小麦条锈病抗性相关基因的克隆

小麦条锈病抗性相关基因的克隆

论文摘要

小麦抗条锈病基因Yr26能高抗多个条锈生理小种,克隆该基因及其相关基因具有重要意义。基因Yr26已被定位到小麦染色体臂1BS上,本研究根据小麦EST物理图谱,在小麦染色体第一部分同源群短臂上查找与抗病相关的EST序列23条,设计相应的特异引物以寻找Yr26的候选基因。用这23对引物以感病亲本扬麦5号、抗病亲本92R137、抗池、感池为模板进行PCR扩增,其中源于EST序列BE440256的特异引物BE446250扩增出的条带,用HaeⅢ酶切后出现了与Yr26感病等位基因连锁的条带。将同样来源于EST(BE446250)的巢式引物以扬麦5号、92R137的cDNA为模板进行RT-PCR,分别在扬麦5号和92R137中扩增出283bp和296bp的条带。将获得的cDNA片段作为探针进行Southern杂交,在抗病材料中出现了特异的杂交带。用引物BE446250对小麦易位系92R137的TAC库进行筛选,得到该基因D组拷贝的阳性克隆,并测得其中部分序列。根据所得序列设计引物,其中引物XB-10能扩增出追踪Yr26的特异条带。用该引物扩增扬麦5号×92R137的F2(555个单株)群体的基因组DNA,结合田间鉴定结果,综合分析表明该F2群体中有16个单株发生了交换,与Yr26的遗传距离为2.7cM。通过BLAST分析发现该特异片段与大麦的3个NBS-LRR同源基因的同源性都在90%以上,有明显的NB-ARC结构。RARl和SGT1是两个在真核生物中非常保守的基因,这两个基因共同或独立的参与了许多抗病基因的抗病过程,本研究根据小麦ESTs序列中与大麦中RAR1和SGT1同源性较高的EST为基础设计特异引物,以抗条锈病易位系的cDNA为模板进行RT-PCR扩增,得到了小麦RAR1和SGR1的cDNA片段,用RACE方法获得这两个基因的全长,它们的氨基酸序列与大麦RAR1(AAB96982.1)和SGT1(AF523682.1)序列同源性分别为97%和93%,并对这两个基因的氨基酸序列进行了比较分析。利用基因枪将钨粉包裹的表达载体220-Ta-RAR1-GFP轰击洋葱表皮进行瞬间表达,观测到Ta-RAR1蛋白主要分布在细胞质膜上和细胞核膜上。对条锈菌诱导后的抗病材料92R137、感病材料扬麦5号进行半定量分析,结果表明在抗、感材料中RAR1基因都受诱导,均在24h时表达量达到最大,随后表达量下降。而SGT1在条锈菌诱导前后表达量没有改变,为组成型表达。在白粉病诱导后的抗病簇毛麦中,RAR1、SGT1均被诱导表达。本研究还利用大麦条斑花叶病毒(BSMV)构建了小麦RAR1、SGTl的VIGS载体,将进一步研究小麦的这两个基因有没有参与到Yr26和Pm21的抗病反应中。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一部分 文献综述
  • 一、小麦抗锈病基因的遗传研究
  • 1.抗病基因的来源
  • 2 遗传基础
  • 2.1 抗条锈病基因的显隐性
  • 2.2 苗期抗性和成株期抗性
  • 2.3 温度对抗性基因表达的影响
  • 2.4 小麦抗条锈病微效基因的研究
  • 3 展望
  • 二、植物抗病基因研究进展
  • 1、植物抗病基因结构与功能
  • 2 抗病基因三级结构的改变对其活性的影响
  • 3 抗病基因的进化
  • 3.1 基因复制
  • 3.2 重复序列交换改变基因结构
  • 3.3 异位重组
  • 3.4 双特异性抗病基因的产生
  • 3.5 转座子与R基因的进化
  • 4 基因对基因假说及其模型
  • 4.1 基因对基因假说
  • 4.2 受体-配体模型
  • 4.3 看守模型
  • 三 植物抗病基因的克隆
  • 1 转座子标签技术
  • 2 图位克隆技术
  • 2.1 小麦高密度遗传作图的基础
  • 2.2 小麦染色体步移的基础:大片段插入文库
  • 2.3 小麦抗病基因的分离:染色体步移
  • 2.4 水稻基因组在小麦基因克隆中的应用
  • 3 根据基因功能保守域进行基因的克隆
  • 4 小麦抗条锈病基因克隆的研究进展
  • 第二部分 研究报告
  • 前言
  • 一、材料与方法
  • 1、植物材料
  • 2、方法
  • 2.1 植物基因组DNA提取(钠盐法)
  • 2.2 总RNA提取
  • 2.3 半定量PCR
  • 2.4 RACB
  • 2.5 产物的回收和克隆
  • 2.6 Southern杂交
  • 2.7 PAGE电泳和染色
  • 二、结果与分析
  • 1.小麦染色体第一群短臂上与抗病相关的EST的查找
  • 1.1 在小麦基因组DNA中的扩增
  • 1.2 在小麦cDNA中的扩增
  • 1.3 利用中国春缺体—四体定位
  • 1.4 Southern杂交
  • 1.5 易位系92R137的TAC库的筛选
  • 1.6 TAC质粒序列分析
  • 1.7 STS引物的设计和遗传作图
  • 2 Ta-RAR1和Ta-SGT1基因及推断的蛋白结构比较分析
  • 2.1 RAR1、SGT1的cDNA克隆与序列分析
  • 2.2 TaRAR1和TaSGT1基因及推断的蛋白结构比较分析
  • 2.2.1 TaRAR1推断的蛋白结构比较分析
  • 2.2.2 TaSGT1基因及推断的蛋白结构比较分析
  • 2.3 TaRAR1、TaSGT1表达受条锈菌和白粉菌诱导的影响
  • 2.3.1 TaRAR1、TaSGT1表达受条锈菌诱导的影响
  • 2.3.2 TaRAR1、TaSGT1表达受白粉菌诱导的影响
  • 2.4 TaRAR1、TaSGT1的VIGS载体构建
  • 2.5 RAR1融合载体的构建及瞬间表达
  • 三、讨论
  • 1、小麦EST的利用
  • 2、小麦RAR1基因(Ta-RAR1)
  • 3、小麦SGT1基因(Ta-SGT1)
  • 全文结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 相关论文文献

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