HIV-1 Vpr激活细胞NF-κB信号通路分子机制的研究

HIV-1 Vpr激活细胞NF-κB信号通路分子机制的研究

论文摘要

Vpr是由人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)编码的辅助蛋白。Vpr蛋白在病毒感染晚期表达,通过与Gagp6直接相互作用被包装到病毒颗粒中。Vpr在HIV-1复制及致病性等方面发挥重要作用,特别是能够在病毒感染早期改变细胞环境,使之有利于病毒复制。vpr基因的缺失会导致病毒复制能力显著下降。Vpr具有多种功能,包括可调节细胞NF-κB在内的多条信号通路,但Vpr对NF-κB信号通路的确切作用及其中的分子机制尚不明确。本文对Vpr与NF-κB信号通路的关系展开研究,获得相关实验数据如下:1.证实Vpr可同时激活NF-kB经典和非经典信号通路:发现在HIV-1感染早期,病毒颗粒包装的Vpr能增强IκBα的磷酸化;同时,Vpr可以促进p65磷酸化及入核并最终激活NF-κB报告基因;过表达Vpr及病毒颗粒携带的Vpr均能引起p100的磷酸化,促进p100剪切为p52,从而活化非经典通路。2.Vpr与NF-κB经典和非经典信号通路上游的IKKα和IKKβ存在相互作用,并调节二者的磷酸化;利用RNA干扰技术下调细胞内源p65、RelB、IKKα及IKKP的表达,发现Vpr对NF-κB信号通路的激活作用明显减弱。3.通过免疫共沉淀实验对IKK复合物上游关键调节因子的筛选,发现Vpr与TRAF6及TAK1在体内存在相互作用,不与TRAF2及TAB1相互作用。但Vpr并不能影响TRAF6的自身泛素化。过表达和病毒感染两个层面均证实Vpr可在多种细胞中增强TAK1第187位苏氨酸(Thr187)的磷酸化,导致底物蛋白IKKα、IKKβ及MKK7的磷酸化,进而活化下游信号通路;同时,Vpr对TAK1的磷酸化依赖于TAB1及TRAF6;此外,Vpr通过募集TAB3促进TAK1的泛素化。4.对Vpr活化NF-κB信号通路后对自身功能的影响进行初探:在NF-κB信号通路关键蛋白下调的细胞系中,检测Vpr对HIV-1LTR的激活作用,结果表明,Vpr介导的NF-κB活化促进了其对LTR的激活作用;进一步通过流式细胞术分析了Vpr在这些细胞系中诱导细胞周期G2/M期停滞的能力,初步证明NF-κB信号通路的激活有助于Vpr行使细胞周期停滞功能。综上所述,本文证实了HIV-1感染宿主细胞早期,Vpr能够激活细胞内NF-κB经典和非经典信号通路,并初步阐明其中的分子机制:Vpr一方面通过增强IKKα及IKKβ的磷酸化,另一方面通过结合并增强TAK1的活性,共同实现了“劫持”NF-κB信号通路的目的,并促进自身LTR的转录、引起细胞周期停滞在G2/M期,从而有利于病毒的复制。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 目录
  • 第一章 引言
  • 第一节 人类免疫缺陷病毒(HIV)简介
  • 1.1.1 HIV-1病毒颗粒概况
  • 1.1.2 HIV-1基因组结构及其功能
  • 1.1.2.1 长末端重复序列LTR
  • 1.1.2.2 结构基因及其产物
  • 1.1.2.3 调控基因及其产物
  • 1.1.2.4 辅助基因及其产物
  • 1.1.3 HIV-1基因表达调控
  • 1.1.3.1 宿主转录因子的调节
  • 1.1.3.2 细胞因子的调节
  • 1.1.3.3 自身编码蛋白的调节
  • 1.1.3.4 超感染病毒蛋白的调节
  • 1.1.3.5 表观遗传的调节
  • 第二节 Vpr蛋白研究进展
  • 1.2.1 Vpr蛋白概述
  • 1.2.2 Vpr蛋白的结构
  • 1.2.3 Vpr蛋白的功能
