菌床养猪中主要细菌的分离鉴定

论文摘要

本课题从四川川安有限公司的菌床养猪场的养殖垫料中分离筛选出6株细菌,分别定名为X1、X2、X3、X4、X5、X6。先通过外观和实验对其形态学和理化等特征进行初步鉴定,再通过PCR测序进行分子鉴定,判定其种属。经鉴定,X1为沙雷氏菌属(Serratia);X2为假单胞菌属(Pseudomonas); X3为节杆菌属(Arthrobacter);X4为绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa) ;X5为芽孢杆菌属(Bacillus);X6为埃希氏菌属(Escherichia)。通过分子鉴定,可以判定到种的是:X1为粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens);X3为黄色节杆菌(Arthrobacter flavescens);X4为绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa);X5为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis);X6为大肠埃希氏菌(Escherichia coli)。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1. 实验材料与方法
• 1.1 实验材料
• 1.1.1 取样地
• 1.1.2 取样记录
• 1.1.3 取样方法
• 1.2 主要菌的培养
• 1.2.1 选菌、分菌及养菌
• 1.2.2 菌种纯化
• 1.2.3 保存菌种
• 1.3 菌种的形态特征
• 1.3.1 群体形态特征
• 1.3.2 个体形态特征
• 1.4 菌种的生理生化特征
• 1.4.1 糖发酵试验
• 1.4.2 甲基红试验（M.R）
• 1.4.3 甲基乙酰甲醇试验（V.P）
• 1.4.4 氧化酶鉴定
• 1.4.5 吲哚试验
• 1.4.6 接触酶鉴定
• 1.5 菌种的分子鉴定
• 1.5.1 细菌的培养
• 1.5.2 DNA 的提取与纯化
• 1.5.3 16SrDNA 的 PCR 扩增
• 1.5.4 PCR 产物胶回收纯化
• 1.5.5 PCR 扩增产物的检测
• 1.5.6 PCR 产物的克隆
• 1.5.7 重组质粒的 PCR 产物测序
• 1.5.8 16SrDNA 的基因序列分析
• 2. 形态学实验结果
• 2.1 筛选分离结果
• 2.2 形态特征
• 2.2.1 群体形态特征
• 2.2.2 个体形态特征
• 3. 生理生化实验结果
• 3.1 接触酶鉴定结果
• 3.2 糖发酵试验结果
• 3.3 吲哚试验结果
• 3.4 V.P（甲基乙酰甲醇）试验结果
• 3.5 M.R（甲基红）试验结果
• 3.6 氧化酶鉴定结果
• 4. 分子鉴定结果
• 4.1 PCR 检测结果
• 4.2 16SrDNA 测序结果分析
• 4.2.1 16SrDNA 部分序列
• 4.2.2 序列与 GenBank 数据库对比分析
• 4.2.3 进化树分析
• 5. 讨论分析
• 5.1 细菌的鉴定依据
• 5.2 鉴定结果
• 6. 文献综述
• 6.1 菌床养猪的原理
• 6.2 菌床养猪中微生物的作用机制
• 6.2.1 微生物在菌床养殖中的作用机制
• 6.2.2 菌床养猪的微生物学理论
• 6.3 菌床养猪与传统养殖的不同及其特点
• 6.3.1 与传统养殖的不同
• 6.3.2 菌床养猪的特点
• 6.4 畜禽养殖环境污染现状
• 6.5 畜禽养殖污染所带来的危害
• 6.5.1 危害大气环境
• 6.5.2 危害水体环境
• 6.5.3 危害农田环境
• 6.5.4 危害公共卫生安全
• 6.6 菌床养猪中主要细菌研究的意义和发展前景
• 6.7 国内外研究现状分析
• 6.7.1 国外研究现状
• 6.7.2 国内研究现状
• 6.8 细菌鉴定方法的发展
• 6.8.1 传统鉴定方法
• 6.8.2 分子生物学方法
• 参考文献
• 致谢