从线粒体细胞色素b基因推测雪鸡属的系统进化关系

从线粒体细胞色素b基因推测雪鸡属的系统进化关系

论文摘要

用雪鸡属(Tetraogallus)及其5个近缘种属的线粒体细胞色素b(mtDNA cyto-b)基因并通过邻接(NJ)法构建了它们的系统进化树,以马鸡属(Crossoptilon)为外群(Out group),研究了雪鸡属在近缘属中的进化位置和关系,以及它的进化历程。结果表明:日本鹌鹑(Coturnix Japonica)和蓝胸鹌鹑(Coturnix Chinensis)的BP(bootstrap percentage)值为92%,阿尔泰雪鸡(T.altaicus)和喜玛拉雅雪鸡(T.himalayensis)的BP值为100%,(阿尔泰雪鸡、喜玛拉雅雪鸡)和藏雪鸡(T.tibetanus)的BP值为100%;石鸡属(Alectoris)、鹌鹑属(Coturnix)、雪鸡属和勺鸡属(Pucrasia)组成一个单系群;石鸡属和鹌鹑属的共同祖先与雪鸡属的祖先是姐妹群。各属总的平均遗传距离为0.112,雪鸡属的平均遗传距离为0.042。雪鸡属各种间的遗传距离依次为:阿尔泰雪鸡到喜玛拉雅雪鸡为0.012,喜玛拉雅雪鸡到藏雪鸡为0.067,阿尔泰雪鸡到藏雪鸡为0.068。结合雪鸡属各品种间的遗传距离、分布特征和形态特征,推测藏雪鸡很可能是这三种雪鸡品种中最为原始的品种,并且在1.7百万年前,栖息在新疆西南部和西藏中西部的体色较深的藏雪鸡亚种tibetanus向西进入喜玛拉雅山区,逐步演变成喜玛拉雅雪鸡。后来,常出现在阿尔泰山区和东昆仑山的体色较浅的喜玛拉雅雪鸡亚种koslowi进化成了阿尔泰雪鸡。里海雪鸡(T.caspius)和高加索雪鸡(T.caucasicus)的采样受地域限制,所以本课题未涉及它们的系统进化地位。因此,要完全明白所有雪鸡品种的分类地位则需要更为进一步的调查和研究。但同时,我们能根据雪鸡属成员的分布范围和形态特征给出这样一个假说,藏雪鸡是雪鸡属所有成员中最为原始的品种,高加索雪鸡起源于阿尔泰雪鸡,里海雪鸡则起源于喜玛拉雅雪鸡。

论文目录

  • 中英文对照词表
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一部分 文献综述
  • 1 生物多样性与遗传多样性
  • 2 生物遗传多样性研究概况
  • 2.1 生物的分子进化
  • 2.2 分子进化研究中的主要分子标记
  • 3 生物线粒体DNA的进化研究
  • 3.1 线粒体及线粒体DNA的特点
  • 3.2 线粒体DNA的D-Loop区及其他区域
  • 3.3 mtDNA遗传多态性的研究方法
  • 4 鸡形目鸟类及家鸡的系统进化研究
  • 第二部分 实验研究
  • 1 实验材料
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 仪器设备
  • 2. 实验方法
  • 2.1 实验样品的采集
  • 2.2 总DNA 提取
  • 2.3 聚合酶链式反应
  • 2.4 PCR 产物纯化和测序
  • 2.5 序列分析以及系统进化树的构建
  • 3 结果和讨论
  • 3.1 实验结果
  • 3.2 讨论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 论文导师评阅表
  • 学位论文英文版(English Version)
  • 相关论文文献

    • [1].西藏 寺院的鸟[J]. 森林与人类 2020(05)
    • [2].青海藏雪鸡的资源情况及其利用[J]. 畜牧与兽医 2009(08)
    • [3].地方良种——腾冲雪鸡[J]. 农村百事通 2013(09)
    • [4].雪鸡属分类地位探讨[J]. 动物分类学报 2009(01)
    • [5].雪鸡的外貌特征观察及生长发育规律初报[J]. 畜禽业 2008(08)

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