肺癌患者循环DNA中表皮生长因子受体（EGFR）突变的检测及其临床意义

论文摘要

目的探讨直接测序法、单克隆基因测序法和高分辨率溶解曲线法在肺癌患者血浆循环DNA中EGFR突变检测的临床应用价值,并结合临床资料分析肺癌患者EGFR突变与临床病理特征之间的关系。方法收集苏州大学附属第一医院及上海部分三甲医院96例肺癌患者的血浆以及其中59例相对应的肿瘤组织,提取组织及血浆循环DNA,采用直接测序法、单克隆基因测序法及高分辨率溶解曲线法检测EGFR基因19,21外显子的突变,并将高分辨率溶解曲线法检测的结果与直接测序法、单克隆基因测序法的结果进行了比较;同时应用高分辨率溶解曲线法检测含不同比例EGFR基因突变型质粒的系列混合样本,评价灵敏度。结果1. 96例肺癌血浆中检测出EGFR突变17例,其突变率为17.7%。在这些突变的样本中,外显子19和21突变分别占88.2%（15/17例）和11.8%（2/17例）,其中直接测序法检测出EGFR纯合突变3例（L858R 2例、del E746-A750（1）1例）,杂合突变14例。对这14例杂合突变样本进一步通过单克隆基因测序法确定了它们的突变类型为（del E746-A750（2）9例,del E746- A750（1）3例,del L747-S752 2例）。2.经HRM法,在96例肺癌患者中检测出17例发生了EGFR突变,突变率为17.7%,其中外显子19和21突变分别占88.2%（15/17例）和11.8%（2/17例）;经与测序法的结果比对完全一致。此外,HRM法可检出系列混合样本中突变型质粒比例为5%的突变,其检测灵敏度达5%。3. EGFR基因突变多见于肺腺癌患者,与患者的性别与吸烟史无明显相关性。对59例肺癌患者肿瘤组织的进一步分析证明,血浆EGFR基因突变类型与患者自身肿瘤的突变类型相同,表明血浆DNA检测到的EGFR突变与原发肿瘤检测到的突变相一致。结论1.传统的直接测序法可用于基因突变的检测,但当检测到杂合突变样本时,由于其测序图谱出现杂合套峰,不能确定样本的突变类型,而此时通过单克隆基因测序法就能明确地判断基因的突变类型。2. HRM法可作为临床EGFR突变筛查的优选方法,其操作简单易行,快速,灵敏度为5%,与测序法比较,检测结果一致。3.肺癌患者的血浆循环DNA与相对应的肿瘤组织DNA的EGFR基因突变类型一致,可说明以血浆游离DNA可作为肿瘤组织DNA的替代材料进行EGFR基因突变检测。

论文目录

• 中文摘要
• Abstract
• 前言
• 第一部分 单克隆基因测序法检测血浆循环DNA 中EGFR 基因突变及临床意义
• 1 材料和方法
• 2 结果
• 3 讨论
• 第二部分 高分辨率熔解曲线（HRM）法检测血浆循环DNA 中EGFR 基因突变方法学的建立及其应用
• 1 材料和方法
• 2 结果
• 3 讨论
• 结论
• 参考文献
• 综述
• 参考文献
• 攻读学位期间公开发表的论文
• 中英文对照缩略词表
• 致谢