方春:基于深度学习和字符嵌入的细胞穿透肽预测论文

方春:基于深度学习和字符嵌入的细胞穿透肽预测论文

本文主要研究内容

作者方春,孙福振,李彩虹,邢林林(2019)在《基于深度学习和字符嵌入的细胞穿透肽预测》一文中研究指出:针对传统细胞穿透肽的预测方法严重依赖于繁琐的特征抽取和特征重建步骤、算法复杂且准确度不高等问题,提出了一种利用自然语言处理中的字符嵌入方法结合CNN-LSTM组合机器学习框架来预测细胞穿透肽的方法。方法采用字符嵌入将氨基酸的代表字符通过网络学习映射到紧凑表示的向量空间中,每种氨基酸字符对应一个紧凑表示的向量,然后将肽序列通过由训练得到的嵌入向量转化为数值矩阵作为CNN-LSTM模型的输入,模型自行抽取特征后自动对输入序列的细胞穿透性进行预测。实验结果显示,在相同数据集进行实验时,研究的方法在测试集上的AUC (the area under ROC curve)值达到0.97,正确指数达到0.846,优于其它方法,说明上述方法能够简单、高效地进行细胞穿透肽的预测。

Abstract

zhen dui chuan tong xi bao chuan tou tai de yu ce fang fa yan chong yi lai yu fan suo de te zheng chou qu he te zheng chong jian bu zhou 、suan fa fu za ju zhun que du bu gao deng wen ti ,di chu le yi chong li yong zi ran yu yan chu li zhong de zi fu qian ru fang fa jie ge CNN-LSTMzu ge ji qi xue xi kuang jia lai yu ce xi bao chuan tou tai de fang fa 。fang fa cai yong zi fu qian ru jiang an ji suan de dai biao zi fu tong guo wang lao xue xi ying she dao jin cou biao shi de xiang liang kong jian zhong ,mei chong an ji suan zi fu dui ying yi ge jin cou biao shi de xiang liang ,ran hou jiang tai xu lie tong guo you xun lian de dao de qian ru xiang liang zhuai hua wei shu zhi ju zhen zuo wei CNN-LSTMmo xing de shu ru ,mo xing zi hang chou qu te zheng hou zi dong dui shu ru xu lie de xi bao chuan tou xing jin hang yu ce 。shi yan jie guo xian shi ,zai xiang tong shu ju ji jin hang shi yan shi ,yan jiu de fang fa zai ce shi ji shang de AUC (the area under ROC curve)zhi da dao 0.97,zheng que zhi shu da dao 0.846,you yu ji ta fang fa ,shui ming shang shu fang fa neng gou jian chan 、gao xiao de jin hang xi bao chuan tou tai de yu ce 。

论文参考文献

  • [1].新型矿用字符叠加器的设计[J]. 宋金玲,陈治国.  电视技术.2004(09)
  • [2].基于主曲线的相似字符模糊分类方法[J]. 张红云,苗夺谦,李道国.  模式识别与人工智能.2005(06)
  • [3].两种不同形式视频字符叠加器的设计[J]. 杨玉胜.  辽宁教育行政学院学报.2003(09)
  • [4].网页可配置的多路字符叠加系统设计[J]. 刘地军,徐利.  信息安全与通信保密.2009(07)
  • [5].用于字符数控加工的图像细化算法[J]. 李升杰,陈钢,钟毅芳.  华中科技大学学报(自然科学版).2002(04)
  • [6].自定义字符灵活高效输入方案的设计与实现[J]. 刘书家.  哈尔滨电工学院学报.1991(03)
  • [7].计算机终端信息显示设备中的字符产生[J]. 刘志勤.  火控技术.1981(01)
  • [8].图书馆海量书目光学字符特征的分类技术[J]. 刘雪飞,苟全登.  激光杂志.2017(09)
  • [9].程序点阵字符产生器[J]. 孙茂印.  工学学报.1978(01)
  • [10].一种新型的视频字符叠加器的设计[J]. 江一帆,刘家康,陈星宇.  电视技术.2002(01)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自计算机仿真的方春,孙福振,李彩虹,邢林林,发表于刊物计算机仿真2019年10期论文,是一篇关于深度学习论文,字符嵌入论文,细胞穿透肽论文,预测论文,计算机仿真2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自计算机仿真2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    方春:基于深度学习和字符嵌入的细胞穿透肽预测论文
    下载Doc文档

    猜你喜欢