尚艳杰:嗜尸性蝇类线粒体基因组结构特点与系统发育分析研究论文

尚艳杰:嗜尸性蝇类线粒体基因组结构特点与系统发育分析研究论文

本文主要研究内容

作者尚艳杰,任立品,陈威,王世雯,阳力,郭亚东(2019)在《嗜尸性蝇类线粒体基因组结构特点与系统发育分析研究》一文中研究指出:法医昆虫学可为腐败尸体死后间隔时间(PMImin)推断提供重要价值和线索,其中双翅目(Diptera)蝇类是尸体腐败进展中最为常见的嗜尸性昆虫,尤其是丽蝇科(Calliphoridae)、麻蝇科(Sarcophagidae)和家蝇科(Muscidae)等在实践工作及科学研究中被广泛关注。快速、准确的种类鉴定是利用嗜尸性蝇类进行PMI推断的首要环节,由于传统上利用形态学方法对嗜尸性蝇类进行物种鉴定时受到鉴定要点极为复杂多变、一般只能对雄性成虫鉴定等诸多限制,近年来,DNA分子鉴定作为形态学鉴定方法的补充手段,被越来越多的法医昆虫学研究者所接受。昆虫的线粒体基因具有母系遗传特征,保守性较强,相对缺乏广泛的重组、重排现象,相对于核基因组具有更快的进化速度和突变率,已广泛用于系统发育学和分类学研究,以前的研究表明,相比单个基因片段,完整的线粒体基因组可明显提高进化分析的效力以及物种分类的准确性,尤其对于近缘种群。因此,在本项研究中,首先笔者对本课题组以及当前Genbank数据库中已有全线粒体基因组的嗜尸性蝇类进行了统计分析,然后以酱亚麻蝇为例,对常见嗜尸性蝇类的线粒体基因组结构特点进行了分析,最后以线粒体全基因组(13个蛋白质编码基因PCGs)作为分子标记,采用最大似然法maximum likelihood(ML)和贝叶斯法Bayesian inference(BI)构建系统发育树,对常见嗜尸性蝇类的进化关系和系统发育进行分析。结果表明:①已有全线粒体基因组的嗜尸性蝇类包括有23个丽蝇,18个麻蝇,15个蝇科,1个蚤蝇科,1个果蝇科。②以酱亚麻蝇为例,常见嗜尸性蝇类的线粒体基因组结构均为环形双链结构,有37个基因(包括13个蛋白编码基因,22个tRNAs及2个rRNAs)和一个AT富集区组成,其中9个蛋白编码基因和14个tRNAs由H-strand所编码,余下的4个蛋白编码基因、8个tRNAs及2个rRNAs由L-strand所编码,线粒体基因组结构特征如图1所示,22个tRNAs的结构如图2所示。③系统发育分析表明,58个嗜尸性蝇类按照不同属种分别聚类,共5个科,12个亚科,其中丽蝇科中,丽蝇亚科同金蝇亚科、伏蝇亚科互为姐妹群,麻蝇科中,麻蝇亚科同蜂麻蝇亚科、野蝇亚科互为姐妹群,蝇科中,点蝇亚科同邻家蝇亚科、家蝇亚科、圆蝇亚科互为姐妹群。

