玉米HD-Zip转录因子家族抗旱相关基因的鉴定及Zmhdz10功能分析

玉米HD-Zip转录因子家族抗旱相关基因的鉴定及Zmhdz10功能分析

论文摘要

玉米是世界上重要的粮食作物之一,干旱、盐渍、低温等非生物胁迫对玉米的生长造成了严重的影响,也是限制其产量的主要胁迫因素,抗逆育种一直是重要的育种目标。挖掘抗逆相关功能基因并利用这些基因培育抗逆新品种是应对逆境胁迫,提高玉米产量的最为有效途径。研究表明,转录因子在提高作物对胁迫的耐受性过程中起到了重要作用。过量表达特定的胁迫应答转录因子可以调控多个下游抗逆功能基因的同时表达,从而使作物获得良好的综合改良效果。目前,这种方法已经成为植物抗逆遗传改良育种中的研究热点。同源异型-亮氨酸拉链(HD-Zip)蛋白是高等植物特异的一类转录因子,参与了植物的胁迫应答和生长发育调控。因此,挖掘胁迫应答HD-Zip基因对开展玉米抗逆改良育种具有重要的意义。本研究运用生物信息学的方法对玉米全基因组HD-Zip基因进行鉴定,分析这些基因的结构特点、进化关系以及干旱诱导表达模式,并通过过量表达技术对玉米Zmhdz10基因在植物非生物胁迫应答过程中的功能及作用机制进行了研究,获得了如下主要结果:1.通过Blast同源搜索,共鉴定了55个非重复的玉米HD-Zip基因家族成员并从基因结构和进化等方面进行了分析。研究发现,玉米HD-Zip家族的大部分基因序列高度保守,与拟南芥和水稻HD-Zip基因在结构上不存在明显差异。根据进化关系,55个玉米HD-Zip基因被进一步分为4个亚族(I-IV)。染色体定位分析显示,55个基因在10条染色体上的分布是非随机的。对玉米HD-Zip基因复制事件进行分析,发现参与片段复制的基因占玉米HD-Zip基因总数的62%,表明片段复制对玉米HD-Zip基因数量的扩张起到了重要作用。2.对17个HD-Zip I基因上游2kb启动子序列的抗逆相关顺式作用元件(ABRE,LTRE和DRE)进行了分析,发现除Zmhdz16外,其余16个基因的启动子区域均含有1到多个抗逆相关顺式作用元件。对复制基因启动子区域内的3种顺式作用元件的分布进行比较,发现三种顺式作用元件在复制基因启动子区域内的数量和位置有较大的差异。利用荧光定量PCR方法对HD-Zip I基因的干旱诱导表达模式进行了分析,发现有12个基因的表达显著上调,其它5个基因表达下调。对复制基因的干旱诱导表达模式进行比较,发现复制基因的表达模式总体较为相似,说明这些基因可能存在着基因功能的冗余现象。3.根据进化关系和干旱诱导表达模式,筛选了一个受干旱强烈诱导表达的候选基因Zmhdz10并从玉米自交系B73中克隆了该基因。序列分析显示,Zmhdz10基因cDNA全长为825bp,编码274个氨基酸,与玉米B73数据库中公布的序列完全一致。进一步的表达分析发现Zmhdz10的表达还受到盐和外源ABA的诱导。组织表达模式分析显示,Zmhdz10在根、茎、叶、果穗、雄花序、幼芽和花丝7个组织中均有表达,其中在叶中的表达量最高。通过基因枪轰击洋葱表皮细胞的瞬时表达分析显示,Zmhdz10-GFP融合表达蛋白定位在细胞核中。酵母杂交实验表明,Zmhdz10在酵母细胞中能够激活报告基因的表达,能够对反向重复序列CAAT(A/T)ATTG发生特异性的结合。4.过量表达Zmhdz10的转基因植株在生长表型上与对照植株没有明显差异。在干旱和盐胁迫处理后,Zmhdz10转基因水稻表现出对胁迫较强的耐受性。通过对相对电解质渗透率、丙二醛含量和脯氨酸含量等生理生化指标进行测定,发现转基因植株在胁迫条件下的相对电解质渗透率和丙二醛含量低于野生型植株,脯氨酸含量高于野生型植株。另外,ABA敏感性实验显示Zmhdz10过量表达转基因植株显著提高了对外源ABA的敏感性。5. Zmhdz10过量表达的转基因拟南芥植株同样表现出对干旱和盐胁迫较强的适应性和忍耐力。通过对P5CS1、RD22、RD29B和ABI14个胁迫/ABA应答功能基因的表达分析发现,在干旱条件下,这些抗逆功能基因在转基因拟南芥中的表达量显著高于野生型植株,表达被激活。对参与非依赖ABA信号传导途径的ERD1表达分析显示,该基因在野生型和转基因植株中的表达没有显著差异。综上所述,本研究通过Blast同源搜索,在玉米全基因组水平上共鉴定了55个HD-Zip基因。根据基因结构、进化和干旱诱导表达模式等分析结果,克隆了Zmhdz10基因并对其分子生物学特性进行分析。过量表达该基因显著提高了转基因植株耐旱和耐盐性,为利用基因工程的方法改良作物的抗逆性提供了优良的基因资源。同时,转基因植株对ABA的敏感性的增加和胁迫/ABA应答功能基因的表达上调,表明该基因主要通过ABA信号传导途径调控抗逆功能基因的表达,从而提高转基因植株的耐旱和耐盐性。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 目录
