许靖诗:杏RPW8基因家族鉴定与表达量分析论文

许靖诗:杏RPW8基因家族鉴定与表达量分析论文

本文主要研究内容

作者许靖诗,王广军,额尔敦达来,乌云塔娜(2019)在《杏RPW8基因家族鉴定与表达量分析》一文中研究指出:RPW8(Resistance to powdery mildew 8)不但对拟南芥白粉菌有抗性作用,同时也对烟草白粉菌、拟南芥霜霉菌和烟草花叶病毒等多种植物寄生性病原体都表现出较高的抗性,具有广谱抗病性。以杏全基因组数据为基础,鉴定RPW8家族成员,分析基因家族特点及不同组织中表达量分析,有利于更加深入了解RPW8基因家族功能,为杏抗白粉病基因挖掘和抗白粉病育种提供理论参考。通过SMS、GSDS2.0、Expasy-protparam、MEME、MAGA6.0、TBtool等生物信息学工具对RPW8基因家族的核酸序列的特征、基因结构、蛋白质理化性质、蛋白保守结构域、家族系统进化关系、表达量等进行分析和预测。结果表明:从杏中共鉴定出16个RPW8家族基因,分别命名为LWMRPW8-1~LWMRPW8-16,内含子数量小于6个,16个基因的全长为360~4 864 bp,碱基G+C含量为37.39%~46.89%,碱基A+T的含量为53.11%~62.61%;杏RPW8基因家族编码的氨基酸分子量为13 653.93~92 617.92 Da,理论等电点为5.42~9.47,蛋白质不稳定性指数为22.94~61.18,氨基酸组成成分以亮氨酸(Leu)赖氨酸(Lys)为主;保守结构域分析结果显示杏RPW8家族主要含有10个Motify,其中Motif8、Motif9为特征结构域;系统进化树分析显示,蔷薇科植物RPW8家族基因聚为一类,LWMRPW8-7与拟南芥、杨树基因聚为一类。对杏RPW8基因在不同组织中的表达分析结果显示,16个基因在花、花芽、叶片、果肉、果仁中的表达量呈现较大差异。

Abstract

RPW8(Resistance to powdery mildew 8)bu dan dui ni na gai bai fen jun you kang xing zuo yong ,tong shi ye dui yan cao bai fen jun 、ni na gai shuang mei jun he yan cao hua xie bing du deng duo chong zhi wu ji sheng xing bing yuan ti dou biao xian chu jiao gao de kang xing ,ju you an pu kang bing xing 。yi xing quan ji yin zu shu ju wei ji chu ,jian ding RPW8jia zu cheng yuan ,fen xi ji yin jia zu te dian ji bu tong zu zhi zhong biao da liang fen xi ,you li yu geng jia shen ru le jie RPW8ji yin jia zu gong neng ,wei xing kang bai fen bing ji yin wa jue he kang bai fen bing yo chong di gong li lun can kao 。tong guo SMS、GSDS2.0、Expasy-protparam、MEME、MAGA6.0、TBtooldeng sheng wu xin xi xue gong ju dui RPW8ji yin jia zu de he suan xu lie de te zheng 、ji yin jie gou 、dan bai zhi li hua xing zhi 、dan bai bao shou jie gou yu 、jia zu ji tong jin hua guan ji 、biao da liang deng jin hang fen xi he yu ce 。jie guo biao ming :cong xing zhong gong jian ding chu 16ge RPW8jia zu ji yin ,fen bie ming ming wei LWMRPW8-1~LWMRPW8-16,nei han zi shu liang xiao yu 6ge ,16ge ji yin de quan chang wei 360~4 864 bp,jian ji G+Chan liang wei 37.39%~46.89%,jian ji A+Tde han liang wei 53.11%~62.61%;xing RPW8ji yin jia zu bian ma de an ji suan fen zi liang wei 13 653.93~92 617.92 Da,li lun deng dian dian wei 5.42~9.47,dan bai zhi bu wen ding xing zhi shu wei 22.94~61.18,an ji suan zu cheng cheng fen yi liang an suan (Leu)lai an suan (Lys)wei zhu ;bao shou jie gou yu fen xi jie guo xian shi xing RPW8jia zu zhu yao han you 10ge Motify,ji zhong Motif8、Motif9wei te zheng jie gou yu ;ji tong jin hua shu fen xi xian shi ,qiang wei ke zhi wu RPW8jia zu ji yin ju wei yi lei ,LWMRPW8-7yu ni na gai 、yang shu ji yin ju wei yi lei 。dui xing RPW8ji yin zai bu tong zu zhi zhong de biao da fen xi jie guo xian shi ,16ge ji yin zai hua 、hua ya 、xie pian 、guo rou 、guo ren zhong de biao da liang cheng xian jiao da cha yi 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中南林业科技大学学报的许靖诗,王广军,额尔敦达来,乌云塔娜,发表于刊物中南林业科技大学学报2019年10期论文,是一篇关于基因家族论文,表达量论文,中南林业科技大学学报2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中南林业科技大学学报2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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