Abstract

fa yi kun chong xue ke wei fu bai shi ti si hou jian ge shi jian (PMImin)tui duan di gong chong yao jia zhi he xian suo ,ji zhong shuang chi mu (Diptera)ying lei shi shi ti fu bai jin zhan zhong zui wei chang jian de shi shi xing kun chong ,you ji shi li ying ke (Calliphoridae)、ma ying ke (Sarcophagidae)he jia ying ke (Muscidae)deng zai shi jian gong zuo ji ke xue yan jiu zhong bei an fan guan zhu 。kuai su 、zhun que de chong lei jian ding shi li yong shi shi xing ying lei jin hang PMItui duan de shou yao huan jie ,you yu chuan tong shang li yong xing tai xue fang fa dui shi shi xing ying lei jin hang wu chong jian ding shi shou dao jian ding yao dian ji wei fu za duo bian 、yi ban zhi neng dui xiong xing cheng chong jian ding deng zhu duo xian zhi ,jin nian lai ,DNAfen zi jian ding zuo wei xing tai xue jian ding fang fa de bu chong shou duan ,bei yue lai yue duo de fa yi kun chong xue yan jiu zhe suo jie shou 。kun chong de xian li ti ji yin ju you mu ji wei chuan te zheng ,bao shou xing jiao jiang ,xiang dui que fa an fan de chong zu 、chong pai xian xiang ,xiang dui yu he ji yin zu ju you geng kuai de jin hua su du he tu bian lv ,yi an fan yong yu ji tong fa yo xue he fen lei xue yan jiu ,yi qian de yan jiu biao ming ,xiang bi chan ge ji yin pian duan ,wan zheng de xian li ti ji yin zu ke ming xian di gao jin hua fen xi de xiao li yi ji wu chong fen lei de zhun que xing ,you ji dui yu jin yuan chong qun 。yin ci ,zai ben xiang yan jiu zhong ,shou xian bi zhe dui ben ke ti zu yi ji dang qian Genbankshu ju ku zhong yi you quan xian li ti ji yin zu de shi shi xing ying lei jin hang le tong ji fen xi ,ran hou yi jiang ya ma ying wei li ,dui chang jian shi shi xing ying lei de xian li ti ji yin zu jie gou te dian jin hang le fen xi ,zui hou yi xian li ti quan ji yin zu (13ge dan bai zhi bian ma ji yin PCGs)zuo wei fen zi biao ji ,cai yong zui da shi ran fa maximum likelihood(ML)he bei xie si fa Bayesian inference(BI)gou jian ji tong fa yo shu ,dui chang jian shi shi xing ying lei de jin hua guan ji he ji tong fa yo jin hang fen xi 。jie guo biao ming :①yi you quan xian li ti ji yin zu de shi shi xing ying lei bao gua you 23ge li ying ,18ge ma ying ,15ge ying ke ,1ge zao ying ke ,1ge guo ying ke 。②yi jiang ya ma ying wei li ,chang jian shi shi xing ying lei de xian li ti ji yin zu jie gou jun wei huan xing shuang lian jie gou ,you 37ge ji yin (bao gua 13ge dan bai bian ma ji yin ,22ge tRNAsji 2ge rRNAs)he yi ge ATfu ji ou zu cheng ,ji zhong 9ge dan bai bian ma ji yin he 14ge tRNAsyou H-strandsuo bian ma ,yu xia de 4ge dan bai bian ma ji yin 、8ge tRNAsji 2ge rRNAsyou L-strandsuo bian ma ,xian li ti ji yin zu jie gou te zheng ru tu 1suo shi ,22ge tRNAsde jie gou ru tu 2suo shi 。③ji tong fa yo fen xi biao ming ,58ge shi shi xing ying lei an zhao bu tong shu chong fen bie ju lei ,gong 5ge ke ,12ge ya ke ,ji zhong li ying ke zhong ,li ying ya ke tong jin ying ya ke 、fu ying ya ke hu wei jie mei qun ,ma ying ke zhong ,ma ying ya ke tong feng ma ying ya ke 、ye ying ya ke hu wei jie mei qun ,ying ke zhong ,dian ying ya ke tong lin jia ying ya ke 、jia ying ya ke 、yuan ying ya ke hu wei jie mei qun 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自华中昆虫研究的尚艳杰,任立品,陈威,王世雯,阳力,郭亚东,发表于刊物华中昆虫研究2019年00期论文,是一篇关于嗜尸性蝇类论文,线粒体基因组论文,系统发育论文,华中昆虫研究2019年00期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自华中昆虫研究2019年00期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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