Δ-15脱氢酶基因克隆、表达及其活性分析

Δ-15脱氢酶基因克隆、表达及其活性分析

论文摘要

多不饱和脂肪酸(polyunsaturate fatty acids, PUFAs)是人体必需的营养物质,对人体有至关重要的作用,一旦缺少就会导致各种疾病的发生,所以在营养及医药方面具有很重要的作用。α-亚麻酸(α-linolenic acid,ALA)属于ω-3系列PUFAs,是合成二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid, EPA)与二十二碳六烯酸(docosahexaenoic acid, DHA)的前体,在维持人正常生理功能中起着至关重要的作用。莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)与单胞藻(Monodus subterraneus)是高产ω-3类PUFAs的两种微藻,ω-3类PUFAs生物合成途径中含有ALA合成的关键酶—Δ-15脂肪酸脱氢酶。本文以莱茵衣藻(C. reinhardtii)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,从中分别克隆了Δ-15脂肪酸脱氢酶全长基因,分别转化酵母和烟草,并进行了表达和生物学功能分析;同时完成了单胞藻的转录组测序和生物信息学分析,主要结果如下;分别提取拟南芥嫩叶与莱茵衣藻对数期细胞的总RNA,经纯化后,采用RT-PCR方法扩增得到的片段与pMD19-T载体连接后,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,经过PCR鉴定、样品测序、Blast分析,分别确定为莱茵衣藻的Δ-15脱氢酶基因(全长为1362 bp,编码419个氨基酸)和拟南芥的Δ-15脱氢酶基因(全长为1525 bp,编码447个氨基酸)。把这两种Δ-15脂肪酸脱氢酶基因分别插入毕赤酵母胞内表达载体pPIC3.5K中,电击转入毕赤酵母GS115菌株中,利用甲醇诱导毕赤酵母表达,经过RT-PCR检测、甲酯化毕赤酵母总脂肪酸并进行气相色谱分析,结果表明莱茵衣藻和拟南芥的Δ-15脂肪酸脱氢酶基因在毕赤酵母中均得到了表达,与转空载体的菌株相比,转Δ-15脂肪酸脱氢酶基因的菌株的亚油酸摩尔含量由44.3%下降至26.9%,同时ALA的摩尔含量相比转空载体的也有所提高,验证了Δ-15脂肪酸脱氢酶基因在体内的生物学功能,进而说明莱茵衣藻Δ-15脂肪酸脱氢酶是在亚油酸的距甲基端的第十五个碳原子处脱氢的,从而生成ALA。同时把两种Δ-15脂肪酸脱氢酶基因连接入植物表达载体pCAMBIA2300中,电击转化入根癌农杆菌LBA4404中。用含Δ-15脂肪酸脱氢酶基因的根癌农杆菌菌液侵染烟草叶盘,50 mg/L卡那霉素筛选出抗性芽,抗性芽生根。PCR检测Δ-15脂肪酸脱氢酶基因已经整合入烟草基因组中,RT-PCR检测表明Δ-15脂肪酸脱氢酶基因在烟草能够正常转录。为克隆PUFAs合成途径相关的高效新基因,对富含EPA的单胞藻(M. subterraneus)UTEX#B151的转录组测序并且进行分析。序列经拼接得到26,903条ESTs,序列长度大于500 bp的有10,792条,经Blastx分析得到17,232个独立基因。在此基础上,Blastx分析数据库为KEGG,有5,270个独立基因与各种代谢途径能够匹配上,得到了34条与PUFAs合成相关的基因,包括关键的6种脱氢酶基因和4种延伸酶基因,为第二代转基因植物的脂肪酸优化和品质改良提供了优良的基因。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 引言
  • 1.1 多不饱和脂肪酸及其功能
  • 1.1.1 多不饱和脂肪酸的来源
  • 1.1.2 多不饱和脂肪酸的生理功能
  • 1.1.3 多不饱和脂肪酸的生物合成
  • 1.2 脂肪酸脱氢酶及其基因研究进展
  • 1.2.1 脂肪酸脱氢酶概括
  • 1.2.2 脂肪酸脱氢酶的结构特征
  • 1.3 转基因植物生产长链多不饱和脂肪酸
  • 1.3.1 α-亚麻酸
  • 1.3.2 转基因植物生产长链多不饱和脂肪酸
  • 1.4 莱茵衣藻与单胞藻
  • 1.4.1 莱茵衣藻 Chlamydomonas reinhardti
  • 1.4.2 单胞藻 Monodus subterraneus
  • 1.5 本研究的立题依据和目的意义
  • 第二章 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 菌株与质粒
  • 2.1.2 培养基与抗生素
  • 2.1.3 酶与生化试剂
  • 2.1.4 溶液与缓冲液
  • 2.1.5 仪器设备
  • 2.1.6 种子和藻类来源
  • 2.2 研究方法
  • 2.2.1 单胞藻和莱茵衣藻的培养
  • 2.2.2 总RNA 提取
  • 2.2.3 RT-PCR
  • 2.2.4 DNA 凝胶回收
  • 2.2.5 双酶切体系
  • 2.2.6 DNA 片段与载体连接
  • 2.2.7 E.coli 化学感受态细胞制备
  • 2.2.8 E.coli 热激转化
  • 2.2.9 E.coli 质粒提取
  • 2.2.10 测序与序列分析
  • 2.2.11 毕赤酵母电击感受态细胞制备与电击转化
  • 2.2.12 诱导毕赤酵母表达
  • 2.2.13 毕赤酵母脂肪酸甲酯化
  • 2.2.14 烟草表达载体构建与烟草转化
  • 2.2.15 转基因烟草检测
  • 2.2.16 气相色谱法分析脂肪酸组分
  • 2.3 单胞藻转录组测序与分析
  • 2.3.1 单胞藻Δ-15 脱氢酶基因保守区扩增及分析
  • 2.3.2 转录组测序与序列分析
  • 第三章 结果与分析
  • 3.1 莱茵衣藻与拟南芥Δ-15 脱氢酶基因的克隆
  • 3.2 Δ-15 脱氢酶基因在毕赤酵母中的表达及活性分析
  • 3.2.1 毕赤酵母表达载体构建
  • 3.2.2 毕赤酵母转化及分析
  • 3.2.3 Δ-15 脱氢酶基因在毕赤酵母中的表达及活性分析
  • 3.3 Δ-15 脱氢酶基因转化烟草
  • 3.3.1 烟草表达载体构建
  • 3.3.2 农杆菌转化及分析
  • 3.3.3 烟草转化及分析
  • 3.4 单胞藻转录组测序及分析
  • 3.4.1 单胞藻Δ-15 脱氢酶基因保守区扩增
  • 3.4.2 单胞藻转录组测序及分析
  • 3.5 讨论
  • 3.5.1 毕赤酵母表达系统的选择
  • 3.5.2 Δ-15 脂肪酸脱氢酶基因的表达
  • 3.5.3 单胞藻转录组序列测定与分析
  • 第四章 全文结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简历
  • 相关论文文献

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