论文摘要
桃拉综合征病毒的分子流行病学桃拉综合征病毒（Taura syndrome virus，TSV）是引起全球对虾尤其是凡纳滨对虾（Penaeus vannami）急性传染病的病原之一，近年来经常在我国引发虾病。但到目前为止，中国很少做过TSV的流行病学调查。采集漳州、厦门、深圳、阳江、宁波、广州、海口7个地区31个养殖场的对虾共310尾，以RT-PCR技术检测TSV。结果310尾对虾中有166尾感染TSV，阳性率达到53.5％。各地凡纳滨对虾感染TSV的阳性率分别为100％（漳州）、97％（厦门）、33.3％（深圳）、40.7％（阳江）、50％（宁波）、40％（广州），表明凡纳滨对虾在各地均有一定比例感染TSV。用Southern blot杂交和测序验证RT-PCR反应的特异性。克隆测序的结果通过Blast与Genbank中的序列进行比对，各地TSV分离株231bp核苷酸同源性为98.7～100％，将这些序列绘制成基因树，与已发表的序列比较，显示：美国分离株HI94、墨西哥分离株MX1、台湾分离株TW1及巴西分离株BLZ01分布在一个分支上：越南株（YN1）与本次测序的21个中国大陆株分布于另一分支上。这21个中国株聚集成群，与越南株形成并列的两个分支。而来自广州的5个分离株（GUZ2、GUZ16、GUZ25、GUZ29、GUZ31）又聚集成群与深圳的2个分离株（SZB4、SZB6）构成中国株的一个子分支。 桃拉综合征病毒中国株的全基因测序及分析设计8对引物分片段扩增桃拉综合征病毒中国分离株ZHZC3全基因组，病毒两末端序列采用末端快速扩增方法（RACE）获取。扩增产物克隆到DMD18-T载体并测序，用DNAstar软件拼接全序列及同源性比较。结果显示ZHZC3全序列除去3’ poly（A）尾，由10202个碱基组成，有两个开放阅读框，分别编码2107和1011个氨基酸的聚蛋白。与美国参考株HI94相比，在编码区没有核苷酸的缺失和插入，但在5’ UTR缺失3个A，两者整体核酸同源性达97.9％。ORF1中ZHZC3与HI94及巴西株（BLZ01）的核酸同源性分别为97.6％、97.7％，在ORF2中ZHZC3与HI94、BLZ01的核酸同源性则分别为98.3、97％。与国外株ORF2的部分序列比较发现：ZHZC3和中国台湾株均与美国株HI94同源性最高。克隆分析6株TSV中国大陆株主要结构蛋白CP2基因，发现其编码的氨基酸存在三个高变区，中国大陆株更有其独特的氨基酸变异模式，312（S），449（A），451 Q)和468（H）。表明该病毒的整体变异性不高，但中国的流行株已形成其自己的遗传演变特征。在此基础上，利
论文目录
相关论文文献
- [1].血清HE4、CP2检测对子宫内膜癌患者临床病理分子、肿瘤组织中增殖分子表达的评估价值[J]. 海南医学院学报 2016(13)
- [2].子宫内膜癌患者血清HE4、CP2、HCgp-39含量与肿瘤恶性程度的关系探究[J]. 海南医学院学报 2017(04)
- [3].桃拉综合征病毒CP2蛋白的克隆表达及其结合肽的噬菌体肽库筛选[J]. 中国免疫学杂志 2013(11)
- [4].中兴谋上市欲接盘广汽CP2[J]. 商场现代化 2012(35)
- [5].武钢三硅钢CP1、CP2机组炉壳制作[J]. 企业导报 2010(10)
- [6].转录因子CP2在结直肠癌中的表达及临床意义[J]. 重庆医学 2019(10)
- [7].2008款雅阁CP2车VSA和ABS故障灯异常点亮[J]. 汽车维护与修理 2012(08)