宁夏地区主要肉羊品种遗传多样性分析及群体间杂种优势预测

论文摘要

本研究采用典型群随机抽样方法,选用位于不同染色体上、多态性较高的7个微卫星位点,从分子水平上对宁夏牧区6个主要肉羊品种群体:陶赛特、得克塞尔、萨福克、滩羊、小尾寒羊、滩寒杂种羊的遗传多样性进行研究,探讨了它们之间群体内、群体间的遗传变异及亲缘关系,并进行了杂种优势的预测。研究结果如下:1.7个微卫星座位中共检测到105个等位基因,每个座位在每个群体都检测到5个以上等位基因。其中以MAF70座位检测到的等位基因数目最多,为20个;其次是OarAE101座位,为17个等位基因;等位基因数目最少的座位为BMS1714座位,检测到12个等位基因。对受试羊进行有效等位基因分析表明:7个座位检测到的平均有效等位基因数都超过4个,在陶赛特检测到的有效等位基因数目最多,为8.2216;在滩寒杂种羊检测到的有效等位基因数目最少,为5.4633。2.对受试羊进行优势等位基因和稀有等位基因分析,结果表明:7个微卫星位点都有优势等位基因存在,有5个位点检测到稀有等位基因。本研究中7个微卫星座位均为高度多态座位,多态信息含量在0.7000～0.8000之间,其中MAF70座位的多态信息含量最高,达到0.8621,OarAE101座位的多态信息含量最小,为0.7189。在6个群体中,陶赛特的多态信息含量最高,为0.8546,滩羊的多态信息含量最低,为0.7188。以等位基因频率为基础,得出位点的平均杂合度在0.2638～0.4885之间,品种的平均杂合度在0.2901～0.4534之间,属于中度杂合座位和中度杂合品种。3.F-统计分析表明:6个绵羊群体内近交程度较高,,6.98%的遗传变异来自群体间,而93.02%遗传变异是由于各群体内个体间的差异引起的。3个国内绵羊群体和3个国外绵羊群体之间的基因分化系数较它们各自群体间的基因分化系数大,国外群体与国内群体间的基因流动比国内绵羊群体间的基因流动小。4.运用DA遗传距离和DC遗传距离,采用UPGMA法聚类结果表明:6个绵羊群体明显地被分为两大类:一类为引进的国外绵羊群体,得克塞尔与萨福克聚在一起后再与陶赛特聚;另一类为国内绵羊群体,滩羊和小尾寒羊聚为一类后与滩寒杂种羊相聚。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第一部分：文献综述
• 1. 家畜遗传多样性的概念及其研究意义
• 1.1 家畜遗传多样性的概念
• 1.2 研究遗传多样性的意义
• 2. 家畜遗传多样性的评估方法
• 2.1 限制性片段长度多态（RFLP）标记
• 2.2 随机引物扩增多态（RAPD）标记
• 2.3 扩增片段长度多态（AFLP）标记
• 2.4 微卫星标记（SSR）
• 2.5 单链构像多态（SSCP）标记
• 3. 杂种优势理论及其预测方法
• 3.1 杂种优势理论
• 3.2 杂种优势的机理
• 3.3 杂种优势预测的方法
• 3.3.1 地理距离与杂种优势
• 3.3.2 性状遗传距离与杂种优势
• 3.3.3 同工酶遗传距离与杂种优势
• 3.3.4 分子标记遗传距离与杂种优势
• 4. 微卫星 DNA 标记
• 4.1 微卫星 DNA 的含义及其分布
• 4.2 微卫星 DNA 的遗传特点
• 4.3 微卫星 DNA 的优点
• 5. 本研究的目的和意义
• 第二部分：试验部分
• 1 材料与方法
• 1.1 试验绵羊耳组织样的采集
• 1.2 试验方法
• 1.2.1 主要仪器设备
• 1.2.2 主要试剂
• 1.2.3 主要溶液的配制
• 1.2.4 基因组 DNA 的提取
• 1.3 微卫星多态性的测定
• 1.3.1 微卫星引物的选择
• 1.3.2 PCR 反应体系、反应程序
• 1.3.3 PCR 扩增产物的检测与结果记录
• 1.4 统计分析
• 1.4.1 群体遗传学一般统计学指标
• 1.4.2 遗传分化度量及基因流分析
• 1.4.3 遗传距离
• 1.4.4 聚类分析
• 2. 结果与分析
• 2.1 绵羊基因组 DNA 提取结果
• 2.2 微卫星引物的 PCR 扩增结果与检测
• 2.2.1 PCR 扩增产物的琼脂糖检测
• 2.2.2 PCR 扩增产物的 PAGE 检测
• 2.3 7 个微卫星座位在6 个绵羊群体中的等位基因频率
• 2.4 6 个绵羊群体各座位的优势等位基因和特有等位基因频率
• 2.5 6 个绵羊群体的杂合度和多态信息含量
• 2.6 6 个绵羊群体的有效等位基因数（Ne）分析
• 2.7 基因流分析及遗传分化度量
• 2.7.1 6 个绵羊群体间的基因流分析
• 2.7.2 F-统计量
• 2.8 6 个绵羊群体间的遗传距离分析
• 2.9 聚类分析
• 2.10 群体间遗传距离与杂种优势
• 3. 讨论
• 3.1 关于抽样与样本含量问题
• 3.2 关于微卫星座位的选择问题
• 3.3 DNA 提取的注意事项
• 3.4 关于群体的遗传变异
• 3.5 关于群体间遗传分化与基因流
• 3.6 关于聚类分析与品种选育背景的关系
• 3.7 有关杂交效果的预测
• 4. 结论
• 参考文献
• 附表1 6 个绵羊群体7 个微卫星座位的等位基因频率
• 致谢
• 攻读学位期间撰写和发表的学术论文目录