犬科动物粪便菌群组成及多样性分析

犬科动物粪便菌群组成及多样性分析

论文摘要

犬科动物是食肉目动物中分布最为广泛的类群,几万年前就与人类生活在一起,二者之间有着不可分割的联系。在犬科动物的研究过程中,其消化生理学领域的研究非常重要,特别是消化道菌群生态方面的研究早已成为学术界的热点话题。目前国内外对家犬肠道正常微生物的研究相对比较深入,但对于其他生存在野外环境下的犬科动物的消化道菌群的的组成及多样性研究较少。为了解犬科动物的消化道菌群组成及多样性特征,本文应用传统培养方法对五种犬科动物(狼、赤狐、沙狐、乌苏里貉和豺)粪便内微生物菌群组成和多样性进行研究,通过与已报道的家犬肠道菌群进行对比分析,全面展现犬科动物肠道正常微生物菌群组成、群落结构及微生态平衡,为犬科动物粪便菌群的研究积累基础资料,并为研究犬科动物肠道微生态环境和肠道疾病提供科学依据。根据菌落形态、革兰氏染色特性和显微镜镜鉴,从狼(Canis lupus)粪便菌群中分离到45株菌,赤狐(Vulpes vulpes)粪便菌群中33株菌,沙狐(Vulpes corsac)粪便菌群中27株菌,乌苏里貉(Nyctereutes procyonoides)粪便菌群中38株菌,豺(Cuon alpinus)粪便菌群中39株菌。结合生理生化实验结果,根据细菌鉴定相关资料综合判断,最终确定狼粪便菌群中有22个菌属,赤狐粪便菌群中有19个菌属,沙狐粪便菌群中有21个菌属,乌苏里貉粪便菌群中有21个菌属,豺粪便菌群中有19个菌属,还有一些未能鉴定的菌属。通过对五种犬科动物粪便菌群组成及多样性分析,发现粪便菌群组成在犬科动物之间不但具有物种特有性,还具有个体差异性。菌群总量在1010cfu/ml~1011cfu/ml之间,具有一定的稳定性,其中狼粪便菌群总量为(1.442±0.219)×1011cfu/g,赤狐粪便菌群总量为(0.833±0.097)×1011cfu/g,沙狐粪便菌群总量为(0.817±0.130)×1011cfu/g,乌苏里貉粪便菌群总量为(0.862±0.128)×1011cfu/g,豺粪便菌群总量为(1.485±0.144)×1011cfu/g。粪便菌群总量在同一物种不同个体间无明显差异(P>0.05),其中P(Canis lupus)=0.191;P(Vulpes vulpes)=0.898;P(Vulpes corsac)=0.315;P(Nyctereutes procyonoides)=0.074;P(Cuon alpinus)=0.197),不同物种间存在一定差异(P<0.05)。其中狼和豺粪便菌群总量无明显差异,赤狐、沙狐和乌苏里貉粪便菌群总量无明显差异,而狼和豺与赤狐、沙狐和乌苏里貉粪便菌群总量之间存在较为明显的差异(P<0.05)。粪便菌群组成在不同犬科动物间匹配度较高,大约在65%-80%之间,其中狼与赤狐、沙狐、乌苏里貉和豺的粪便菌群匹配度分别为66.67%、69.77%、69.77%、63.41%;赤狐与沙狐、乌苏里貉和豺的粪便菌群组成匹配度分别为80.00%、65.00%、78.95%;沙狐与乌苏里貉和豺的粪便菌群组成匹配度分别为71.43%和75.00%;乌苏里貉与豺的粪便菌群组成匹配度为70.00%。优势菌群主要包括埃希氏大肠杆菌、肠杆菌、链球菌、变形菌、肠球菌和乳酸杆菌,其中埃希氏大肠杆菌和肠杆菌为犬科动物共有优势菌,优势菌在不同犬科动物粪便菌群中有一定的差异,但相似度较高。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 1 文献综述
  • 1.1 肠道微生物的分布和功能
  • 1.1.1 肠道微生物的分布
  • 1.1.2 肠道微生物的功能
  • 1.2 肠道微生物的研究方法
  • 1.2.1 传统研究方法
  • 1.2.2 现代分子生物学研究方法
  • 1.3 肠道菌群的影响因素
  • 1.4 研究背景和目的
  • 2 材料和方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 实验动物
  • 2.1.2 培养基
  • 2.2 实验方法
  • 2.2.1 细菌培养
  • 2.2.2 细菌分离
  • 2.2.3 芽孢鉴定
  • 2.2.4 细菌鉴定
  • 2.3 数据分析
  • 3 结果
  • 3.1 狼粪便菌群组成及多样性分析
  • 3.1.1 狼粪便菌群的鉴定结果
  • 3.1.2 狼不同个体间粪便菌群总量测定及多重比较分析
  • 3.2 赤狐粪便菌群组成及多样性分析
  • 3.2.1 赤狐粪便菌群的鉴定结果
  • 3.2.2 赤狐不同个体间粪便菌群总量测定及多重比较分析
  • 3.3 沙狐粪便菌群组成及多样性分析
  • 3.3.1 沙狐粪便菌群的鉴定结果
  • 3.3.2 沙狐不同个体间粪便菌群总量测定及多重比较分析
  • 3.4 乌苏里貉粪便菌群组成及多样性分析
  • 3.4.1 乌苏里貉粪便菌群的鉴定结果
  • 3.4.2 乌苏里貉不同个体粪便菌群总量测定及多重比较分析
  • 3.5 豺粪便菌群组成及多样性分析
  • 3.5.1 豺粪便菌群的鉴定结果
  • 3.5.2 豺不同个体间粪便菌群总量测定及多重比较分析
  • 3.6 五种犬科动物粪便菌群组成及多样性分析
  • 3.6.1 五种犬科动物粪便菌群组成
  • 3.6.2 五种犬科动物粪便菌群总量及多重比较分析
  • 3.6.3 五种犬科动物粪便菌群种类匹配度对比分析
  • 3.6.4 犬科动物粪便菌群中优势菌群的差异
  • 讨论
  • 参考文献
  • 附录
  • 论文发表情况
  • 致谢
  • 相关论文文献

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