中国禾本科作物上镰孢菌属真菌分类的研究

中国禾本科作物上镰孢菌属真菌分类的研究

论文摘要

镰孢菌属(Fusarium)真菌是禾本科作物上最重要的病原真菌类群之一,也是重要的产毒真菌。因此,无论从植物病理学,还是从食品安全的角度来讲,对禾本科作物上的镰孢菌进行分类鉴定都具有非常重要的理论研究和实际应用意义。世界上的真菌分类学家多年来一直致力于不断提高镰孢菌分类水平,目前已经完成了镰孢菌中两个种的基因组序列测定,从分子水平上证明镰孢菌在寄主、地理分布上的多样性,发现了大量的新种和遗传上的多样性类群。这些被重新认识的镰孢菌在致病性、毒素等方面存在一定差异,在植物病理学、食品安全等方面具有重要意义。这些研究成果使人们对镰孢菌的研究进入了一个崭新的阶段。而我国近二十年来对镰孢菌的研究几乎处于停滞状态,这大大地阻碍了我国对镰孢菌病害的研究、以及出入境对镰孢菌病原的检测能力。为此,本论文采用与世界同一水平的形态学和分子生物学研究方法对重要的植物病原真菌—镰孢菌属真菌进行了分类研究,旨在明确我国禾本科作物上镰孢菌属真菌的种的多样性和遗传多样性,以及分布特点等,为镰孢菌引起的作物病害的病理学、流行学、病害防治等诸多方面的研究奠定基础,并为食品安全及出入境动植物产品中镰孢菌的快速和准确鉴定提供有益指导。本文对采自我国25个省、市、自治区的359份禾本科作物样品进行了镰孢菌的分离与培养,共获得了2100株的镰孢菌。采用传统的形态学分类和现代分子分类学方法,对我国禾本科作物上的镰孢菌进行分类和鉴定。共分离和鉴定出24个种的镰孢菌:F.verticillioides、F.fujikuroi、F.proliferatum、F.subglutinans、F.thapsinum、F.nygamai、F.oxysporum、F.solani、F.avenaceum、F.acuminatum、F.sinensis、F.poae、F.sporotrichioides、F.kyushuense、F.semitectum、F.bullatum、F.tangshanensis、F.pulveratum、F.equiseti、F.scirpi、F.reticulatum、F.graminearum、F.crookwellense、F.flocciferum。其中3个新种(F.sinensis,F.tangshanensis和F.pulveratum)、1个新组合(F.bullatum)和1个中国新记录种(F.kyushuense)。F.sinensis分离自山东省小麦,PDA上菌落酒红色,在单瓶梗上产生纺锤形、芜菁形两种小孢子及串生、聚生的厚垣孢子,与现存所有的镰孢菌相区别。同时,对F.sinensis及其近缘种F.avenaceum species complex的EF-1α序列片段进行了分析,从分子水平证明F.sinensis是一个与F.avenaceum近缘的单元进化群。中国新记录种F.kyushuense的特点是在多芽产孢细胞上产生大量拟纺锤形中孢子,PDA上菌落背面血红色,且不产生厚垣孢子,该种在世界上还未被普遍报道。直孢组作为禾本科作物上常见类群,在本试验中进行了较深入的研究。在研究中发现,F.pulveratum、F.tangshanensis和F.bullatum是符合直孢组形态特征的类群。本文从形态学上和分子水平证明它们是三个独立的种,分析了我国禾本科作物直孢组镰孢菌的遗传多样性。F.pulveratum从形态和EF-1α序列上与其它Fusarium种类明显不同,是一个显著的独立类群,这一类群以形成肉桂色粉末状菌落为最显著特征;F.tangshanensis和F.bullatum在形态和EF-1α序列分析上都是相近的类群,但F.tangshanensis大孢子从中部向两端逐渐弯曲变细,而F.bullatum较显著地在孢子上部突然弯曲,顶端收缩,两者形态上的差异与EF-1α序列分析结果一致,因此作为两个独立的种。本文研究从形态学和系统发育学水平上证明了F.bullatum既不应是自Gordon(1952)以来认为其是F.equiseti的异名,也不应是Burgess(1985)提出的F.scirpi的异名,而应为Sherbakoff(1915)提出的F.bullatum Sherb.。由于禾谷镰孢菌(F.graminearum)是我国小麦赤霉病的重要病原菌,本文筛选出19株F.graminearum进行EF-1α序列分析。结果表明,在我国禾本科作物上至少存在4个禾谷镰孢菌的谱系,其中谱系3为我国玉米上所特有,存在于玉米穗部和种子上。谱系2是我国首次报道的进化群,这一发现完成了谱系2在世界上从南美经尼泊尔向我国传播,进而进入韩国的这样一条传播路径。同时我国禾本科作物上的F.graminearum还有可能存在着更多的谱系。本文研究说明我国禾谷镰孢菌存在着丰富的遗传多样性,为今后我国禾谷镰孢菌的病害流行学和致病性等病理学方面的研究奠定了基础。

