9].DNA的二维图表示[J]. 雷勇,王振国.  吕梁高等专科学校学报.2009(01)
  • [10].基于分治算法的DNA序列比对成本模型[J]. 刘欣睿.  数码世界.2019(03)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国医药生物技术的聂璐,吴奎海,陈文静,李炜煊,发表于刊物中国医药生物技术2019年04期论文,是一篇关于转座子论文,基因转移论文,水平论文,耐药机制论文,中国医药生物技术2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国医药生物技术2019年04期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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