本文主要研究内容
作者邓阳川,向丽,苏燕燕,杨俐,李洪运,罗小梅,孙伟,叶萌（2019）在《基于转录组测序的花椒属物种EST-SSR标记开发》一文中研究指出：【目的】开发适用于花椒(Zanthoxylum bungeanum)和竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)的EST-SSR引物,为花椒属物种的鉴定及遗传多样性探究提供分子标记。【方法】对花椒和竹叶花椒分别进行转录组测序(RNA-seq),基于得到的EST序列开发SSR引物。在2种花椒的EST-SSR引物中分别随机挑选60对引物,用12份材料(4份花椒和8份竹叶花椒)为样本,利用琼脂糖凝胶电泳验证其特异性。从有特异性条带的引物中,再随机选取花椒和竹叶花椒SSR引物各15对,选取6个(2份花椒和4份竹叶花椒)样本,利用聚丙烯酰胺银染电泳进行多态性检测。【结果】花椒共有64 944条Unigene,碱基对长度共54 073 890bp,含有12 746个SSR位点,分布在10 595条Unigene上,SSR位点出现频率为19.63%,平均分布距离4.24kb。竹叶花椒Unigene共75 669条,碱基对长度58 975 053bp,共15 096个SSR位点,分布在12 612条Unigene上。SSR位点出现频率为19.95%,平均分布距离为3.91kb。60对花椒引物中,有46对成功扩增出特异性条带,扩增效率76.67%;60对竹叶花椒引物中,有41对扩增出特异性条带,扩增效率68.33%。花椒和竹叶花椒的特异性条带大小在100～300bp,主要集中在150～250bp。多态性验证试验中,15对花椒引物中有12对产生了多态性条带,多态率80.00%;15对竹叶花椒引物中则有14对产生了多态性条带,多态率93.33%。【结论】基于花椒和竹叶花椒转录组高通量测序结果开发的EST-SSR分子标记引物,具有较明显的特异性和多态性。
Abstract
【mu de 】kai fa kuo yong yu hua jiao (Zanthoxylum bungeanum)he zhu xie hua jiao (Zanthoxylum armatum)de EST-SSRyin wu ,wei hua jiao shu wu chong de jian ding ji wei chuan duo yang xing tan jiu di gong fen zi biao ji 。【fang fa 】dui hua jiao he zhu xie hua jiao fen bie jin hang zhuai lu zu ce xu (RNA-seq),ji yu de dao de ESTxu lie kai fa SSRyin wu 。zai 2chong hua jiao de EST-SSRyin wu zhong fen bie sui ji tiao shua 60dui yin wu ,yong 12fen cai liao (4fen hua jiao he 8fen zhu xie hua jiao )wei yang ben ,li yong qiong zhi tang ning jiao dian yong yan zheng ji te yi xing 。cong you te yi xing tiao dai de yin wu zhong ,zai sui ji shua qu hua jiao he zhu xie hua jiao SSRyin wu ge 15dui ,shua qu 6ge (2fen hua jiao he 4fen zhu xie hua jiao )yang ben ,li yong ju bing xi xian an yin ran dian yong jin hang duo tai xing jian ce 。【jie guo 】hua jiao gong you 64 944tiao Unigene,jian ji dui chang du gong 54 073 890bp,han you 12 746ge SSRwei dian ,fen bu zai 10 595tiao Unigeneshang ,SSRwei dian chu xian pin lv wei 19.63%,ping jun fen bu ju li 4.24kb。zhu xie hua jiao Unigenegong 75 669tiao ,jian ji dui chang du 58 975 053bp,gong 15 096ge SSRwei dian ,fen bu zai 12 612tiao Unigeneshang 。SSRwei dian chu xian pin lv wei 19.95%,ping jun fen bu ju li wei 3.91kb。60dui hua jiao yin wu zhong ,you 46dui cheng gong kuo zeng chu te yi xing tiao dai ,kuo zeng xiao lv 76.67%;60dui zhu xie hua jiao yin wu zhong ,you 41dui kuo zeng chu te yi xing tiao dai ,kuo zeng xiao lv 68.33%。hua jiao he zhu xie hua jiao de te yi xing tiao dai da xiao zai 100～300bp,zhu yao ji zhong zai 150～250bp。duo tai xing yan zheng shi yan zhong ,15dui hua jiao yin wu zhong you 12dui chan sheng le duo tai xing tiao dai ,duo tai lv 80.00%;15dui zhu xie hua jiao yin wu zhong ze you 14dui chan sheng le duo tai xing tiao dai ,duo tai lv 93.33%。【jie lun 】ji yu hua jiao he zhu xie hua jiao zhuai lu zu gao tong liang ce xu jie guo kai fa de EST-SSRfen zi biao ji yin wu ,ju you jiao ming xian de te yi xing he duo tai xing 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自西北农林科技大学学报(自然科学版)的邓阳川,向丽,苏燕燕,杨俐,李洪运,罗小梅,孙伟,叶萌，发表于刊物西北农林科技大学学报(自然科学版)2019年04期论文，是一篇关于转录组测序论文,花椒论文,引物开发论文,西北农林科技大学学报(自然科学版)2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自西北农林科技大学学报(自然科学版)2019年04期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。