本文主要研究内容
作者傅惠佳,王孟皓,刘西茹（2019）在《反复着床失败子宫内膜组织差异表达基因的生物信息学分析》一文中研究指出：目的应用生物信息学方法分析体外受精(in vitro fertilization,IVF)后反复着床失败(recurrent implantation failure,RIF)的相关基因,以探讨反复着床失败的发病机制。方法从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)公共数据平台(Gene Expression Omnibus,GEO)下载基因芯片数据集GSE111974,使用R语言筛选出反复着床失败和正常生育女性子宫内膜组织的差异表达基因(differentiallyexpressed genes, DEGs)。再利用生物信息学分析工具DAVID(The database forannotation,visualization and integrated discovery)对差异基因进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路分析,利用STRING(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes)在线数据库和Cytoscape软件进行蛋白互作网络分析。结果初筛出170个明显差异表达的基因,其中上调者127个,下调者43个。GO功能富集显示:这些DEGs主要富集于细胞膜、内质网等区域,主要参与氧化还原过程、细胞周期阻滞、脂质代谢过程等;主要与血红素结合、信号传递器活性、维甲酸结合、过氧化物酶活性等功能簇相关。KEGG分析显示其主要参与代谢途径信号通路、催产素信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等。STRING在线数据库和Cytoscape软件分析发现PTGS2、TOP2A、ACTA2等为反复着床失败的关键基因。结论采用生物信息学方法筛选出RIF患者子宫内膜组织差异表达的关键基因有PTGS2、TOP2A、ACTA2等,可能在RIF的发病机制中起重要作用。
Abstract
mu de ying yong sheng wu xin xi xue fang fa fen xi ti wai shou jing (in vitro fertilization,IVF)hou fan fu zhao chuang shi bai (recurrent implantation failure,RIF)de xiang guan ji yin ,yi tan tao fan fu zhao chuang shi bai de fa bing ji zhi 。fang fa cong mei guo guo li sheng wu ji shu xin xi zhong xin (National Center for Biotechnology Information, NCBI)gong gong shu ju ping tai (Gene Expression Omnibus,GEO)xia zai ji yin xin pian shu ju ji GSE111974,shi yong Ryu yan shai shua chu fan fu zhao chuang shi bai he zheng chang sheng yo nv xing zi gong nei mo zu zhi de cha yi biao da ji yin (differentiallyexpressed genes, DEGs)。zai li yong sheng wu xin xi xue fen xi gong ju DAVID(The database forannotation,visualization and integrated discovery)dui cha yi ji yin jin hang ji yin ben ti lun (Gene Ontology,GO)gong neng fu ji fen xi he jing dou ji yin he ji yin zu bai ke quan shu (Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)tong lu fen xi ,li yong STRING(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes)zai xian shu ju ku he Cytoscaperuan jian jin hang dan bai hu zuo wang lao fen xi 。jie guo chu shai chu 170ge ming xian cha yi biao da de ji yin ,ji zhong shang diao zhe 127ge ,xia diao zhe 43ge 。GOgong neng fu ji xian shi :zhe xie DEGszhu yao fu ji yu xi bao mo 、nei zhi wang deng ou yu ,zhu yao can yu yang hua hai yuan guo cheng 、xi bao zhou ji zu zhi 、zhi zhi dai xie guo cheng deng ;zhu yao yu xie gong su jie ge 、xin hao chuan di qi huo xing 、wei jia suan jie ge 、guo yang hua wu mei huo xing deng gong neng cu xiang guan 。KEGGfen xi xian shi ji zhu yao can yu dai xie tu jing xin hao tong lu 、cui chan su xin hao tong lu 、zhong liu huai si yin zi xin hao tong lu deng 。STRINGzai xian shu ju ku he Cytoscaperuan jian fen xi fa xian PTGS2、TOP2A、ACTA2deng wei fan fu zhao chuang shi bai de guan jian ji yin 。jie lun cai yong sheng wu xin xi xue fang fa shai shua chu RIFhuan zhe zi gong nei mo zu zhi cha yi biao da de guan jian ji yin you PTGS2、TOP2A、ACTA2deng ,ke neng zai RIFde fa bing ji zhi zhong qi chong yao zuo yong 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自第三军医大学学报的傅惠佳,王孟皓,刘西茹，发表于刊物第三军医大学学报2019年13期论文，是一篇关于反复着床失败论文,子宫内膜论文,生物信息学论文,基因论文,第三军医大学学报2019年13期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自第三军医大学学报2019年13期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：反复着床失败论文; 子宫内膜论文; 生物信息学论文; 基因论文; 第三军医大学学报2019年13期论文;