杨小芳:基于转录组测序分析姜黄代谢产物差异表达基因论文

杨小芳:基于转录组测序分析姜黄代谢产物差异表达基因论文

本文主要研究内容

作者杨小芳(2019)在《基于转录组测序分析姜黄代谢产物差异表达基因》一文中研究指出:姜黄为姜科姜黄属多年生草本植物,作为中药材应用的姜黄的根状茎已有上千年历史,目前已有科学研究证明姜黄素类化合物有着抗肿瘤、抗氧化、治疗Ⅱ型糖尿病等药理功效。姜黄属种质的转录组信息、基因组信息目前尚不完善,要想在基因工程中探索关键基因,应在姜黄属种质的质量改善过程中采用高通量的方法。有许多酶基因参与到姜黄素的生物合成中,但酶基因功能开始的时间、功能发挥作用的位点以及如何发挥具体作用仍然是不确定的。本研究对不同产地的姜黄属种质进行姜黄素类化合物成分质量筛选,同时优化筛选最佳提取工艺,对两种姜黄属种质及同一姜黄属种质不同组织进行转录组mRNA测序以达到筛选差异表达基因,挖掘出与姜黄素类化合物合成有关基因的目的,并进行外源物质代谢调控分析。主要的研究成果如下:1.超声波辅助提取法单次提取姜黄素类化合物的最佳工艺条件:甲醇浓度100%,固液比1:5(g.mL-1),提取时间2min。2.12种姜黄属种质中姜黄素含量百分比为0.03%-1.23%,去甲氧基姜黄素为0.02%-1.22%,双去甲氧基姜黄素为0.02%-1.5%,GXNN与GY01种质的姜黄素类化合物含量较高,分别达到6.84%和3.82%。3.姜黄转录组测序获得的clean reads通过优化组装和拼接共获得115587个unigene。GXNN和FJLY种质中筛选出类黄酮生物合成途径差异表达基因10个,苯丙烷类生物合成途径差异表达基因45个,二苯乙烯类、二芳基庚烷类和姜辣素生物合成途径差异表达基因5个。叶片和根状茎中筛选出类黄酮生物合成途径差异表达基因26个,苯丙烷类生物合成途径差异表达基因114个,二苯乙烯类、二芳基庚烷类和姜辣素生物合成途径差异表达基因14个。4.姜黄属种质中15个候选基因实时荧光定量PCR与RNA测序基因表达模式的变化趋势整体保持一致,可以根据RNA测序结果分析姜黄中姜黄素类化合物合成相关基因动态变化以及不同种质姜黄素类化合物含量差异。5.1.00 mmol.L-1浓度的外源NO供体硝普钠(SNP)溶液促进姜黄素类化合物合成,其中4CL1、HCT1、HCT3、HCT5和PAL1基因表达量下降,4CL2、HCT2、HCT4、PAL3、PAL4、CHS2和CHS4表达量增加,CHS3表达量无变化。50 mmol.L-1浓度的NaCl溶液抑制姜黄素类化合物合成,4CL1、HCT1、HCT3、HCT5、PAL4和CHS4基因表达量下降,PAL1、4CL2、HCT2、HCT4、PAL3、CHS2和CHS3表达量增加。

