鸡PRKAB2基因PCR-SSCP分析及其与屠宰性状和肉质性状的相关研究

论文摘要

本试验以四川省畜牧科学研究院和大恒家禽育种有限公司培育的优质鸡（共240只）为研究对象,从3个位点对PRKAB2基因PCR-SSCP的遗传多态性进行了研究,同时结合测定的生产资料,分析了不同基因型与屠宰性状和肉质性状的相关性,尝试为鸡的育种工作提供分子标记。本试验在3个不同的外显子中设计出3对引物,结果找出3个变异位点。对PRKAB2基因进行了PCR-SSCP检测,并进行了遗传多肽性分析,试验结果显示:在8个品系中,5个纯合系都属于中度多态性,因此还具有选择潜力;在3个杂交配套系中,基因分布都符合Hardy-Weinberg平衡,可以看出在育种过程中,杂交配套的针对性是很强的,效果是明显的。结合测定的生产资料分析了该基因3个变异位点各基因型在屠宰性状和肉质性状上的差异。通过最小二乘分析和显著性检验发现,PRKAB2基因3个变异位点各基因型对屠宰性状中的活体重、屠体重、腹脂重和腹脂率等4个指标的影响达到了显著水平（P＜0.05）。除此之外,试验结果还显示,PRKAB2基因变异位点1对腿肌重和腿肌率也有显著性影响（P＜0.05）,其加性效应为13.32g和1.25%。对肉质性状而言,3个位点的AA型纯合子基因型个体肌纤维密度显著大于BB型纯合子基因型个体（P＜0.05）。该基因3个变异位点的AA基因型还对肌内脂肪含量（IMF）有显著性影响。PRKAB2基因变异位点1和变异位点3各基因型对肌纤维直径有显著性影响（P＜0.05）,AA型的肌纤维直径均显著高于BB型和AB型（P＜0.05）,其增加肌纤维直径的加性效应分别为1.300和1.260。上述结果说明,PRKAB2基因与鸡的屠宰性状和肉质性状都有相关性,不但能提高产肉量,还能改善肉质状况,很可能是影响鸡屠宰性状和肉质性状的候选基因。

论文目录

• 中文摘要
• Abstract
• 1 文献综述
• 1.1 优质肉鸡研究现状
• 1.1.1 优质肉鸡市场现状
• 1.1.2 鸡肉质性状的研究现状
• 1.1.3 鸡肉品质遗传基础研究现状
• 1.2 AMPK家族的研究进展
• 1.2.1 AMPK的发现
• 1.2.2 AMPK的分子结构
• 1.2.3 AMPK在机体内的分布
• 1.2.4 AMPK的活性调节
• 1.2.5 AMPK的生物学效应
• 1.3 PRKAB2基因的研究进展
• 1.4 本研究的目的和意义
• 2 材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.1.1 供试样本
• 2.1.2 主要仪器设备
• 2.1.3 主要试剂及配制
• 2.2 试验方法
• 2.2.1 技术路线
• 2.2.2 基因组DNA提取
• 2.2.3 DNA浓度和纯度的检测
• 2.2.4 目的基因的扩增
• 2.2.5 PCR产物的检测
• 2.2.6 PCR扩增产物的PCR-SSCP分析及基因型判定
• 2.2.7 序列结果
• 2.3 数据统计分析
• 2.3.1 目标生产性状的测定与数据收集
• 2.3.2 数据分析
• 3 结果与分析
• 3.1 模板DNA的抽提结果
• 3.2 鸡PRKAB2基因PCR扩增结果
• 3.2.1 引物1PCR产物的扩增结果
• 3.2.2 引物2PCR产物的扩增结果
• 3.2.3 引物3PCR产物的扩增结果
• 3.3 鸡PRKAB2基因各引物SSCP检测结果
• 3.3.1 引物1的SSCP结果
• 3.3.2 引物2的SSCP结果
• 3.3.3 引物3的SSCP结果
• 3.4 PRKAB2基因测序结果
• 3.4.1 PRKAB2基因SNP1序列分析
• 3.4.2 PRKAB2基因SNP2序列分析
• 3.4.3 PRKAB2基因SNP3序列分析
• 3.5 鸡PRKAB2基因遗传多态性的分析
• 3.5.1 PRKAB2基因在不同品系间的遗传分布
• 3.5.2 PRKAB2基因在不同品系内的遗传变异分析
• 3.6 PRKAB2基因各基因型与屠宰性状的相关分析
• 3.6.1 PRKAB2基因变异位点1各基因型与屠宰性状的相关分析
• 3.6.2 PRKAB2基因变异位点2各基因型与屠宰性状的相关分析
• 3.6.3 PRKAB2基因变异位点3各基因型与屠宰性状的相关分析
• 3.7 PRKAB2基因各基因型与肉质性状的相关分析
• 3.7.1 PRKAB2基因变异位点1各基因型与肉质性状的相关分析
• 3.7.2 PRKAB2基因变异位点2各基因型与肉质性状的相关分析
• 3.7.3 PRKAB2基因变异位点3各基因型与肉质性状的相关分析
• 4 讨论
• 4.1 关于DNA抽提的优化
• 4.2 候选基因的确定
• 4.3 对杂合子进行测序
• 4.4 PRKAB2基因遗传分布与变异
• 4.5 PRKAB2基因各基因型与生产性能的相关分析
• 4.5.1 PRKAB2基因各基因型与屠宰性状的相关分析
• 4.5.2 PRKAB2基因各基因型与肉质性状的相关分析
• 4.6 PRKAB2基因的遗传效应分析
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