凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性分析

论文摘要

凡纳滨对虾（Li topenaeus vannamei）又称南美白对虾,1987年引入我国,在相继攻克了集约化养殖和全人工繁育技术后已在我国实现了规模化养殖。但近几年来,各种虾类疾病相继入侵,使我国的凡纳滨对虾产业遭受了严重的打击,损失惨重。究其原因,与凡纳滨对虾的种质退化不无关系。鉴于此,本研究采用较为成熟的多元分析法和微卫星分子标记法,研究我国不同地域的凡纳滨对虾群体的形态多样性和分子遗传多样性,为凡纳滨对虾优良品种的选育提供理论依据。运用3种多元分析方法对6个不同地理群体凡纳滨对虾的形态差异进行了研究,聚类分析显示广东和厦门的群体形态较为接近,而与浙江、海南三亚（盐度10、70）的差异程度较大,渤海湾捕捞的野生凡纳滨对虾与另外5个群体欧氏距离最远；主成分分析构建了4个主成分,主成分贡献率为1：28.96%,主成分2贡献率为：18.22%,主成分3贡献率为：14.89%,主成分4贡献率为：10.51%,累计贡献率72.58%；判别分析结果,判别准确率P1为76.7%～96.6%,判别准确率P2为82.3%～100%,综合判别准确率为88.3%。虽然6个凡纳滨对虾群体在形态上已有一定程度的差异,主要表现在头胸甲部的性状上,但所有差异均未达到亚种水平。采用5对微卫星引物分析了凡纳滨对虾5个群体的遗传多样性。结果表明：每个位点的等位基因数在3～15个之间。5个位点在5个群体中PIC值的范围是0.625～0.915,均大于0.500,都表现出高度的多态性,其中厦门群体的PIC值最高为0.75,广东、浙江两个群体的PIC平均值最低,均为0.73。5个群体的平均期望杂合度（He）分别为0.56、0.46、0.48、0.59、0.47；平均观察杂合度（Ho）分别为0.45、0.51、0.45、0.53、0.37。除了厦门（XM）群体观察杂合度比期望杂合度高以外,其余四个群体的观察杂合度均低于期望杂合度。在25个位点中有17个位点偏离Hardy-weinberg平衡（D<0）。群体间遗传相似性系数、遗传距离及popgene聚类分析表明海南和浙江群体遗传相关最大,而浙江和广东群体遗传相关最小。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 1 前言
• 1.1 凡纳滨对虾简介
• 1.1.1 凡纳滨对虾的生物学
• 1.1.2 生活习性
• 1.1.3 繁殖
• 1.1.4 疾病
• 1.1.5 营养价值
• 1.1.6 养殖现状
• 1.2 对虾遗传多样性研究概况
• 1.2.1 遗传标记的定义与分类
• 1.2.2 形态多样性
• 1.2.3 分子遗传多样性
• 1.3 本文的研究目的与意义
• 2 凡纳滨对虾6群体的形态差异分析
• 2.1 材料和方法
• 2.1.1 实验材料
• 2.1.2 形态学指标的测定
• 2.1.3 数据处理
• 2.2 实验结果
• 2.2.1 聚类结果
• 2.2.2 主成分分析
• 2.2.3 判别分析
• 2.2.4 差异系数（CD）检验
• 2.3 讨论
• 2.3.1 6群体形态差异比较分析
• 2.3.2 三种多元分析方法在凡纳滨对虾形态判别上的应用
• 3 凡纳滨对虾5群体的微卫星DNA多态性分析
• 3.1 前言
• 3.2 材料和方法
• 3.2.1 实验材料
• 3.2.2 药品与仪器
• 3.3 实验结果
• 3.3.1 凡纳滨对虾基因组DNA的提取
• 3.3.2 凡纳滨对虾PCR扩增结果
• 3.3.3 PCR、聚丙烯酰胺电泳分析
• 3.3.4 遗传多样性分析
• 3.3.5 群体遗传变异分析
• 3.4 讨论
• 4 结论
• 4.1 形态学分析
• 4.2 分子标记分析
• 5 展望
• 6 参考文献
• 7 攻读硕士学位期间发表论文情况
• 8 致谢