药物分子与手性固定相的相互作用研究

药物分子与手性固定相的相互作用研究

论文摘要

手性是自然界的基本属性,手性化合物在日常生活中广泛存在。对手性化合物的研究一直是化学家研究的热点。本文采用分子动力学模拟方法研究了手性化合物与多糖类手性固定相Chiralcel OJ的相互作用。论文主要包括三个部分。论文第一部分为研究溶剂效应和温度对手性化合物在高效液相色谱拆分时其绝对构型的出峰顺序的影响。不同的溶剂对化合物与手性固定相的相互作用的影响不同,主要是影响疏水作用、偶极-偶极相互作用、分子间氢键以及π-π相互作用。该部分详细介绍了使用Materials Studio Modeling软件时各种参数如何设置、如何构建化合物的初始结构。研究表明,对于溶剂效应和温度的设置要按照实际实验时的分离条件进行设置,能够达到较理想的模拟结果。该部分研究有助于更好的理解溶剂效应和温度对手性分离机理的影响。论文第二部分主要是研究动力学模拟与预测手性药物对映体在高效液相色谱中的分离出峰顺序。这部分的研究,主要是为了验证本文所采用的计算方法的可靠性。选择14种具有已知对映体出峰顺序的药物分子,对其进行动力学模拟和优化,得到了较好的结果,模拟的对映体的出峰顺序与试验结果一致。本部分的工作,有望从分子水平上得到药物分子与手性固定相的相互作用模型,可以帮助了解手性识别发生的部位及主要影响因素。而且有望使分子模拟方法成为手性拆分时判断出峰构型的一个辅助工具,以弥补HPLC分离技术无法判断出峰绝对构型这一缺憾。第三部分为手性药物分子的定量结构-保留因子关系(QSRFR)和定量结构-分离因子关系(QSSFR)研究。主要是对一系列具有相似分子骨架的手性化合物在Pirkle型手性固定相中的分离规律加以研究。采用VolSurf方法计算分子的三维结构信息,将其转换为容易理解和解释的VolSurf参数,采用PLS方法分别建立参数与手性化合物的QSRFR关系模型,对结果进行分析。将后出峰对映体与先出峰对映体的VolSurf参数分别对应相减,得到新的参数,建立该参数与分离因子的QSSFR模型,模型用于预测具有相似分子结构的手性化合物对映体的拆分顺序,对手性分离机理的理解有一定帮助。参数分析结果表明,二芳基甲基酯类化合物分子中含有适当的亲水区域和局部的疏水体积对保留因子有利,分子中含有较多的氢键给体区域和一定的氢键受体区域也对logk值有利。而乙内酰脲类化合物和丙二烯类化合物则要含有较多的氢键受体区域对其分离有利。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • Abstract
  • 目录
  • 第一章 文献综述
  • 1.1 手性化合物
  • 1.1.1 手性
  • 1.1.2 立体化学
  • 1.1.3 拆分方法
  • 1.2 分子动力学模拟概述
  • 1.2.1 基本原理
  • 1.2.2 牛顿运动方程的数值解法
  • 1.2.3 边界条件
  • 1.2.4 分子动力学的力场
  • 1.3 本论文工作思路
  • 参考文献
  • 第二章 溶剂效应和温度对药物分子对映体出峰顺序的影响
  • 2.1 引言
  • 2.2 计算方法
  • 2.2.1 固定相
  • 2.2.2 药物分子
  • 2.2.3 复合物
  • 2.3 溶剂效应
  • 2.3.1 咪康唑及其衍生物
  • 2.3.2 吡唑类
  • 2.4 温度
  • 2.4.1 计算结果
  • 2.4.2 结论
  • 2.5 本章小结
  • 参考文献
  • 第三章 动力学模拟及出峰顺序预测
  • 3.1 引言
  • 3.2 计算结果
  • 3.2.1 模型构建及计算方法
  • 3.2.2 计算结果与讨论
  • 3.3 机理分析
  • 3.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第四章 手性药物的QSRFR/QSSFR研究
  • 4.1 引言
  • 4.2 定量构效关系(QSAR)
  • 4.3 VolSurf
  • 4.4 手性药物的QSRFR/QSSFR研究
  • 4.4.1 计算方法
  • 4.4.2 计算流程
  • 4.4.3 结果与讨论
  • 4.5 本章小结
  • 参考文献
  • 第五章 总结与展望
  • 5.1 总结
  • 5.2 创新点
  • 5.3 展望
  • 附录一
  • 作者简历
  • 相关论文文献

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