论文摘要
本实验根据HCV感染者的临床资料将所得样本分为携带组、HCC组、非HCC组三组,首先应用HCV-1b基因型特异性引物采用巢式PCR的方法对三组血清样本进行基因分型。然后应用巢式PCR的方法扩增出已确定为1b基因型的Core区核苷酸序列片段,应用PCR产物直接测序法进行核苷酸序列的测定,并使用CLUSTAL W package软件的N-J plot程序使用neighbor-joining方法对扩增出的Core区核苷酸序列进行画系统树分析。再采用巢式PCR的方法扩增出NS31027-1206区的核苷酸序列片段,采用PCR产物直接测序法进行核苷酸序列的测定。应用Chromas软件将所得的NS31027-1206区的核苷酸序列直接翻译成氨基酸序列进行三组间对照比较分析后使用GENETYX-Mac ver 10.1软件分析NS31027-1206区的蛋白质二级结构。我们旨在探讨究竟HCV-1b型的Core区、NS3区与原发性肝细胞癌的形成是否有关联。结果显示长春、吉林两地的HCV感染者以1b型为主,比例都在70%以上,应用基因型特异性引物法扩增出的Core区的核苷酸序列保守,该段基因序列与HCC的形成不相关。NS31027-1206羧基端aa1163-aa1206部分转角结构的左右转向的不同,将NS31027-1206区的蛋白质二级结构分为A、B 2种,其中向右旋转的为A组,向左旋转的为B组,HCC组以B组结构为主,HCV-NS31027-1206区的蛋白质二级结构与HCC的形成相关。
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