论文目录

  • 中文摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 禾本科作物上镰孢菌属的分类研究进展
  • 前言
  • 1.1 禾谷类作物上镰孢菌属真菌分类的意义
  • 1.1.1 禾谷类作物上镰孢菌属真菌分类研究在农业生产上的重要地位
  • 1.1.2 镰孢菌毒素污染粮食而引起的食品安全问题
  • 1.1.3 出入境动植物检疫的保障
  • 1.2 不同的种的概念下镰孢菌属真菌的分类
  • 1.2.1 形态学种的概念
  • 1.2.2 生物学种的概念
  • 1.2.3 系统发育学种的概念
  • 1.3 镰孢菌属形态学分类研究进展
  • 1.3.1 镰孢菌属的分类系统及主要分类系统的比较
  • 1.3.2 镰孢菌属的组
  • 1.3.3 镰孢菌属真菌的分类依据
  • 1.3.4.依代谢产物的分类研究
  • 1.3.5 数值分类
  • 1.3.6 影响镰孢菌在禾谷类作物上发生和分布的因素
  • 1.3.7 影响镰孢菌培养的因素
  • 1.3.8 我国禾谷类作物上的镰孢菌属真菌种类
  • 1.4 镰孢菌属生物学种的研究
  • 1.5 镰孢菌属系统发育学种的研究
  • 1.6 近些年我国Fusarium分类研究进展
  • 1.7 镰孢菌属分类研究展望
  • 第二章 中国禾本科作物上镰孢菌属真菌分类的研究方法
  • 2.1 形态学研究的材料与方法
  • 2.1.1 样品来源
  • 2.1.2 培养基
  • 2.1.3 试验方法
  • 2.2 分子生物学研究的材料与方法
  • 2.2.1 供试菌株
  • 2.2.2 DNA提取方法
  • 2.2.3 PCR扩增
  • 2.2.4 PCR产物纯化测序
  • 2.2.5 测序结果的处理及BLAST分析
  • 2.2.6 系统树的建立
  • 2.3 结果
  • 第三章 李瑟组Section Liseola
  • 3.1 轮枝镰孢菌
  • 3.2 藤仓镰孢菌
  • 3.3 层生镰孢菌
  • 3.4 胶孢镰孢菌
  • 3.5 黄色镰孢菌
  • 3.6 合欢镰孢菌
  • 3.8 李瑟组讨论
  • 第四章 美丽组Section Elegans
  • 4.1 尖孢镰孢菌
  • 4.2 美丽组讨论
  • 第五章 马特组Section Martiella
  • 5.1 茄病镰孢菌
  • 5.2 马特组讨论
  • 第六章 粉红组Section Roseum
  • 6.1 燕麦镰孢菌
  • 6.2 锐顶镰孢菌
  • 6.3 中华镰孢菌
  • 6.4 粉红组的讨论
  • 第七章 枝孢组Section Sporotrichiella
  • 7.1 梨孢镰孢菌
  • 7.2 拟枝孢镰孢
  • 7.3 九州镰孢菌
  • 7.4 枝孢组讨论
  • 第八章 直孢组Section Arthrosporiella
  • 8.1 半裸镰孢菌
  • 8.2 泡状镰孢菌
  • 8.3 唐山镰孢菌
  • 8.4 粉状镰孢菌
  • 8.5 直孢组镰孢菌遗传多样性研究
  • 第九章 膨孢组Section Gibbosum
  • 9.1 木贼镰孢菌
  • 9.2 藨草镰孢菌
  • 9.3 膨孢组和直孢组的讨论
  • 第十章 色变组Section Discolor
  • 10.1 多枝镰孢菌
  • 10.2 禾谷镰孢菌
  • 10.3 柔毛镰孢菌
  • 10.4 库鲁克威尔镰孢
  • 10.5 色变组讨论
  • 第十一章 总结与讨论
  • 11.1 我国禾本科作物上镰孢菌分类研究的总结与讨论
  • 11.1.1 初步调查了我国25个省市自治区的禾本科作物上的镰孢菌
  • 11.1.2 对直孢组镰孢菌进行了遗传多样性的分析
  • 11.1.3 对禾谷镰孢菌进行遗传多样性分析
  • 11.1.4 我国镰孢菌分类中存在的问题
  • 11.2 对Fusarium分类研究方法的总结与讨论
  • 11.2.1 培养条件的影响
  • 11.2.2 形态特征
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录
  • 攻读学位论文期间发表文章
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  

    中国禾本科作物上镰孢菌属真菌分类的研究
    下载Doc文档

    猜你喜欢