华山新麦草低分子量麦谷蛋白和α-醇溶蛋白基因的原核表达及进化分析

华山新麦草低分子量麦谷蛋白和α-醇溶蛋白基因的原核表达及进化分析

论文摘要

华山新麦草(Psathyrostachys huashanica Keng. 2n=14,NsNs)是仅分布在秦岭山脉华山段的中国特有农作物野生近缘种,具有抗寒、耐旱、耐瘠薄、抗病、品质优良等优异性状。本研究采用同源克隆法从华山新麦草基因组DNA中分离克隆LMW-GS和α-醇溶蛋白基因并对其进行序列结构分析;构建了LMW-GS和α-醇溶蛋白基因的原核表达载体,并在大肠杆菌体外表达系统中诱导表达融合蛋白;同时对华山新麦草LMW-GS和α-醇溶蛋白基因进行了系统进化分析。主要结果如下:1、采用同源克隆法,从华山新麦草基因组DNA中克隆了7个LMW-GS基因:LG-Ns-5 ( HM475144 )、LG-Ns-6 ( HM475145 )、LG-Ns-7 ( HM475146 )、LG-Ns-8(HM475147)、LG-Ns-9(HM475148)、LG-Ns-10(HM475149)和LG-Ns-11(HM475150)。序列分析表明,这7个基因序列均具有LMW-GS基因的典型结构特点和基本特征,含有8或9个半胱氨酸残基,序列LG-Ns-6(HM475145)和LG-Ns-7(HM475146)具有完整的编码区,其余5个基因的编码区内含有1或2个提前终止密码子,推测为假基因。基因LG-Ns-6和LG-Ns-7的二级结构分析显示,这2条序列在N-末端区和重复区含有无规则卷曲,C-末端区不仅富含无规则卷曲,还含有α-螺旋和β-折叠结构。系统进化分析显示,华山新麦草LMW-GS基因序列被聚为2类,说明Ns基因组LMW-GS基因在系统进化过程中发生了分化,两个亚位点的分歧时间约为7.30百万年;华山新麦草Ns基因组LMW-GS基因与小麦、山羊草等亲缘物种LMW-GS基因的分化时间大约为12.72百万年;华山新麦草LMW-GS基因与柔软赖草LMW-GS基因的分化大约发生在4.83百万年前。华山新麦草的LMW-GS基因与柔软赖草的LMW-GS基因具有相对较近的亲缘关系。根据华山新麦草LMW-GS基因LG-Ns-7(HM475146)成熟蛋白的完整编码区和表达载体pET-28a(+)的结构区,构建了融合表达载体pET28a-Glu-Ns,SDS-PAGE和Western-blot结果显示,获得的融合蛋白的分子量与理论值(39kD)相符,表明融合表达载体pET28a-Glu-Ns可在大肠杆菌BL21(DE3)pLysS中成功地诱导表达。2、对已经获得的4条华山新麦草α-醇溶蛋白基因的序列分析表明,这4个基因序列具有α-醇溶蛋白家族的一般结构模型和基本特征,含有8或9个半胱氨酸残基,序列GQ139526和GQ139527在重复区和多聚谷氨酰胺Ⅱ区具有特殊的结构变异;系统进化分析表明,序列FJ713595和GQ139525与柔软赖草和纤毛鹅观草的α-醇溶蛋白基因具有相对较近的亲缘关系,序列GQ139526和GQ139527单独成一类,其可能为α-醇溶蛋白基因家族中的新类型;分子进化分析显示,基因FJ713595与其它Ns基因组α-醇溶蛋白基因的分化时间大约为12.05百万年;基因GQ139526和GQ139527与柔软赖草α-醇溶蛋白基因HQ416920和HQ416921的分化发生的较晚,大约在2.66百万年前。将华山新麦草α-醇溶蛋白基因GQ139527(Gli-Ns-5)与原核表达载体pET-28a(+)构建了融合表达载体pET28a-Gli-Ns,SDS-PAGE和Western-blot分析显示,融合表达载体pET28a-Gli-Ns可成功地在大肠杆菌BL21(DE3)pLysS中实现表达,并获得与理论值(37.5 kD)相符的融合蛋白,表明重组质粒pET28a-Gli-Ns能够在大肠杆菌BL21(DE3) pLysS中实现特异性表达。华山新麦草麦LMW-GS基因的定向克隆与序列结构的生物信息学分析,以及华山新麦草麦LMW-GS和α-醇溶蛋白基因的原核表达、系统进化分析与分化时间估算,为揭示该类型基因品质效应的分子基础奠定了理论依据、为探讨Ns基因组的遗传变异及进化特征提供了参考,并为小麦品质改良提供了新的候选基因。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 文献综述
  • 1.1 小麦贮藏蛋白的组成及分类
  • 1.2 低分子量麦谷蛋白研究进展
  • 1.2.1 LMW-GS 的分类
  • 1.2.2 LMW-GS 基因的染色体定位
  • 1.2.3 LMW-GS 基因的分子结构
  • 1.2.4 普通小麦及其近缘物种LMW-GS 基因克隆研究进展
  • 1.2.5 LMW-GS 基因的品质效应
  • 1.3 醇溶蛋白研究进展
  • 1.3.1 醇溶蛋白的组成及分子结构
  • 1.3.2 醇溶蛋白基因的染色体定位
  • 1.3.3 醇溶蛋白基因克隆研究进展
  • 1.3.4 醇溶蛋白的品质效应
  • 1.4 种子贮藏蛋白的体外表达
  • 1.5 华山新麦草研究进展
  • 1.5.1 华山新麦草细胞学研究进展
  • 1.5.2 华山新麦草与普通小麦杂交研究进展
  • 1.5.3 华山新麦草抗病性研究进展
  • 1.5.4 华山新麦草的品质效应
  • 1.6 本研究目的及意义
  • 第二章 华山新麦草LMW-GS 基因的克隆、进化分析与原核表达
  • 2.1 材料与方法
  • 2.1.1 供试材料
  • 2.1.2 试验方法
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 PCR 扩增与目的基因克隆
  • 2.2.2 核苷酸序列分析
  • 2.2.3 氨基酸序列一级结构分析
  • 2.2.4 氨基酸序列二级结构分析
  • 2.2.5 系统进化分析
  • 2.2.6 原核表达载体的构建及酶切鉴定
  • 2.2.7 SDS-PAGE 电泳结果分析
  • 2.2.8 Western blot 结果分析
  • 2.3 讨论
  • 2.3.1 Ns 基因组LMW-GS 基因的遗传变异与进化
  • 2.3.2 LMW-GS 基因结构特征的品质效应
  • 2.4 结论
  • 第三章 华山新麦草α-醇溶蛋白基因的进化分析与原核表达
  • 3.1 材料与方法
  • 3.1.1 供试材料
  • 3.1.2 试验方法
  • 3.2 结果与分析
  • 3.2.1 氨基酸序列分析
  • 3.2.2 系统进化分析
  • 3.2.3 表达引物的PCR 扩增结果
  • 3.2.4 原核表达载体的构建及酶切鉴定
  • 3.2.5 SDS-PAGE 电泳结果分析
  • 3.2.6 Western blot 结果分析
  • 3.3 讨论
  • 3.4 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  

    华山新麦草低分子量麦谷蛋白和α-醇溶蛋白基因的原核表达及进化分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