幽门螺杆菌克拉霉素耐药菌株鉴定及23S rRNA全基因生物信息学研究

幽门螺杆菌克拉霉素耐药菌株鉴定及23S rRNA全基因生物信息学研究

论文摘要

目的:分离培养胃粘膜幽门螺旋杆菌,鉴定并进行克拉霉素耐药性分析;分析克拉霉素耐药菌株与敏感菌株之间23S rRNA基因的DNA序列差异,进行生物信息学研究,探索23S rRNA基因突变在幽门螺旋杆菌克拉霉素耐药产生过程中的作用。方法:将胃镜活检粘膜标本,接种于含7%-10%羊血H.pylori选择性培养基,37℃微需氧环境培养3-5天,分离H.pylori菌株,采用传统方法和UreA基因PCR扩增鉴定。克拉霉素药敏试验采用E-test法,筛选出耐药菌株和敏感菌株。提取H.pylori菌株基因组DNA,PCR扩增23S rRNA全基因,测序并采用Vector NIT Suite 9.0进行比对分析,MFold预测野生型和变异型23S rRNA的二级结构。结果:220例胃粘膜标本H.pylori培养阳性率为30.45%(67/220);胃炎培养阳性率为20.15%(27/134);消化性溃疡培养阳性率为48.72%(38/78);胃癌培养阳性率为25.00%(2/8);消化性溃疡组H.pylori培养阳性率明显高于胃炎组和胃癌组。67例H.pylori菌株克拉霉素耐药23株,占34.33%(23/67);敏感株44株,占65.67%(44/67);未发现克拉霉素中介株。胃炎组、消化性溃疡组和胃癌组克拉霉素耐药率分别为29.63%(8/27)、36.84%(14/38)和50.00%(1/2)。16株克拉霉素耐药H.pylori菌株2143位点A>G突变5株,突变率为31.25%:2182位点C>T突变2株,突变率为12.5%;发现一个新的突变点C588T在6株(37.5%)耐药株中出现,在耐药株中具有高出现频率而且该6株菌未见其它已知突变。结论:消化性溃疡组幽门螺杆菌培养阳性率和克拉霉素耐药率明显高于胃炎组。本地区分离的克拉霉素耐药幽门螺杆菌菌株23S rRNA基因存在A2143 G和C2182T位点突变,C588T变异点可能是克拉霉素耐药新的突变位点。

论文目录

  • 中英文对照及缩略语
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 第一部分 幽门螺杆菌培养、鉴定及药敏分析
  • 1.材料和方法
  • 2.结果
  • 3.讨论
  • 4.参考文献
  • 第二部分 23S rRNA全基因生物信息学研究
  • 1.材料和方法
  • 2.结果
  • 3.讨论
  • 4.参考文献
  • 结论
  • 综述
  • 致谢
  • 附录一 幽门螺杆菌23S rRNA全基因比对
  • 附录二 幽门螺杆菌23S rRNA全基因测序
  • 相关论文文献

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