Abstract

jiang huang wei jiang ke jiang huang shu duo nian sheng cao ben zhi wu ,zuo wei zhong yao cai ying yong de jiang huang de gen zhuang jing yi you shang qian nian li shi ,mu qian yi you ke xue yan jiu zheng ming jiang huang su lei hua ge wu you zhao kang zhong liu 、kang yang hua 、zhi liao Ⅱxing tang niao bing deng yao li gong xiao 。jiang huang shu chong zhi de zhuai lu zu xin xi 、ji yin zu xin xi mu qian shang bu wan shan ,yao xiang zai ji yin gong cheng zhong tan suo guan jian ji yin ,ying zai jiang huang shu chong zhi de zhi liang gai shan guo cheng zhong cai yong gao tong liang de fang fa 。you hu duo mei ji yin can yu dao jiang huang su de sheng wu ge cheng zhong ,dan mei ji yin gong neng kai shi de shi jian 、gong neng fa hui zuo yong de wei dian yi ji ru he fa hui ju ti zuo yong reng ran shi bu que ding de 。ben yan jiu dui bu tong chan de de jiang huang shu chong zhi jin hang jiang huang su lei hua ge wu cheng fen zhi liang shai shua ,tong shi you hua shai shua zui jia di qu gong yi ,dui liang chong jiang huang shu chong zhi ji tong yi jiang huang shu chong zhi bu tong zu zhi jin hang zhuai lu zu mRNAce xu yi da dao shai shua cha yi biao da ji yin ,wa jue chu yu jiang huang su lei hua ge wu ge cheng you guan ji yin de mu de ,bing jin hang wai yuan wu zhi dai xie diao kong fen xi 。zhu yao de yan jiu cheng guo ru xia :1.chao sheng bo fu zhu di qu fa chan ci di qu jiang huang su lei hua ge wu de zui jia gong yi tiao jian :jia chun nong du 100%,gu ye bi 1:5(g.mL-1),di qu shi jian 2min。2.12chong jiang huang shu chong zhi zhong jiang huang su han liang bai fen bi wei 0.03%-1.23%,qu jia yang ji jiang huang su wei 0.02%-1.22%,shuang qu jia yang ji jiang huang su wei 0.02%-1.5%,GXNNyu GY01chong zhi de jiang huang su lei hua ge wu han liang jiao gao ,fen bie da dao 6.84%he 3.82%。3.jiang huang zhuai lu zu ce xu huo de de clean readstong guo you hua zu zhuang he pin jie gong huo de 115587ge unigene。GXNNhe FJLYchong zhi zhong shai shua chu lei huang tong sheng wu ge cheng tu jing cha yi biao da ji yin 10ge ,ben bing wan lei sheng wu ge cheng tu jing cha yi biao da ji yin 45ge ,er ben yi xi lei 、er fang ji geng wan lei he jiang la su sheng wu ge cheng tu jing cha yi biao da ji yin 5ge 。xie pian he gen zhuang jing zhong shai shua chu lei huang tong sheng wu ge cheng tu jing cha yi biao da ji yin 26ge ,ben bing wan lei sheng wu ge cheng tu jing cha yi biao da ji yin 114ge ,er ben yi xi lei 、er fang ji geng wan lei he jiang la su sheng wu ge cheng tu jing cha yi biao da ji yin 14ge 。4.jiang huang shu chong zhi zhong 15ge hou shua ji yin shi shi ying guang ding liang PCRyu RNAce xu ji yin biao da mo shi de bian hua qu shi zheng ti bao chi yi zhi ,ke yi gen ju RNAce xu jie guo fen xi jiang huang zhong jiang huang su lei hua ge wu ge cheng xiang guan ji yin dong tai bian hua yi ji bu tong chong zhi jiang huang su lei hua ge wu han liang cha yi 。5.1.00 mmol.L-1nong du de wai yuan NOgong ti xiao pu na (SNP)rong ye cu jin jiang huang su lei hua ge wu ge cheng ,ji zhong 4CL1、HCT1、HCT3、HCT5he PAL1ji yin biao da liang xia jiang ,4CL2、HCT2、HCT4、PAL3、PAL4、CHS2he CHS4biao da liang zeng jia ,CHS3biao da liang mo bian hua 。50 mmol.L-1nong du de NaClrong ye yi zhi jiang huang su lei hua ge wu ge cheng ,4CL1、HCT1、HCT3、HCT5、PAL4he CHS4ji yin biao da liang xia jiang ,PAL1、4CL2、HCT2、HCT4、PAL3、CHS2he CHS3biao da liang zeng jia 。

论文参考文献

论文详细介绍

论文作者分别是来自华侨大学的杨小芳,发表于刊物华侨大学2019-10-31论文,是一篇关于姜黄论文,姜黄素类化合物论文,转录组测序论文,差异表达基因论文,代谢调控论文,华侨大学2019-10-31论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自华侨大学2019-10-31论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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