番茄T-DNA插入黄叶突变体的基因克隆及鉴定

番茄T-DNA插入黄叶突变体的基因克隆及鉴定

论文摘要

突变体是功能基因组学研究的重要工具。叶色突变体作为一类显而易见的突变表型,由于叶绿素合成、降解及叶绿体的发育往往受到突变基因直接或间接影响,从而改变叶绿素的含量,导致叶色变异的产生。叶色突变体对研究植物光合系统和叶绿体的结构、功能及调控机制具有重要的意义。本研究以T-DNA插入番茄黄化突变体yl (yellow-leaf, yl)为材料,通过对突变体的突变原因进行鉴定,遗传规律和光合特性进行研究,克隆突变基因并对其进行功能鉴定,从植物生理、遗传和分子水平初步探讨yl突变体的黄化机理,为yl突变体在番茄光合生理、功能因组学研究和生产等方面提供一定的理论依据。主要结果如下:1.yl1突变体的表型特征,yl突变体从子叶时期至整个生长期叶色都保持黄化的表型,yl突变体植株较野生型矮小,生长势也较弱。2.yl突变体的鉴定及遗传分析表明,yl突变体为T-DNA插入造成的功能缺失型突变体,为单位点插入,该表型是由隐性单基因控制的,与外源基因的表达没有关系。3.yl突变体的光合特性研究表明,yl突变体顶端第三片叶的叶绿素a、叶绿素b及类胡萝卜素含量均显著低于野生型;野生型的叶绿体结构是比较规则和完好的纺锤形,有正常的类囊体,基粒片层丰富且排列紧密,而yl突变体的叶绿体结构混乱,看不出具体形状,基粒片层堆叠减少,排列不够紧凑和丰富,而且叶绿体中还出现类似降解的空洞;yl突变体的净光合速率也显著低于野生型。4.通过hiTAIL-PCR方法扩增到y1突变体T-DNA插入位点的右翼序列,对右翼序列进行blast比对及T-DNA插入与表型分离验证表明,T-DNA插入位点为番茄第1条染色体上的编号为SGN-U579512基因的第8个外显子,位于该基因的1901 bp处。根据功能注释(RuBisCO large subunit-binding protein subunit alpha),该基因为核酮糖1,5-二磷酸羧/加氧酶的大亚基结合蛋白的a亚基,将该基因命名为RLBPaα。Rubisco位于高等植物叶绿体间质内,占叶绿体可溶性蛋白的50%,是外界C02进入生物体转化为有机碳的催化剂,对净光合速率起着决定性作用。通过对yl突变体的Rubisco羧化酶活性及可溶性蛋白含量的测定,结果表明yl突变体的Rubisco羧化酶活性及可溶性蛋白含量较对照显著降低,且可溶性蛋白降低了44%。5.采用VIGS的方法验证yl突变体的表型是否由于RLBPα缺失引起的,构建pTRV2病毒表达载体,通过农杆菌侵染注射法侵染野生型和yl突变体,侵染2周后的野生型植株叶色变黄,yl突变体叶片发白,并对RLBPα的表达量进行检测,以及叶绿素和可溶性蛋白含量进行测定,结果显示RLBPα基因的表达量较对照有所降低,叶绿素和可溶性蛋白含量都显著降低。

论文目录

  • 摘要
  • Abatract
  • 英文缩略词
  • 1 文献综述
  • 1.1 课题的提出
  • 1.2 叶色突变体的研究进展
  • 1.2.1 植物叶色突变体获得方法
  • 1.2.2 叶色突变体的分子机制研究
  • 1.2.3 叶色突变体的应用
  • 1.3 Rubisco与光合作用的关系
  • 1.3.1 Rubisco的结构
  • 1.3.2 Rubisco的组装
  • 1.3.3 Rubisco的功能
  • 1.3.4 叶色突变体与Rubisco的关系
  • 1.4 本研究的目的及意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 植物材料及种植
  • 2.1.2 菌株和质粒
  • 2.1.3 工具酶、试剂盒及试剂
  • 2.1.4 引物设计及序列测定
  • 2.2 yl突变体的鉴定及遗传分析
  • 2.2.1 喷施卡那霉素
  • 2.2.2 PCR检测
  • 2.2.3 RT-PCR检测目的基因表达
  • 2.3 yl突变体的光合特性研究
  • 2.3.1 叶片叶绿素和类胡萝卜素的测定
  • 2.3.2 透射电子显微镜(TEM)分析
  • 2.3.3 净光合速率的测定
  • 2.4 yl突变体基因的克隆与功能分析
  • 2.4.1 hiTAIL-PCR分离侧翼序列
  • 2.4.2 T-DNA插入与yl突变体表型共分离的PCR检测
  • 2.4.3 候选基因RLBPα的表达量检测
  • 2.4.4 Rubisco羧化酶活性的测定
  • 2.4.5 可溶性蛋白的测定
  • 2.4.6 VIGS方法沉默RLBPα基因
  • 2.4.7 在番茄中沉默RLBPα的功能检验
  • 2.4.7.1 可溶性蛋白的测定
  • 2.4.7.2 叶片叶绿素和类胡萝卜素的测定
  • 2.4.7.3 RLBPα及RbcL表达量检测
  • 3 结果与分析
  • 3.1 yl突变体的表型
  • 3.2 yl突变体突变类型的鉴定
  • 3.2.1 目的基因的表达量检测结果
  • 3.2.2 表型与T-DNA插入共分离检测
  • 3.3 yl突变体的遗传分析
  • 3.4 yl突变体叶绿素含量测定与分析
  • 3.5 yl突变体叶绿体超微结构的观察及分析
  • 3.6 yl突变体的净光合作用的测定和分析
  • 3.7 T-DNA插入位点右翼序列的分离及生物信息学分析
  • 3.8 T-DNA插入与yl突变体表型共分离分析
  • 3.9 RLBPα基因的表达量检测
  • 3.10 yl突变体的Rubisco羧化活性及可溶性蛋白的测定
  • 3.11 VIGS沉默RLBPα的结果及分析
  • 3.11.1 pTRV2-RLBPα载体的构建
  • 3.11.2 VIGS沉默RLBPα的效果
  • 3.11.3 VIGS沉默后RLBPα和RbcL表达量检测
  • 3.11.4 RLBPα沉默后番茄叶片叶绿素和类胡萝卜素含量测定
  • 3.11.5 RLBPα沉默后番茄叶片叶可溶性蛋白测定
  • 4 总结
  • 5 讨论
  • 5.1 T-DNA的整合位点
  • 5.2 VIGS是有效沉默目的基因的方法
  • 5.3 yl突变体黄化性状的原因推测
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 相关论文文献

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