CGS1、DHDPS基因克隆及其作为转基因植物筛选标记的研究

CGS1、DHDPS基因克隆及其作为转基因植物筛选标记的研究

论文摘要

在植物基因工程中,需要用到筛选标记以方便筛选转化子,随着转基因植物的商品化,其安全性问题也引起了人们的高度重视,其中主要涉及筛选标记的安全性。目前,植物基因工程中使用的筛选标记主要是编码抗生素抗性或除草剂抗性蛋白的基因,这些基因存在安全性方面的问题,为了提高转基因植物的安全性,人们开始寻找生物安全的筛选标记。本研究分别从拟南芥(Arabidopsis thaliana)和烟草(Nicotiana tabacum L.cv)中克隆得到甲硫氨酸合成过程中的关键酶基因胱硫醚-γ-合酶(cystathionine synthase,CGS1)基因和赖氨酸合成过程中的关键酶基因二氢吡啶二羧酸合酶(dihydrodipicolinatesynthase,DHDPS)基因,并对其进行体外分子改造,以解除末端产物对它们的反馈调节作用。研究将突变基因用做转基因植物的筛选标记,分别用甲硫氨酸类似物(乙硫氨酸,ETH)和赖氨酸类似物(S-2-氨基乙基-L-半胱氨酸,AEC)作为筛选剂的可行性。由于氨基酸合成途径中的反馈调节作用,非转基因作物在氨基酸类似物的存在下会抑制相应氨基酸的合成而死亡,转基因植物由于不受氨基酸类似物的反馈调节作用,继续合成相应的氨基酸而得以存活下来。本研究试图为植物基因工程提供新型安全筛选标记基因。主要研究结果如下:1.CGS1、DHDPS基因的克隆从Genbank中查到CGS1、DHDPS基因序列,Genbank登录号分别为U43709和X79675。利用RT-PCR方法从拟南芥中克隆得到CGS1基因,从烟草中克隆得到DHDPS基因。2.CGS1、DHDPS基因体外分子改造根据已有文献报道,通过对酶分子结构域的分析,确定突变方案,利用定点突变方法分别对CGS1、DHDPS进行体外分子改造。在拟突变位点设计PCR引物,分别向两个方向进行PCR扩增,再经过重叠延伸得到目的突变基因。共获得3个突变基因,其中CMI突变使得CGS成熟蛋白Gly84→Ser,CMⅡ突变使得CGS成熟蛋白Ser81→Asn,同时Gly84→Ser;DM使得DHDPS成熟蛋白Asn104→Ile。3.植物表达载体构建构建了CGS1、DHDPS基因及其突变基因的5个植物表达载体pBIC、pBICMⅠ、pBICMⅡ、pBID、pBIDM,目的基因受CaMV35S启动子的调控,载体上带有传统筛选标记基因nptⅡ,以便与本研究的新型筛选标记进行对比分析。4.农杆菌介导的遗传转化以烟草“龙江911”为受体材料,利用农杆菌介导法将上述构建的5个植物表达载体对烟草进行遗传转化。筛选培养基中添加除菌剂和筛选剂,其中筛选剂分两组添加,一组添加传统筛选剂Km:另一组添加氨基酸类似物(ETH或AEC),通过Km和氨基酸类似物筛选,获得了一些抗性植株。5.抗性植株的检测PCR检测了转CGS1基因的Km抗性植株5株,其中4株呈阳性。PCR检测了转CMI基因的Km抗性植株5株,其中4株呈阳性。PCR检测了转CMI基因的ETH抗性植株3株,其中1株呈阳性。PCR检测了转DHDPS基因的Km抗性植株8株,其中6株呈阳性。PCR检测了转DM基因的Km抗性植株5株,其中2株呈阳性。PCR检测了转DM基因的AEC抗性植株2株,其中1株呈阳性。Real-Time PCR检测了转CGS1、CM、DHDPS、DM基因的Km抗性植株共计15株,检测了AEC筛选的转DM基因植株2株,外源基因均得到超量表达。6.新型筛选标记的可行性分析通过对烟草的遗传转化,用相应的类似物进行筛选,利用突变基因DM作为筛选标记筛选得到部分PCR阳性并超量表达外源基因的烟草苗。在分化阶段,用氨基酸类似物筛选烟草叶盘的分化率明显高于Km筛选,加之此类基因在增加转基因植物的营养价值方面的优越性,氨基酸代谢过程中的关键酶基因作为转基因植物筛选标记具有很大的应用前景,随着研究的深入,此类绿色筛选标记基因对植物代谢带来的负面影响均有望得到合理的解决。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 1 引言