  • 2/M期停滞'>1.2.3.1 诱导细胞周期G2/M期停滞
  • 1.2.3.2 反式激活HIV-1 LTR及宿主基因的表达
  • 1.2.3.3 诱发细胞凋亡
  • 1.2.3.4 促进反转录过程的保真性
  • 1.2.3.5 促进前整合复合物入核
  • 第三节 NF-κB信号通路
  • 1.3.1 NF-κB信号通路的组成
  • 1.3.1.1 NF-κB因子
  • 1.3.1.2 IκB(NF-κB抑制蛋白)
  • 1.3.1.3 IKK(IκB kinase)
  • 1.3.2 NF-κB信号通路简介
  • 1.3.2.1 NF-κB经典通路
  • 1.3.2.2 NF-κB非经典通路
  • 1.3.2.3 NF-κB信号通路的负调节
  • 1.3.3 病毒与NF-κB信号通路的关系
  • 1.3.3.1 病毒激活NF-κB信号通路
  • 1.3.3.2 病毒抑制NF-κB信号通路
  • 第四节 AP-1信号通路
  • 1.4.1 转录因子AP-1
  • 1.4.2 AP-1信号通路简介
  • 1.4.3 病毒与AP-1信号通路的关系
  • 第五节 TAK1蛋白
  • 1.5.1 TAK1简介
  • 1.5.2 TAK1活性的调节
  • 1.5.2.1 TAK1的磷酸化
  • 1.5.2.2 TAK1的泛素化
  • 1.5.2.3 TAK1活性的负调节
  • 1.5.3 病毒与TAK1的关系
  • 第六节 本研究的目的和意义
  • 第二章 材料与方法
  • 第一节 实验材料
  • 2.1.1 细胞
  • 2.1.2 菌株
  • 2.1.3 质粒
  • 2.1.3.1 本文构建的质粒
  • 2.1.3.2 本文用到的其他质粒
  • 2.1.4 药物
  • 2.1.5 主要试剂
  • 2.1.5.1 克隆操作所用酶类及试剂
  • 2.1.5.2 抗体
  • 2.1.5.3 其他试剂
  • 第二节 实验方法
  • 2.2.1 基因操作
  • 2.2.1.1 引物设计及合成
  • 2.2.1.2 聚合酶链式反应(PCR)
  • 2.2.1.3 DNA的酶切和连接
  • 2.2.1.4 E.coli感受态细胞的制备和转化
  • 2.2.1.5 质粒DNA提取
  • 2.2.1.6 测序
  • 2.2.2 蛋白表达和包涵体分离
  • 2.2.3 多克隆抗体制备及效价测定
  • 2.2.3.1 免疫小鼠
  • 2.2.3.2 抗体效价测定
  • 2.2.3.3 抗血清收集
  • 2.2.4 细胞相关实验
  • 2.2.4.1 细胞培养
  • 2.2.4.2 细胞转染
  • 2.2.4.3 THP-1的诱导分化
  • 2.2.5 荧光素酶活性测定(Luciferase assay)
  • 2.2.6 免疫印迹(Western Blotting)
  • 2.2.6.1 细胞裂解液制备
  • 2.2.6.2 SDS-PAGE
  • 2.2.6.3 转膜
  • 2.2.6.4 杂交
  • 2.2.7 免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation,co-IP)
  • 2.2.8 免疫荧光分析(Immunofluorescence assay,IFA)
  • 2.2.8.1 IFA相关试剂
  • 2.2.8.2 IFA实验步骤
  • 2.2.9 流式细胞术(Fluorescence-Activated Cell Sorting,FACS)
  • 2.2.10 RNA干扰实验(RNAi)
  • 2.2.10.1 RNAi质粒的构建
  • 2.2.10.2 shRNA反转录病毒的包装
  • 2.2.10.3 稳定表达shRNA细胞系的构建
