野生二粒小麦1By基因的分子克隆与序列分析

野生二粒小麦1By基因的分子克隆与序列分析

论文摘要

高分子量谷蛋白亚基(HMW-GS)作为麦类作物种子的重要贮藏蛋白,其组成及含量与小麦面粉的营养和加工品质密切相关。野生二粒小麦(Triticum dicoccoides, AABB,2n=4x=28)作为小麦属(Triticum)中携带B基因组最原始的物种,其丰富的HMW-GS等位变异,尤以Glu-B1位点最为丰富,并富含在普通小麦中常不表达的高分子量谷蛋白亚基1By。为了认识并有效利用此种y-型高分子量谷蛋白基因,本文对一份来自于以色列的野生二粒小麦D97的高分子量谷蛋白基因18y进行了分子克隆、序列分析,以及系统发生关系分析,并进行了蛋白二级结构预测,得到以下研究结果:1.从拥有4个高分子量谷蛋白亚基的野生二粒小麦D97的基因组DNA中,首次成功地克隆到一个活性1By基因1By8.1 (KC545957)。该基因全长2166 bp,与已报道的1By8型基因相似性高达99%。该基因编码720个氨基酸残基(aa)的多肽链,具有典型的By-型高分子量谷蛋白亚基结构特征,包括信号肽(21个aa),N-端保守区(104个aa,含5个半胱氨酸残基Cys),中央重复区(553个aa,在-73位有1个保守的Cys)和C-端保守区(42个aa,含1个Cys)四个结构域,其中央重复区内有十分丰富的多肽类型,包括三肽、五肽、六肽、九肽、十一肽和十二肽。其中,以六肽含量最高,达67.9%。2.该1By8.1基因(KC545957)与其最相似的3个1By8基因(JN255519、JF736014和DQ537336)存在19个SNP位点,包括12个转换和7个颠换。这些SNP导致该1By8.1与这3个1By8亚基之间产生了12个单氨基酸的突变。因此,该基因是一个新的Glu-B1-2等位基因。3.所克隆的1By8.1基因高度相似于普通小麦中具有优质特性的1By8亚基编码基因的核苷酸序列。其编码蛋白1By8.1不仅与优质亚基1By8具有高度相似的氨基酸一级结构,还具有高度相似的二级结构,而且在中央重复区,比1By8亚基含有更多和更高含量的a-螺旋和p-折叠。据此认为,野生二粒小麦D97的1By8.1亚基,也可能具有类似于1By8亚基的优质特性,甚至较之更佳的优质潜能。4.系统发生分析显示,所克隆的1By8.1基因与来自同一物种野生二粒小麦的1By16.1和1By16*分别聚在3个小支中,还与来自六倍体普通小麦和四倍体圆锥小麦及硬粒小麦的1B68等位基因相分离。进一步的比较分析暗示,野生二粒小麦Glu-B1-2位点具有丰富的遗传多样性,但是在驯化为栽培种和进化为普通小麦的过程中,其等位基因的分子结构更趋于相近而被降低了。显然,野生二粒小麦Glu-B1-2位点丰富的等位变异,为现代小麦的品质遗传改良提供了丰富多彩的1By亚基基因资源。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 1 文献综述
  • 1.1 小麦品质改良的重要性
  • 1.2 小麦HMW-GS相关研究及其进展
  • 1.2.1 小麦HMW-GS与品质之间的关系
  • 1.2.2 小麦HMW-GS基因克隆研究进展
  • 1.3 野生二粒小麦的研究进展
  • 1.3.1 野生二粒小麦HMW-GS遗传多样性
  • 1.4 本研究的目的及意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 材料
  • 2.2 方法
  • 2.2.1 SDS-PAGE分析
  • 2.2.2 基因组DNA提取及PCR扩增
  • 2.2.3 PCR产物T-载体克隆
  • 2.2.4 感受态细胞的制备、转化及阳性克隆筛选
  • 2.2.5 提取质粒定向缺失亚克隆
  • 2.2.6 DNA序列测定及分析
  • 2.2.7 高分子量谷蛋白的结构分析
  • 2.2.8 Glu-B1-2等位基因的系统发生分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 SDS-PAGE分析
  • 3.2 1BY基因的PCR扩增及克隆
  • 3.3 1BY8.1基因的核苷酸序列分析
  • 3.4 1BY8.1的氨基酸序列分析
  • 3.5 1BY8.1的推导氨基酸二级结构预测
  • 3.6 GLu-B1-2等位基因的系统发生分析
  • 4 讨论
  • 4.1 所获基因KC545957的归属
  • 4.2 KC545957基因的分子结构特异性
  • 4.3 1BY8.1基因的应用潜能
  • 4.4 野生二粒小麦GLU-B1-2位点的遗传多样性
  • 5. 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 在读期间已发表的和完成的论文与专利
  • 相关论文文献

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