基于多模板弹性配准的鼻咽癌危及器官自动分割

基于多模板弹性配准的鼻咽癌危及器官自动分割

论文摘要

随着计算机技术的发展,放射治疗技术也从二维治疗进入到了三维精确治疗阶段。在三维精确治疗中,对患者危及器官及肿瘤的勾画要求也越来越高。实践中手工勾画存在耗时长和专家勾画互相之间,专家自身在不同时间勾画结果不同等问题。因此需要快速的而准确的勾画出危及器官。鼻咽癌作为我国东南沿海地区的高发肿瘤,肿瘤附近区域是人体中一个结构极为复杂且十分重要部位,因此鼻咽癌危机器官的自动勾画的实现具有十分重大的临床意义。本文首先概要的介绍了国内外鼻咽癌放射治疗的现状,并讨论了临床中自动分割的必要性。同时给出了本文研究的基本路线。其次用三步法实现鼻咽癌危及器官的自动分割。在第一步中主要介绍基本的线性形变配准和相关的评价方案,并简介了图像配准基本框架的四个要素:几何变换,图像插值,相似性测度以及优化算法。同时介绍了EMMA算法步骤。最后在基于ITK软件包的基础上实现了线性配准。第二步中介绍基于线性配准的多边形平滑非线性配准。包括欧氏对数多边形仿射变换框架和块配准的方法,然后说明如何用其对多边形平滑配准的评估。最后一步介绍并实现形状限制的密度形变配准。主要对于高斯窗口局部相关因子(Local correlation coefficients, LCC)进行详细介绍。并用ITK工具箱实现了全自由度形变配准的编程。本文的最后一部分介绍了STAPLE(Simultaneous Truth and Performance Level Estimation)方法及如何使用STAPE方法进行多模板自动勾画的合成。同时介绍本文提出的模板选取的方法,及临床自动分割结果的三种评价方法,包括DICE相似度方法、变形距离法、体积差异法。实践测试中,使用两个不同的医院的病例数据,这些都经过专家用手工勾画好了危及器官,分别选取了7例病例来作为模板数据库。以此对于15例待勾画病例进行了自动勾画。通过专家手工勾画的15例的结果与自动勾画结果、自动勾画修正的结果进行三种方法的评价。实验证明,本文提出了的方法可以进一步提高自动勾画的准确性。同时大幅度的减少了临床医生勾画的时间。

论文目录

  • 中文摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 引言
  • 1.1 研究背景及意义
  • 1.2 图像融合配准在放射治疗中的应用
  • 1.3 鼻咽癌危及器官自动分割概述
  • 1.4 本文研究内容
  • 1.5 研究方法和技术路线
  • 1.6 论文的组织结构
  • 第三章 医学图像配准的原理、基本步骤和线性配准
  • 2.1 图像配准的原理
  • 2.1.1 配准的基本步骤
  • 2.2 EMMA线性配准
  • 2.2.1 EMMA方法介绍
  • 2.2.2 交互信息的随机最大值化
  • 2.2.3 协变量的评价
  • 2.3 ITK配准简介及刚性配准结果
  • 2.3.1 ITK软件中配准框架的设计
  • 2.3.2 利用ITK读取图像文件
  • 2.3.3 ITK图像刚性配准流程
  • 2.4 本章小结
  • 第三章 多边形平滑非线性配准
  • 3.1 引言
  • 3.1.1 多变形平滑配准介绍
  • 3.1.1.1 欧氏对数多边形仿射变换框架
  • 3.1.1.2 快速LEPT计算(Fast Polyaffine Transform,FPT)
  • 3.2 块配准方法对多边形平滑配准的评估
  • 3.2.1 块匹配基本原理
  • 3.2.2 块配准应用于多边形平滑配准评估的基本前提
  • 3.2.3 块配准应用于多边形平滑配准的评估
  • 3.3 评估的方法选择
  • 3.4 本章小结
  • 第四章 形状限制的密度形变配准
  • 4.1 引言
  • 4.1.1 局部相关因子和
  • 4.1.2 LCC基本方法介绍
  • 4.1.3 使用卷积进行计算
  • 4.1.4 LCC优化
  • 4.2 形状限制的密度形变配准
  • 4.3 ITK形变配准实现
  • 4.4 本章小结
  • 第五章 STAPLE方法合并多模板靶区的应用
  • 5.1 模板选择
  • 5.2 STAPLE(SIMULTANEOUS TRUTH AND PERFORMANCE LEVEL ESTIMATION)方法介绍
  • 5.2.1 STAPLE算法的的一些假设
  • 5.2.2 STAPLE算法
  • 5.2.3 STAPLE总结及其初始条件选择和收敛性
  • 5.3 使用STAPLE自动分割结果
  • 5.3.1 分割结果评价方法介绍
  • 5.3.2 模板病例的选取方法
  • 5.3.3 自动分割结果及讨论
  • 5.4 本章小结
  • 第六章 总结与展望
  • 6.1 总结
  • 6.2 展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 个人简历、在学期间的研究成果及发表的学术论文
  • 相关论文文献

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