七种病原体LAMP快速检测研究

七种病原体LAMP快速检测研究

论文摘要

目的建立弓形虫( Toxoplasma gondii )、肠出血型大肠杆菌(Enterohehemorrhagic Escherichia coli)O157:H7、痢疾志贺菌(S.dysenteriae)、霍乱弧菌(V.cholera)、副溶血性弧菌(V. parahaemolyticus)、轮状病毒(Rotavirus)G3型及Norwalk病毒(Norovirus)GII型七种病原体的LAMP或RT-LAMP检测方法。方法以各病原体的特异基因为靶序列, PrimerExplorer V3设计46条LAMP引物,利用TIAamp Genomic DNA Kit或酚氯法提取病原体DNA、利用QIAamp viral RNA mini kit提取病原体RNA,配制LAMP或RT-LAMP反应体系,优化反应体系并建立七种病原体检测方法;65℃保温约60 min,完成对靶病原体基因的扩增,扩增结果通过肉眼、SYBR Green I染色及电泳来判定。LAMP扩增产物经酶切进一步鉴定;设立对照组评价特异性;10倍系列稀释模板检测敏感性。结果模板经LAMP后,肉眼、SYBR Green I染色和电泳均能观察到LAMP扩增产物的出现,电泳后呈LAMP特征性梯状条带,对照组均无扩增产物;七种病原体LAMP扩增产物经相应限制性内切酶酶切鉴定正确;结果显示七种病原体LAMP检测方法特异;LAMP可检测到弓形虫、肠出血型大肠杆菌(EHEC)O157:H7、痢疾志贺菌、霍乱弧菌、副溶血性弧菌、轮状病毒G3型及Norwalk病毒GII型的最低浓度分别是1 pg/μL、10 cfu/ mL、12 cfu/mL、20 cfu/mL、10 cfu/mL、15.6 pg/管、25 pg/管,高于或与PCR敏感性相当。结论建立了七种病原体特异、敏感和快速的LAMP检测方法。

论文目录

  • 主要缩略语英文索引
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 第一章 弓形虫LAMP 快速检测研究
  • 材料与方法
  • 实验结果
  • 讨论
  • 第二章 EHEC O157:H 7 LAMP 快速检测研究
  • 材料与方法
  • 实验结果
  • 讨论
  • 第三章 痢疾志贺菌LAMP 快速检测研究
  • 材料与方法
  • 实验结果
  • 讨论
  • 第四章 霍乱弧菌LAMP 快速检测研究
  • 材料与方法
  • 实验结果
  • 讨论
  • 第五章 副溶血性弧菌LAMP 快速检测研究
  • 材料与方法
  • 实验结果
  • 讨论
  • 第六章 Norwalk 病毒G II 型 RT-LAMP 快速检测研究
  • 材料与方法
  • 实验结果
  • 讨论
  • 第七章 轮状病毒G3 型RT-LAMP 快速检测研究
  • 材料与方法
  • 实验结果
  • 讨论
  • 结论
  • 参考文献
  • 文献综述
  • 研究成果及发表论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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