猪FBPs、RBP4基因多态性及与产仔性状的关联分析

猪FBPs、RBP4基因多态性及与产仔性状的关联分析

论文摘要

子宫容量是多胎动物窝产仔数的主要组分性状和终端决定因素,是一个品种/品系的窝产仔数性状的极限值。子宫容量可被解析为母体遗传决定的子宫环境效应,母胎间养分的转运效率和胎盘效率,胎儿遗传机制决定的胚胎活力,特别是对养分和空间限制性环境下的应对或适应能力等多种组分性状。叶酸和视黄醇通过参与细胞增殖和组织分化及保护胚胎免于氧化损伤而对母猪妊娠有着重要意义。本研究基于两个母系猪群体(湖南黑猪和大白猪)对编码母胎间叶酸和视黄醇转运的载体系统的sFBP、mFBP和RBP4基因的基因结构及与LS性状关联进行了研究,获得了以下结果:1)证实了sFBP基因5’UTR中的Ins/Del与LS性状显著相关(P<0.05),但是,在不同的群体中,结果存在差异。在湖南黑猪和大白猪群体中,三种基因型母猪在TNB上的表现关系为ID>II>DD,等位基因I为LS有利等位基因.。2)发现猪RBP4基因MspⅠRFLP是由内含子3中的G692C所致。RBP4 MspⅠRFLP与湖南黑猪和大白猪LS性状显著相关(P<0.05),等位基因A为LS性状有利等位基因。3)成功地建立了一个基于公共数据库和分析平台的EST扫描方案,对sFBP基因和mFBP基因外显子区域的各种类型的多态性进行筛选。在sFBP基因转录本水平发现了9个候选多态性位点,其中6个多态性位点为本研究或其它研究者所证实;并针对所有候选SNP中唯一的错义突变建立了巢式-错配PCR TaqⅠRFLP标记分型技术,为以后深入进行性状关联分析奠定了基础。在mFBP基因内,共筛选出了转录本上的候选多态性位点18个,其中7个候选位点与其他研究者的报告相印证,4个候选位点为本研究中采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法所证实。4)通过上述生物信息学途径,在与RBP4基因上内含子3中的G692C位点相距—196 bp的位置发现一个无义G496A,研究表明这一多态性与LS性状显著相关(P<0.05),A为LS性状有利等位基因。但在只考虑任一单独位点时,由于群体中这两个位点的连锁相分布差异,源于另一位点的效应都可能对该位点与性状的关联分析结果带来误差,易导致不同的研究和不同的群体中得到的结果不一致甚至相反。这也可能是多个将G692C作为LS性状候选标记的研究中,在关联性和LS有利等位基因上得到的结果往往不一致的重要原因。研究结果显示,G496A与G692C构成的4种单倍型(P<0.05)与LS性状(包括TNB和NBA)显著相关,表现为AG>AC>GG>GC。育种中基于这两个位点组成的单倍型进行选择,可兼顾两个位点对LS的效应,获得更大的选择效率。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1 母猪子宫容量生理机制
  • 2 子宫容量的遗传机制及其在多胎动物产仔数改进中的遗传选择
  • 3 猪子宫容量(UC)候选基因及QTL的筛选与研究现状
  • 4 研究目标与内容
  • 第二章 sFBP基因Ins/Del多态性与湖南黑猪和大白猪产仔数关联研究
  • 1 材料与方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 第三章 sFBP和mFBP基因多态性
  • 1 材料与方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 第四章 RBP4基因Msp Ⅰ RFLP与猪窝产仔数性状的关联分析
  • 1 材料与方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 第五章 G496A拓展了RBP4基因在选择改进猪窝产仔性状上的应用价值
  • 1 材料与方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 参考文献
  • 作者学术简历
  • 致谢
  • 附录Ⅰ 主要仪器、药品与常规试剂
  • 附录Ⅱa
  • 附录Ⅱb
  • 相关论文文献

    • [1].2型猪链球菌Fbps基因敲除突变体的构建及毒力分析[J]. 生物技术通讯 2012(05)
    • [2].猪链球菌2型粘附相关因子MRP、FBPS和CPS2J荧光定量PCR检测方法的建立(英文)[J]. Agricultural Science & Technology 2013(10)

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