微卫星DNA标记与凉山半细毛羊羊毛性状关系的研究

微卫星DNA标记与凉山半细毛羊羊毛性状关系的研究

论文摘要

本试验选用绵羊基因组中第3号染色体上的13个微卫星标记和X染色体上的2个微卫星标记,结合PCR和复合电泳银染技术对凉山半细毛羊核心育种群6个父系组成的129只个体的7个羊毛表型性状进行标记—表型相关研究。7个表型性状为:断奶毛长(SL1),育成毛长(SL2),成年毛长(SL3),育成剪毛量(WY1),成年剪毛量(WY2),育成毛纤维直径(WFD1),成年毛纤维直径(WFD2)。对7个羊毛性状进行表型相关分析,育成毛长与成年毛长之间呈极显著正相关(P<0.01);育成剪毛量与成年剪毛量之间呈极显著正相关(P<0.01);育成毛细度与断奶毛长呈显著负相关(0.01<P<0.05),还与成年毛细度呈显著正相关(0.01<P<0.05);成年毛细度与育成剪毛量呈极显著负相关(P<0.01)。所选微卫星标记在凉山半细毛羊群体中平均检测到7.470个(5~11个)等位基因,平均多态信息含量为0.754(0.552~0.859),群体杂合度平均值为0.705(0.541~0.817)。15个标记均呈现高度或中度多态性,为该群体分子水平上的研究提供了可靠的依据。通过微卫星标记与表型性状的相关分析,结果发现9个微卫星标记对部分羊毛性状存在显著或极显著影响。其中标记BMS0460、BM3501、BL0004对断奶毛长影响显著(P<0.05),AE25对断奶毛长影响极显著(P<0.01);ILSTS22对育成毛长影响显著(P<0.05);Oarcp43、MILVET09对育成剪毛量影响分别为极显著(P<0.01)和显著(P<0.05);RM150、ILSTS22、ILSTS0049对成年剪毛量影响显著(P<0.05),MILVET09对成年剪毛量影响极显著(P<0.01);Oarcp43对成年毛细度影响显著(P<0.05),AE25对成年毛细度影响极显著(P<0.01)。通过对与表型显著相关的标记进行不同基因型间的多重比较,结果发现在标记BMS0460中,等位基因G对断奶毛长起增效作用,基因型GG、DG、BB为优势基因型。在标记Oarcp43中,基因型BD是育成剪毛量的优势基因型,基因型DD是成年毛细度的优势基因型。在标记BM3501中,Ⅱ是影响断奶毛长的优势基因型,等位基因Ⅰ为优势基因。在标记RM150中,等位基因F、C对成年剪毛量分别起增效和减效作用,基因型AF为优势基因型。在标记BL0004中,基因型CE、BC、EE为断奶毛长的优势基因型。在标记ILSTS22中,基因型DD、EF、DE是育成毛长的优势基因型,等位基因D起增效作用;基因型FF是成年剪毛量的优势基因型,等位基因F、E分别对成年剪毛量起增效作用和减效作用。在标记MILVET09中,基因型BB、AC、BC同时为育成剪毛量和成年剪毛量两个性状的优势基因型。在标记AE25中,基因型EG为断奶毛长的优势基因型,基因型EF为成年毛细度的优势基因型。在标记ILSTS0049中,基因型AG是成年剪毛量性状的优势基因型。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 1 文献综述
  • 1.1 凉山半细毛羊的发展状况
  • 1.2 分子遗传标记及其发展
  • 1.3 微卫星DNA标记的特点
  • 1.3.1 微卫星DNA数量多且在基因组中分布均匀
  • 1.3.2 微卫星DNA具有特异性
  • 1.3.3 微卫星DNA具有多态性
  • 1.3.4 微卫星DNA容易检测
  • 1.4 微卫星DNA标记在绵羊遗传育种中的应用
  • 1.4.1 构建绵羊基因组连锁图
  • 1.4.2 用于制作绵羊DNA指纹图
  • 1.4.3 评估绵羊遗传多样性,估测绵羊品种间的遗传距离
  • 1.4.4 绵羊亲子关系的鉴定
  • 1.4.5 用于绵羊标记辅助选择
  • 1.4.6 用于绵羊功能基因定位及QTL分析
  • 1.4.7 用于绵羊杂种优势预测
  • 1.5 绵羊羊毛的生产及研究状况
  • 1.5.1 中国绵羊羊毛生产简况
  • 1.5.2 绵羊羊毛性状的研究现状
  • 1.6 本研究的目的和意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.1.1 试验群体
  • 2.1.2 耳组织采集
  • 2.1.3 试验研究的表型性状
  • 2.1.4 主要仪器设备
  • 2.1.5 主要试剂及配制
  • 2.2 试验方法
  • 2.2.1 微卫星标记的选择与引物合成
  • 2.2.2 样品DNA的提取
  • 2.2.3 基因组DNA的检测
  • 2.2.4 PCR反应体系和反应条件
  • 2.2.5 琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物
  • 2.2.6 12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
  • 2.2.7 聚丙烯酰胺凝胶染色
  • 2.3 数据分析
  • 2.3.1 等位基因频率及基因型频率
  • 2.3.2 遗传杂合度(heterozygosity,H)
  • 2.3.3 多态信息含量(polymorphism information content,PIC)
  • 2.3.4 各位点与羊毛性状的相关分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 基因组DNA抽提结果
  • 3.2 琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物的结果
  • 3.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR扩增产物的分型结果
  • 3.4 羊毛性状表型资料汇总统计分析
  • 3.5 各微卫星位点的群体遗传学分析
  • 3.5.1 遗传特性分析
  • 3.5.2 等位基因频率与基因型频率
  • 3.6 各微卫星标记与羊毛性状的相关分析
  • 3.6.1 标记的多态性与羊毛性状的相关关系
  • 3.6.2 呈显著相关的标记位点各基因型间分析
  • 4 讨论
  • 4.1 试验分析技术
  • 4.1.1 试验设计
  • 4.1.2 PCR反应体系与条件的确定
  • 4.1.3 微卫星带型的判读
  • 4.1.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳的条件
  • 4.1.5 选择聚丙烯酰胺凝胶电泳检测PCR扩增产物
  • 4.2 微卫星标记与羊毛性状
  • 4.2.1 微卫星标记的选择
  • 4.2.2 表型资料统计分析
  • 4.2.3 微卫星标记的多态性分析
  • 4.2.4 群体的杂合度
  • 4.2.5 微卫星标记与羊毛性状的相关分析
  • 5 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的学术论文
  • 相关论文文献

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