  • 1.1 本研究的目的和意义
  • 1.2 文献综述
  • 1.2.1 传统筛选标记
  • 1.2.2 筛选标记基因的消除
  • 1.2.3 植物无筛选标记转基因技术
  • 1.2.4 生物安全筛选标记基因
  • 1.2.5 甲硫氨酸和赖氨酸代谢途径
  • 1.3 本论文的主要研究内容
  • 2 材料与方法
  • 2.1 CGS1,DHDPS基因克隆及体外分子改造
  • 2.1.1 试验材料
  • 2.1.2 试验方法
  • 2.2 DHDPS和突变基因的原核表达
  • 2.2.1 试验材料
  • 2.2.2 试验方法
  • 2.3 植物表达载体的构建
  • 2.3.1 试验材料
  • 2.3.2 试验方法
  • 2.4 卡那霉素及其氨基酸类似物筛选压力的确定
  • 2.4.1 试验材料
  • 2.4.2 试验方法
  • 2.5 农杆菌介导的遗传转化及抗性植株再生
  • 2.5.1 试验材料
  • 2.5.2 试验方法
  • 2.6 烟草抗性植株的分子生物学检测
  • 2.6.1 PCR检测
  • 2.6.2 外源基因转录水平的Real-time PCR检测
  • 2.6.3 氨基酸含量检测
  • 3 结果与分析
  • 3.1 CGS1,DHDPS基因克隆及体外分子改造
  • 3.1.1 拟南芥和烟草总RNA的提取
  • 3.1.2 RT-PCR方法克隆得到CGS1和DHDPS基因片段
  • 3.1.3 CGS1基因的定点突变
  • 3.1.4 DHDPS基因的定点突变
  • 3.2 DHDPS和DM的原核表达
  • 3.2.1 DHDPS和突变基因原核表达载体的构建
  • 3.2.2 序列比对与ORF分析
  • 3.2.3 目的蛋白在大肠杆菌中的表达
  • 3.3 植物表达载体构建
  • 3.3.1 植物表达载体pBIC的构建
  • 3.3.2 植物表达载体pBICMⅠ的构建
  • 3.3.3 植物表达载体pBICMⅡ的构建
  • 3.3.4 植物表达载体pBID的构建
  • 3.3.5 植物表达载体pBIDM的构建
  • 3.4 重组质粒导入根癌农杆菌
  • 3.5 卡那霉素及其氨基酸类似物筛选压力的确定
  • 3.5.1 那霉素筛选压力的确定
  • 3.5.2 乙硫氨酸筛选压力的确定
  • 3.5.3 S-2-氨基乙基-L-半胱氨酸筛选压力的确定
  • 3.6 农杆菌介导的遗传转化及抗性植株再生
  • 3.6.1 烟草的遗传转化
  • 3.6.2 抗性植株筛选
  • 3.6.3 抗性芽再生
  • 3.7 抗性植株的二次筛选
  • 3.8 抗性植株的分子生物学检测
  • 3.8.1 抗性植株的PCR检测
  • 3.8.2 外源基因转录水平的Real-Time PCR检测
  • 3.8.3 氨基酸含量检测
  • 4 讨论
  • 4.1 氨基酸代谢关键酶基因的选择
  • 4.2 体外分子改造
  • 4.3 二次交叉筛选
  • 4.4 分子生物学检测
  • 4.5 下一步工作展望
  • 5 结论
  • 5.1 野生型基因的克隆及体外分子改造
  • 5.2 植物表达载体构建
  • 5.3 农杆菌介导的遗传转化
  • 5.4 新型筛选标记的分析
  • 致谢
  • 参考文献
  • 附录
  • 攻读硕士学位期间发表的学术论文
  • 相关论文文献

    • [1].巴丹吉林沙漠东南缘查格勒布鲁剖面CGS1层段粒度特征及其指示的全新世千年尺度气候变化[J]. 中国沙漠 2012(05)

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    CGS1、DHDPS基因克隆及其作为转基因植物筛选标记的研究
    下载Doc文档

    猜你喜欢