基于被动式检测生物芯片应用系统的开发 ——微阵列数据分析子系统的开发

论文摘要

本文从工程实践角度,阐述了作者在北京博奥生物芯片公司实习期间所做的工作:对基于被动式检测生物芯片应用系统的数据分析部分——微阵列数据分析子系统的完整开发。该子系统是应用系统平台的组成部分,本文将其作为一个独立的子项目进行阐述。首先简要介绍了应用系统平台;然后阐述目标系统,即微阵列数据分析子系统的系统目标、系统要求及其技术指标;接着详细描述了作者对目标系统的系统分析过程和采用的设计方案,以及作者运用QA 措施的开发过程,其中主要阐述了借鉴敏捷开发、极限编程、测试驱动开发的开发方式以及相辅相成的测试过程;最后,进行了可复用平台的收益分析,阐述了目标系统作为平台组成部分在设计开发中对整体进度、成本和质量三方面的影响,并简要说明了作者在上述工作中的学习收获并提出了目标系统进一步改进的建议。本文立足实践,结合软件工程方法学,系统、完整、详细地阐述了作者对数据分析子系统的开发全过程。

论文目录

• 第一章 引言
• 1.1 被动式检测生物芯片
• 1.2 被动式检测生物芯片应用系统
• 1.2.1 系统简要描述
• 1.2.2 系统的逻辑组成
• 1.2.3 系统应用
• 第二章 目标系统
• 2.1 目标系统描述
• 2.1.1 目标系统在整个系统的位置
• 2.1.2 系统输入
• 2.1.3 目标系统执行
• 2.1.4 目标系统输出
• 2.2 系统特点
• 2.2.1 数据结构复杂
• 2.2.2 算法流程逻辑复杂
• 2.2.3 分析算法不稳定
• 2.2.4 数据吞吐量大
• 2.2.5 数据安全性要求高
• 2.2.6 系统可靠性要求高
• 2.2.7 通用性强
• 2.2.8 易于测试
• 2.2.9 可持续开发
• 2.3 搭建可持续开发的软件平台
• 2.4 选择工程模型
• 第三章 系统分析、设计
• 3.1 提取稳定的物理数据结构
• 3.2 附加稳定的逻辑数据结构
• 3.3 依据业务逻辑将操作最小化
• 3.4 分离算法实现和业务实现
• 3.5 借鉴设计模式解决实际问题
• 3.5.1 “策略”与“工厂方法”模式组合,分离数据及其操作
• 3.5.2 “单件”模式的广泛应用
• 3.5.3 “桥”与“单件”模式的组合
• 3.5.4 Null Object 模式简化代码
• 3.6 通过XML 文件的配置增加代码的通用性和一致性
• 3.7 目标系统设计总示意图
• 第四章 系统开发、测试
• 4.1 开发方式
• 4.2 开发过程中的重构
• 4.3 测试平台的搭建
• 4.4 单元测试与组合测试
• 4.4.1 测试数据的设计
• 4.4.2 测试用例的设计
• 4.4.3 测试的自动化
• 4.4.4 目标系统的单元测试与组合测试
• 4.5 对于开发代码和测试用例的配置管理
• 4.6 测试工具的使用
• 4.7 封装及与主系统整合
• 4.8 系统验收
• 4.9 β测试
• 第五章 总结
• 5.1 可复用平台的收益分析
• 5.1.1 开发进度分析
• 5.1.2 开发成本分析
• 5.1.3 开发质量分析
• 5.2 学习收获与经验教训
• 5.3 进一步改进的建议
• 参考文献
• 附录
• 摘要
• Abstract
• 致 谢
• 导师及作者简介