论文题目: Smith-Fineman-Myers综合征致病基因的精细定位及候选基因分析
论文类型: 博士论文
论文专业: 遗传学
作者: 刘奇迹
导师: 龚瑶琴
关键词: 综合征,基因定位,短串联重复序列,突变分析,定位候选克隆
文献来源: 山东大学
发表年度: 2005
论文摘要: Smith-Fineman-Myers综合征(Smith-Fineman-Myers syndrome,SFMS,MIM309580)是一种X连锁智力低下综合征,其主要临床表现为智力低下、异常面容、小头、小下颌、侏儒、癫痫和肌张力低下。自Smith等1980年首次报道2例SFMS患者以来,目前已发现了多个SFMS家系,但尚未分离到导致该综合征的致病基因。1999年,龚瑶琴等采用X染色体扫查方法,对在山东省遗传病调查中发现的SFMS家系进行了连锁分析,将SFMS基因定位于Xq25上的DXS8064和DXS8050之间的14.6cM区域。由于该区域较大,直接采用定位克隆方法分离SFMS致病基因非常困难,为鉴定得到山东SFMS家系的致病基因,我们做了以下工作。 一、由于在SFMS家系致病基因关键区域内X染色体上的已知多态位点要么在家系中没有多态,要么间距太大,为了最大限度的缩小定位区域,我们首先利用BCM Search Launcher程序从原定位区域上、下边界附近筛选出了8个短串联重复序列,通过利用PCR—变性聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对100名无血缘关系的汉族女学生DNA进行分析发现,只有5个位点在汉族人群中具有多态性,分别命名为XSTR1、XSTR2、XSTR3、XSTR4和XSTR5。其中XSTR1、XSTR2和XSTR3位于NT077819内。XSTR1为(AAAT)n重复,有5个等位基因,杂合度为0.6156;XSTR2为(GT)n重复,有9个等位基因,杂合度为0.6305;XSTR3为(GT)n重复,有7个等位基因,杂合度为0.6266。XSTR4和XSTR5位于NT011786内,其中XSTR4为(AG)n重复,有3个等位基因,杂合度为0.465,XSTR5为(CCTT)n重复,有11个等位基因,杂合度为0.84。x~2检验表明,各位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。这些多态位点的发现,为对山东SFMS家系进行精细定位以及位于该区域的基因进行连锁分析和间接诊断提供了基础。 二、为缩小山东SFMS家系致病基因的候选区域,我们又从定位区域边界处选择了CEN-DXS6854-DXS6855-DXSS068-DXS1187-DXS8071-DXS6748-DXS8041-DXS691-TEL
论文目录:
中文摘要
英文摘要
论文正文
前言
第一部分
材料与方法
结果
讨论
第二部分
材料与方法
结果
讨论
第三部分
材料与方法
结果
讨论
第四部分
材料与方法
结果
讨论
附图表
参考文献
致谢
发表论文
学位论文评阅及答辩情况表
发布时间: 2005-10-17
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