水稻白叶枯病抗性基因Xa2的定位与克隆

水稻白叶枯病抗性基因Xa2的定位与克隆

论文摘要

水稻是世界上最重要的粮食作物之一,由水稻黄单胞杆菌(Xanthomonas oryzaepv.Oryzae,Xoo)引起的水稻白叶枯病是水稻最严重的细菌性病害,生产实践表明控制水稻白叶枯病最经济有效的措施是培育抗病品种。目前已经鉴定出约30个白叶枯病抗性基因,其中Xa21、Xa1、Xa26、Xa27、xa5和xa13得到分离和克隆。水稻白叶枯病抗性基因Xa2对日本菌系Ⅱ具有专一抗性。在此之前,Yoshimura et al.(1994)将Xa2初步定位于水稻第四染色体,与Xa1连锁且有2-16%的重组交换率。本研究的目的是将Xa2精细定位,并对定位区域内与抗性相关的候选基因进行遗传和功能分析,主要结果如下:1.构建包含1101个单株的IR24/IRBB2 F2群体,包含2769个单株的ZZA/IRBB2 F2群体。利用ZZA/IRBB2 F2群体中136个单株组成的随机群体,构建Xa2区域遗传连锁图。利用120个Xa2区域的SSR标记进行了抗感亲本多态性鉴定,发现其中12个在IR24/IRBB2间具有多态性,20个在ZZA/IRBB2间具有多态性。利用具有多态性的SSR标记将Xa2定位在HZR970-6与HZR645-2之间,共约200kb的距离。2.对标记HZR970-6与HZR645-2之间的DNA序列进行分析,筛选含有与抗性有关保守结构(如NBS,LRR,Kinase等)的基因。经过筛选,共得到6个含有NBS—LRR结构的候选基因,成簇分布在BAC克隆OSJNBb0085C12上,按其在BAC克隆排列顺序分别命名为RGA1、RGA5、RGA6、RGA7、RGA12和RGA14。3.根据这6个基因序列分别设计跨内含子的特异引物,从接种T7147后的IR24和IRBB2叶片中提取RNA,通过RT-PCR表达分析发现RGA5在两个亲本中都表达,但RGA12仅在IRBB2中表达。将这2个基因确定为Xa2的候选基因。4.对这2个侯选基因设计引物,进行长片段扩增,得到2个候选基因的全长序列,经质粒操作连接到表达载体pCAMBIA1301S中,电击入农杆菌。经农杆菌转化,将候选基因转入感病材料台北309和牡丹江8号中,获得再生植株。在苗期对2个候选基因的转化植株进行PCR鉴定,保存阳性单株。孕穗期接种鉴定,未能发现抗病能力较转化材料有明显改变的单株。5.分别构建两个候选基因的RNAi表达载体,电击入农杆菌。经农杆菌转化,将RNAi表达载体转入抗病亲本材料IRBB2中,获得再生植株,进行遗传功能验证。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 1 文献综述—植物抗病基因研究进展
  • 1.1 植物抗病基因的克隆
  • 1.1.1 图位克隆法
  • 1.1.2 转座子标签法
  • 1.1.3 同源序列法
  • 1.1.4 不同方法联合,优势互补
  • 1.1.5 已经克隆的植物抗病基因
  • 1.2 抗病基因保守结构及其相应的功能
  • 1.2.1 LRR的结构和功能
  • 1.2.2 NBS结构和功能
  • 1.2.3 TIR结构和功能
  • 1.2.4 受体激酶
  • 1.3 水稻白叶枯病研究
  • 1.3.1 水稻白叶枯病
  • 1.3.2 水稻白叶枯病的症状
  • 1.3.3 水稻白叶枯病病原菌的研究
  • 1.3.4 水稻白叶枯病的防治
  • 1.4 水稻白叶枯病抗病基因研究
  • 1.4.1 已克隆的抗白叶枯病显性基因研究
  • 1.4.2 已经克隆的抗白叶枯病隐性基因研究
  • 1.5 水稻抗白叶枯病机制的研究
  • 2 研究的目的和意义
  • 3 材料与方法
  • 3.1 实验材料
  • 3.1.1 实验材料及分析群体
  • 3.1.2 水稻白叶枯病菌菌株
  • 3.1.3 分子标记来源
  • 3.2 实验方法
  • 3.2.1 白叶枯病抗性鉴定
  • 3.2.2 SSR分析
  • 3.2.3 基因的精细定位
  • 3.2.4 侯选基因的表达分析
  • 3.2.5 抗病基因的预测
  • 3.2.6 序列分析
  • 3.2.7 候选基因的遗传转化
  • 3.2.8 RNAi载体的构建
  • 3.2.9 农杆菌介导的遗传转化
  • 4 结果与分析
  • 4.1 Xa2的遗传定位
  • 4.2 Xa2的精细定位
  • 4.3 目标区段ORF的序列分析
  • 4.4 候选基因的表达分析
  • 4.5 目标基因的选择
  • 4.6 遗传转化Xa2的候选基因
  • 4.7 RNAi遗传验证
  • 5 讨论
  • 5.1 基因组测序后基因克隆
  • 5.2 精细定位群体的选用
  • 5.3 Xa2区域几个白叶枯病抗病基因
  • 5.4 几个基因同源和进化分析
  • 5.5 白叶枯不同抗病基因在育种中的应用
  • 6 参考文献
  • 7. 在读期间发表文章
  • 致谢
  • 附录
  • 相关论文文献

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