  • 插图和附表清单
  • 第一章 文献综述
  • 1.1 植物对非生物胁迫的应答机制
  • 1.1.1 非生物逆境下植物诱导表达的基因及其产物
  • 1.1.2 非生物逆境下植物应答信号传导通路
  • 1.1.3 非生物逆境下ABA的信号途径
  • 1.2 逆境相关转录因子的研究进展
  • 1.2.1 转录因子的结构特征
  • 1.2.2 转录因子的分类
  • 1.2.3 植物转录因子的功能
  • 1.3 植物HD-Zip转录因子的研究进展
  • 1.3.1 植物HD-Zip转录因子的结构特征及类型
  • 1.3.2 植物HD-Zip转录因子的相关功能
  • 1.4 植物基因功能的研究策略
  • 1.4.1 基因功能丧失方法
  • 1.4.2 基因功能增加方法
  • 1.5 生物信息学的研究进展
  • 1.5.1 生物信息学数据库
  • 1.5.2 生物信息学的主要研究内容
  • 引言
  • 第二章 玉米HD-Zip转录因子家族抗旱相关基因的鉴定
  • 2.1 材料与方法
  • 2.1.1 植物材料
  • 2.1.2 酶及试剂
  • 2.1.3 仪器设备
  • 2.1.4 研究方法
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 玉米全基因组HD-Zip转录因子的鉴定和分类
  • 2.2.2 玉米HD-Zip转录因子的结构及进化分析
  • 2.2.3 玉米HD-Zip转录因子的保守基序分析
  • 2.2.4 玉米HD-Zip转录因子的定位和基因复制
  • 2.2.5 玉米HD-Zip基因启动子逆境相关顺式作用元件的鉴定
  • 2.2.6 玉米HD-Zip I基因干旱诱导表达模式的分析
  • 2.3 讨论
  • 第三章 Zmhdz10基因的克隆及分子特征分析
  • 3.1 材料与方法
  • 3.1.1 植物材料
  • 3.1.2 菌株和载体
  • 3.1.3 酶及试剂
  • 3.1.4 引物合成和测序
  • 3.1.5 仪器设备
  • 3.1.6 研究方法
  • 3.2 结果与分析
  • 3.2.1 Zmhdz10基因的克隆和序列分析
  • 3.2.2 Zmhdz10基因的诱导表达和组织表达模式
  • 3.2.3 Zmhdz10的亚细胞定位分析
  • 3.2.4 Zmhdz10的转录活性分析
  • 3.2.5 Zmhdz10的DNA结合特性分析
  • 3.3 讨论
  • 第四章 Zmhdz10基因的功能分析
  • 4.1 材料与方法
  • 4.1.1 植物材料
  • 4.1.2 菌株和载体
  • 4.1.3 酶及试剂
  • 4.1.4 仪器设备
  • 4.1.5 研究方法
  • 4.2 结果与分析
  • 4.2.1 Zmhdz10过量表达转基因水稻的获得
  • 4.2.2 Zmhdz10转基因水稻的分子特征分析
  • 4.2.3 Zmhdz10转基因水稻的抗旱性分析
  • 4.2.4 Zmhdz10转基因水稻的耐盐性分析
  • 4.2.5 Zmhdz10转基因水稻的ABA敏感性实验
  • 4.2.6 Zmhdz10转基因拟南芥的抗逆性分析
  • 4.2.7 Zmhdz10转基因植株胁迫/ABA响应基因的表达分析
  • 4.3 讨论
  • 结论
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 作者简介
  • 博士期间发表的主要研究论文
  • 相关论文文献

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