本文主要研究内容
作者蒋爽,骆军,王晓庆,施春晖（2019）在《基于基因组重测序数据高效筛选梨SSR标记多态性引物》一文中研究指出：【目的】基于重测序数据开发一种快速筛选样品间SSR标记多态性的方法。【方法】通过基因组重测序技术对2个砂梨品种’早生新水’和’秋水’、1个西洋梨栽培品种’早红考密斯’以及3个梨属野生种豆梨、川梨和杜梨进行重测序,对已报道的446对梨SSR引物和新开发16对引物进行多态性测试,使用Magicblast匹配测序产生的Reads到上述SSR位点序列,获得SSR两侧保守序列之间的长度,筛选出多态性的引物。使用荧光PCR对部分筛选出的多态性引物进行验证。【结果】单个SSR位点在不同样品间获得匹配的平均Reads数能够超过16条,每个样品均获得了220个以上位点的信息,380对引物在不同样品间能够获得多态性的片段。精确分析了梨LG3早熟候选区域29个SSR位点在’早生新水’和’秋水’中的扩增情况,共鉴定出9个多态性表现好的位点。荧光PCR验证结果显示,通过预备筛选的引物表现出良好的多态性。【结论】本研究的方法一次能够筛选多对SSR引物,在常规PCR前可以预先获得不同引物的多态性信息,从而提高引物筛选效率。本方法不仅能应用于梨重测序数据快速筛选SSR引物,对其他动植物上的类似研究同样适用。
Abstract
【mu de 】ji yu chong ce xu shu ju kai fa yi chong kuai su shai shua yang pin jian SSRbiao ji duo tai xing de fang fa 。【fang fa 】tong guo ji yin zu chong ce xu ji shu dui 2ge sha li pin chong ’zao sheng xin shui ’he ’qiu shui ’、1ge xi xiang li zai pei pin chong ’zao gong kao mi si ’yi ji 3ge li shu ye sheng chong dou li 、chuan li he du li jin hang chong ce xu ,dui yi bao dao de 446dui li SSRyin wu he xin kai fa 16dui yin wu jin hang duo tai xing ce shi ,shi yong Magicblastpi pei ce xu chan sheng de Readsdao shang shu SSRwei dian xu lie ,huo de SSRliang ce bao shou xu lie zhi jian de chang du ,shai shua chu duo tai xing de yin wu 。shi yong ying guang PCRdui bu fen shai shua chu de duo tai xing yin wu jin hang yan zheng 。【jie guo 】chan ge SSRwei dian zai bu tong yang pin jian huo de pi pei de ping jun Readsshu neng gou chao guo 16tiao ,mei ge yang pin jun huo de le 220ge yi shang wei dian de xin xi ,380dui yin wu zai bu tong yang pin jian neng gou huo de duo tai xing de pian duan 。jing que fen xi le li LG3zao shou hou shua ou yu 29ge SSRwei dian zai ’zao sheng xin shui ’he ’qiu shui ’zhong de kuo zeng qing kuang ,gong jian ding chu 9ge duo tai xing biao xian hao de wei dian 。ying guang PCRyan zheng jie guo xian shi ,tong guo yu bei shai shua de yin wu biao xian chu liang hao de duo tai xing 。【jie lun 】ben yan jiu de fang fa yi ci neng gou shai shua duo dui SSRyin wu ,zai chang gui PCRqian ke yi yu xian huo de bu tong yin wu de duo tai xing xin xi ,cong er di gao yin wu shai shua xiao lv 。ben fang fa bu jin neng ying yong yu li chong ce xu shu ju kuai su shai shua SSRyin wu ,dui ji ta dong zhi wu shang de lei shi yan jiu tong yang kuo yong 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自果树学报的蒋爽,骆军,王晓庆,施春晖，发表于刊物果树学报2019年02期论文，是一篇关于重测序论文,标记论文,多态性论文,果树学报2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自果树学报2019年02期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：重测序论文; 标记论文; 多态性论文; 果树学报2019年02期论文;