  • 2.2.11 病毒相关实验
  • 2.2.11.1 反转录病毒颗粒的制备
  • 2.2.11.2 HIV-1 p24抗原的检测
  • 2.2.11.3 病毒感染
  • 2.2.12 统计学分析
  • 第三章 结果与分析
  • 第一节 HIV-1 Vpr通过IKKα及IKKβ激活NF-κB信号通路
  • 3.1.1 HIV-1 Vpr激活细胞NF-κB经典通路
  • 3.1.1.1 Vpr能够激活NF-κB报告基因
  • 3.1.1.2 病毒颗粒携带的Vpr增强IκBα的磷酸化
  • 3.1.1.3 过表达Vpr引起IκBα的磷酸化
  • 3.1.1.4 Vpr促进p65的磷酸化及入核
  • 3.1.1.5 Vpr活化NF-κB信号通路需要p65的参与
  • 3.1.2 Vpr能够激活NF-κB非经典通路
  • 3.1.2.1 Vpr增强p100磷酸化
  • 3.1.2.2 Vpr促进p100的剪切
  • 3.1.2.3 Vpr活化NF-κB信号通路依赖细胞内源的RelB
  • 3.1.3 Vpr与IKKα和IKKβ存在相互作用并调节其激酶活性
  • 3.1.3.1 Vpr与IKKα和IKKβ存在相互作用
  • 3.1.3.2 Vpr增强IKKα和IKKβ的磷酸化
  • 3.1.3.3 IKKα和IKKβ是Vpr激活NF-κB信号通路的关键
  • 第二节 HIV-1 Vpr通过调节TAK1的活性激活NF-κB信号通路
  • 3.2.1 Vpr增强TAK1的磷酸化
  • 3.2.1.1 Vpr能激活AP-1报告基因
  • 3.2.1.2 Vpr促进TAK1 Thr187的磷酸化
  • 3.2.1.3 Vpr激活NF-κB/AP-1信号通路需要TAK1的磷酸化
  • 3.2.1.4 Vpr与TAK1而非TAB1存在相互作用
  • 3.2.1.5 Vpr对TAK1的磷酸化依赖于TAB1
  • 3.2.2 Vpr参与调节TAK1泛素化的初步研究
  • 3.2.2.1 Vpr增强TAK1的泛素化
  • 3.2.2.2 Vpr与TRAF6而非TRAF2相互作用
  • 3.2.2.3 Vpr不影响TRAF6的自身泛素化
  • 3.2.2.4 Vpr对TAK1的磷酸化依赖于TRAF6
  • 3.2.2.5 Vpr增强TAB3与TAK1的结合
  • 3.2.2.6 Vpr磷酸化TAK1需要TAK1被泛素化
  • 第三节 Vpr激活NF-κB信号通路对自身功能的影响
  • 3.3.1 Vpr点突变激活NF-κB及HIV-1 LTR的能力
  • 3.3.2 Vpr激活HIV-1 LTR依赖于NF-κB信号通路
  • 2/M期停滞的能力'>3.3.3 Vpr点突变诱导细胞周期G2/M期停滞的能力
  • 3.3.4 NF-κB信号通路的活化对Vpr行使细胞周期停滞功能的影响
  • 第四章 讨论
  • 第一节 Vpr可在病毒感染早期激活NF-κB信号通路
  • 第二节 Vpr通过调节IKK复合物的活性激活NF-κB信号通路
  • 第三节 Vpr可调节TAK1的活性
  • 第四节 Vpr介导NF-κB信号通路活化的效应
  • 4.4.1 Vpr活化NF-κB信号通路对病毒复制的影响
  • 4.4.2 Vpr活化NF-κB信号通路对细胞的影响
  • 第五章 结论与展望
  • 第一节 结论
  • 第二节 展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录 英文缩写
  • 个人简历
  • 在学期间发表的学术论文与研究成果
  • 相关论文文献

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